G1394067


Basic Information

Item Value
gene id G1394067
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 58424458 ~ 58428113 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1591975
ctcctgtcccctggttcctctctcaccaccctggtccctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggaccctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggtccctcccctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggaccctctcctgtctcctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgttccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgttccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgttccctggttcctctctctcatcaccctggtccctctcctgttccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgttccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgttccctggtccctctcctgttccctggcccctctcctgttccctggttcctctctctcaccaccctggACCCTCACCTGTCCCCTGGTTCCTTTCTCTCACCACCCTggtccctctcctgttccctggtccctctcctgttccctggtccctctcctgttccctggttcctctctctcaccaccctggaccctctcctgtcccctggtTCCTTTCTCTCACCACCctggtccctctcctgtcccctgttTCCACTCtgccagccctggtctctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgttccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgttccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgttccctggttcctctctctcatcaccctggtccctctcctgtcccctggtTCCTTTCTCTCACCACCCTGATCACTCTCCTGTCCCCTGGTTCCTCTCtgccagccctggtctctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggACCCTCACCTGTCCCCTGGTTCCTTTCTCTCAccaccctggttcctctctgccagccctggtctctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggaccctctcctgtcccctggtTCCTTTCTCTCACCACCctggtccctctcctgtcccctggtTCCTTTCTCTCACCACCCTGATCACTCTCCTGTCCCCTGGTTCCTTTCTCTCACCACCCTGATCACTCTCCTgtcccctggttcctctctctcaccaccctggTCCCGCTCCTGTCCCCTGGTTCCTCTCTGCCAGCCATGATCTTTCCCCTgtcccctggttcctctctcaccaccctggtccctctcctatcccctggttcctctctctcaccaccctggtccctcccctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggaccctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggaccctctcctgtcccctggttcctctctcaccaccctggtccctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggaccctctcctgtcccctggtTCCTTTCTCTCACCACCctggtccctctcctgtcccctggtGCCTTTCTCTCATCACCctggtccctctcctgtcccctggtTCCTTTCTCTCACCACCCTGATCACTCTCCTGTGCCCTGGTTCCTTTCTCTCACCACCCTGATCACTCTCCTgtcccctggttcctctctctcatcaccctggtccctctcctgtcccctggttcctctctctcaccaccctggtccctctcctgtcccctggttcctctctctcatcaccctggtccctctcctgtcccctg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1591975 True 1942 TUCP 0.62 3 58424458 58428113

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110492413 LOC106566757 coding downstream 29957 58366719 ~ 58394501 (-)
LOC110492410 LOC106566756 coding downstream 108814 58302511 ~ 58315644 (-)
LOC100136178 LOC100136178 coding downstream 188559 58229061 ~ 58235899 (-)
LOC110491122 LOC106566746 coding downstream 262378 58105100 ~ 58162080 (-)
LOC110492403 LOC106566745 coding downstream 326722 58093542 ~ 58097736 (-)
LOC110491123 LOC106566759 coding upstream 247625 58675738 ~ 58730339 (-)
LOC110491124 LOC106566606 coding upstream 408528 58836641 ~ 58847057 (-)
LOC110492419 LOC106566607 coding upstream 437436 58865549 ~ 58870791 (-)
LOC118939563 cf105 coding upstream 443636 58871749 ~ 58877502 (-)
LOC110492420 NA coding upstream 458563 58886676 ~ 58896965 (-)
G1394018 LOC106566755 non-coding downstream 68931 58329705 ~ 58355527 (-)
G1394005 NA non-coding downstream 129510 58294686 ~ 58294948 (-)
G1393995 LOC106571908 non-coding downstream 156323 58267779 ~ 58268135 (-)
G1393983 NA non-coding downstream 169397 58254842 ~ 58255061 (-)
G1393979 NA non-coding downstream 174013 58250142 ~ 58250445 (-)
G1394070 NA non-coding upstream 12944 58441057 ~ 58441816 (-)
G1394128 NA non-coding upstream 144323 58572436 ~ 58572717 (-)
G1394129 NA non-coding upstream 146589 58574702 ~ 58574912 (-)
G1394134 NA non-coding upstream 156095 58584208 ~ 58584480 (-)
G1394181 NA non-coding upstream 223803 58651916 ~ 58675565 (-)
G1393997 LOC106566752 other downstream 146031 58274028 ~ 58278427 (-)
G1393949 LOC105029132 other downstream 217293 58204759 ~ 58207165 (-)
LOC110492397 NA other downstream 531176 57887491 ~ 57893319 (-)
LOC110492394 psma7 other downstream 570672 57849674 ~ 57853907 (-)
G1394341 NA other upstream 318757 58746870 ~ 58747299 (-)
G1394768 LOC106566610 other upstream 683259 59111372 ~ 59112897 (-)
G1394978 LOC106566621 other upstream 926087 59354200 ~ 59356849 (-)
G1396467 NA other upstream 2126643 60554756 ~ 60582035 (-)

Expression


Co-expression Network