G1394696 (LOC106566609)


Basic Information

Item Value
gene id G1394696
gene name LOC106566609
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 58982821 ~ 58988799 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1592679
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>TU1592682
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Function

NR:

description
protein bicaudal D homolog 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1592679 False 5895 lncRNA 0.42 2 58982821 58988799
TU1592682 True 5937 lncRNA 0.42 2 58982821 58988799

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110492420 NA coding downstream 85856 58886676 ~ 58896965 (-)
LOC118939563 cf105 coding downstream 105319 58871749 ~ 58877502 (-)
LOC110492419 LOC106566607 coding downstream 112030 58865549 ~ 58870791 (-)
LOC110491124 LOC106566606 coding downstream 135764 58836641 ~ 58847057 (-)
LOC110491123 LOC106566759 coding downstream 252482 58675738 ~ 58730339 (-)
LOC118939564 NA coding upstream 31105 59019837 ~ 59051938 (-)
LOC110492425 LOC106566615 coding upstream 187135 59175934 ~ 59206144 (-)
plxnd1 LOC106566625 coding upstream 425213 59413470 ~ 59538798 (-)
LOC110492431 LOC106566626 coding upstream 552588 59541387 ~ 59640728 (-)
mrps25 mrps25 coding upstream 756577 59745376 ~ 59752581 (-)
G1394670 NA non-coding downstream 47624 58933041 ~ 58935197 (-)
G1394656 NA non-coding downstream 78248 58904325 ~ 58904573 (-)
G1394450 NA non-coding downstream 102964 58879387 ~ 58879857 (-)
G1394447 NA non-coding downstream 104542 58878052 ~ 58878279 (-)
G1394737 NA non-coding upstream 52050 59040849 ~ 59079877 (-)
G1394777 NA non-coding upstream 124655 59113454 ~ 59113981 (-)
G1394778 NA non-coding upstream 125295 59114094 ~ 59114533 (-)
G1394806 NA non-coding upstream 148162 59136961 ~ 59137258 (-)
G1394341 NA other downstream 235522 58746870 ~ 58747299 (-)
G1394067 NA other downstream 554708 58424458 ~ 58428113 (-)
LOC110492410 LOC106566756 other downstream 676180 58302511 ~ 58315644 (-)
G1393997 LOC106566752 other downstream 704394 58274028 ~ 58278427 (-)
G1394768 LOC106566610 other upstream 122573 59111372 ~ 59112897 (-)
G1394978 LOC106566621 other upstream 365401 59354200 ~ 59356849 (-)
G1396467 NA other upstream 1565957 60554756 ~ 60582035 (-)
LOC118939463 NA other upstream 1672757 60661556 ~ 60672085 (-)
G1396543 NA other upstream 1704810 60693609 ~ 60694036 (-)

Expression


Co-expression Network