G1398120


Basic Information

Item Value
gene id G1398120
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 61773041 ~ 61778102 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1596635
cagcctCCCACCCACCCTCAGACCattctgcaggtgaagaagccggatgtggaggtcctgggctcgtggtctgtggttgtgaggccggttggacattctgtcaaattctctaaaacaacattggaggcggcttatggtagagaaattaacattaaattatctggcaacagctctggtggacattattgcaatcagcatgccaattgaatgctccctcaaaacttgagacatctgtggcattgtgctgtgtgacaaaactacacattttatagtggctttttattgtccccagcacaaggtgcacctgtgtaatgatcatgctgtttaataatcATCTTGAtgtgtcacacctgtcaggtgtatggaaaatcttggcaaaggacaaatgctcactaacagggatgtaaacaaatgtgtgcacaaaatgtgagagaaataaatacattttttattttttatttcagctcatgaaacactttacatgttgtgtttatatttttgttcactgtcGTTTACTCCTTTCTGTTTCCCTATGACAGTGTAGAAGTAGTACCACAACCTGTCCAATAGATGGTAAGGTTCATGGCCTGTTCAAAGCACTGAAAATCTGGATTCTGTGATATTGTGGTAGCTGGATCAGAATGATCCTATTATTTTCTGAAAAAACAGCTCAAAAACGGACAGATTGATATAATCCCGATAGAAAAAAAGAGGATTATAGAATCCGTCTCTGATCCCCCCCTTTTGAAACCTgacccacacacatacatgtaactgccaaaataatggaagcacttgagtaaatgagggatacaaagtaaattgaaagcaggtgcttccacatagGTGTGGTTTCTGAGATAATTAAGCAGTTAACGTTCCATCATGGTTAGGGTTATGCATAAAAATGGTCGGCAGGCTACCATGGCTGGGCCCCATAGGatggatgacaatgcccccatccacatggcacaagtggtcactgaatggtttgatgagcatgaaaatgatgtaaaccatatgccatggccgtctcagtcaccagatctcaacccaatttaaCACTTAGGCccatgggagattctggagccaAGCCTAAAACAGTGTTTCCCACcaccaattcaattcaatgggctttattggcatgggaaacatgttaacattgccaaagcaagtgaggtagataatatataaaagtgaaataaacaataaaaattaacagtaaacagtaaattgtttcaaaacaataaagacattacaaacgtcatattacgtatatatacagtgttgcaacgatgtacaaatggttaagggtacacaagagaaaataaataagcataaatatgggtgtatttacaatggtgtttgttcttcactggttgcccttttcttgtggcaacgggtcacaaatcttgctgctgtgatgcacactgtggaatttcacccagtagatatgggagtttatcaaaattgggtttgttttcaaattctttgtagatctgtgtaatctgagggaaatatgtctctctaatatggtcttacattggacaggaggttaggaattgcagctcagtttccacctcattttgtgggcagtgtgcacatagcctgtcttctcttgaaagccatgtctgcctatggcggcctttctcaatggcaaggctatgctcactgagtctgtacatagtcaaagctatcaacaaaacaccaaattatggaaatTCTCTTTgtagaatggtgtcgcatccctccaaaaGAGTTACAGACACTAGTAGAATgtatgccaaggcacattgaagctgttctggctcgtggtggcacaATGCCCAATTTacacactttatgttggtgtttcctttattttggaagtTACCTGTATGTCGTATTGAATTGAAATCAGCTGGGTGATGATTTAGTCTGGCGATTATAATGTCTTGTTGGACAACTATGCCATAGTCTAGGTCTATGTCTACGTTATAACATGCCGATATAGAAGCGTATGAAGACAATTTGACTAGACTAGAGTGAGAAAAGGTGCAGAGCACGTGGTAGTAACTCCCTTGTCCGGGACAGTAGCTATTATTAGACTATAAACTAATCGGTCTACATTTCCACGGATGACGAATTCGCTATTTTGAATATATCAGTAGACCCACAATataagtaaaataaaaatgtcaaatatattGAAAGTTAAAAGCATCTTCAACTGTGAAATTTAAATGTACATAGATTTATTTGGTTGCTAATAGACTGGCCTACATGCGTACGTGAATTTATTTAAAACAAGGCTTCTACTGCTTTCTAGAACAGGAACACAGGCATGGAACGAGATTCAGCCCAGAACAGAGTCAATGGAGAGTCGTCGATGGCCTATGATGCCTGGGCAGCGCAGGGACTAAGTCGGTCTAAGTCTCCTAGCTGTCATAAGGTATAATATATAGGCCGAACTGAACTACCAAAACGGAATAAATGTTTATAAGCCCTTTGAGGATGTTAGGCCTAAAGGTAGGCTAGGTCTATTGTCAACGTTATAGTTCTTAATTCATCCATGCAACCTGACGGGAACTCTCCGTGGTCCTGAATAGGCCTCACTACTGAGGAACTAATAGGCAGAGTCCATCTCAATTTGTTACAGGTATCCCTACTACGGGATCTATCTAGAAGTAGCTTTTTTAACAGATATGCCTAATGTCTTGTGTTCCTTTATACCGGTAGGCCTATTTCACATAAACATTTCTCTGAAACCTTTCCCCTTTCCCAAAATCACCGACAATGAAATAATACATGCACCCTCAGCATTTATTTATTGGTTATATTGTACACAACATTCCAAGTGTATGCTACCCAGGCCAAGCATTGAAAATAGTTTCAAAAACGTgacattattaaaaaatatatatcagaaTTGATTTCCTTAACAACCACTTACCTGAGAGATCTCGACAATACTCTTTCAATAATTCAGAAACCTTCAAATTATATGTATCCTCTGATTTATTGGCTCCATCAAACATTATTATGCTATATATGATATTCAGTCTAAAAAGGTACTCTTTTGCCTGCTGCAAATGTATAATAAATTGTATATTTGATGTTGTTTTGTAGGCTATTGTTTTACAGCAAAACCTTTTTTTATATAGGCTGCATTTGAATGGACTAGGCTACTAGCATTTGTACAACCAAGCCAGTgatacattgttaatatggttcCTATAGGTGGCATTGACTCTTTAACTCATGACAAGGCGTAATGACGGTGACCTGACCATACAGGCCTCGGGAAGTCTAGAACAATATCTGTCATTTTAATTCACTTCATTCATTTGTTGTCAGTTGGGCTATTTGTGTAATATTTGGGGACTTTGTCAAGAATTTCTAAACAAGAAAGTTGCCCAAACGAATAGCAATATCTCATGACATGAAGGCTTAGCCTATGGATAGTTATAGGCTACATGAAATGCAAGGCAACGTTCTAAGAGACTCAGAAATAGTACAATTAATCAGTTATGGTCACTGTTGCCTGTCTTTGACAGCTCATTTGTGGGCATTTTTACTAGACGAAACTTAAAATATCTTTGATGAAATGCTATTTATAGCTCTAGATCCACACACATGCTAACTTTGCAGGCGACCTGTTTAAATGGGGAATATGTATATGTAGAGTATAGTTGGAAACATCTTTAGAGGGAACAATTTTGTTAATATAATTCATGTCTCCGGCTTGTGACGCAGACTGCTGGATATGGCAGGATGGCGCCTTTGCCTCATTGCGTTTCGATTAGCCTAGAGGCTACTTGTTTCAGTTGGAAAAATCGATCTATTTCAATTATACCATGAGTTATCTCGTTTGAATATAGGCCTAGCTGGTGTATTGAGCAATAGGCCTCCTTTAGTGGTGCCATGGAAGCGAGATAGACTAGCCTTGATATTGTAATTATATTTCTCTCATTTAAATGATCGAATTCATAATTCAGTCCAAAACCATTAAATCACCTACTCAATTAGACCTATTCCACTGTGCAAAAACGGGTTGAataaacgttgtttccacgtcatttcaacaacaacaaaaaacgtcaTCAACTTAAGAGAATTTCGTATTTTTTCTAACTTTTCACCTATTCAATGACaatgtgacattttttgttgatttcacgttgaattcatgttagttgacaactcgaCGTTGAAaggacgtctgtgcccagtgggatatttGATAATATACTTATGAAGGTGGTTCTAGTAGCCTAGTTCTGAATGTATCCAAAATAAGTGACATTTTCTCTGTACATGCAATTTTGGATATTGCCCTCATATTTATCCTACTAGTATTTCATTGATCTCCGATATTCACATGACAGCTGTGTGTTGAAATGTACGCATAGAAATGGTTGCGGTTACATCGATGCTTCATGACCACAGGGCCTTGCATAGCCAAGGAGCAGACCTGTTCCGTTCATTGAAATGTACCTACTCATTATTTGACTGGAGGTCAGATGTAATAGGTCTGGTTTCCCATTCAGTCTAGTAATAAACTAAACGCAGATCTGGTTTGGATATAGATATAAAATCTATGCATTTTCTAAGAGCCAGAAGCCACCAAAACCACCCACTACTTTACGCATTGCGCATGCACTCAGAAGAgtgaacacgcacgcacacacacacacaaacacaccctgtcATCCAAAACACACCCTGTCATCTCAACGCAAATATGATATTAATGGTCAGTATGAAAAGGTTTCGTTTCTGTCTTCAGCGCGTAATGGGGGTAGATTGAATGCCTATATCAGTGAACACGATGCTGTGTAGATTCCTCTCTTGGCATTCACCGCGTGCCTTAATTGTATGGACATTAAATCAAGGTCCGCTGTGAACACGCAGAGTGATAACCCTTCCTGATGACGCGCGCCCCAGCACGGATACAAGCACTGGTCACCCCCCGTGGATGCGAGCACTGCAATGTCGA
>TU1596634
GcacacccacttggcagccaggcccagccaatcagaatgagtttttctccacaaatgggatatattacagacagaaatactcctcagcctCCCACCCACCCTCAGACCattctgcaggtgaagaagccggatgtggaggtcctgggctcgtggtctgtggttgtgaggccggttggacattctgtcaaattctctaaaacaacattggaggcggcttatggtagagaaattaacattaaattatctggcaacagctctggtggacattattgcaatcagcatgccaattgaatgctccctcaaaacttgagacatctgtggcattgtgctgtgtgacaaaactacacattttatagtggctttttattgtccccagcacaaggtgcacctgtgtaatgatcatgctgtttaataatcATCTTGAtgtgtcacacctgtcaggtgtatggaaaatcttggcaaaggacaaatgctcactaacagggatgtaaacaaatgtgtgcacaaaatgtgagagaaataaatacattttttattttttatttcagctcatgaaacactttacatgttgtgtttatatttttgttcactgtcGTTTACTCCTTTCTGTTTCCCTATGACAGTGTAGAAGTAGTACCACAACCTGTCCAATAGATGGTAAGGTTCATGGCCTGTTCAAAGCACTGAAAATCTGGATTCTGTGATATTGTGGTAGCTGGATCAGAATGATCCTATTATTTTCTGAAAAAACAGCTCAAAAACGGACAGATTGATATAATCCCGATAGAAAAAAAGAGGATTATAGAATCCGTCTCTGATCCCCCCCTTTTGAAACCTgacccacacacatacatgtaactgccaaaataatggaagcacttgagtaaatgagggatacaaagtaaattgaaagcaggtgcttccacatagGTGTGGTTTCTGAGATAATTAAGCAGTTAACGTTCCATCATGGTTAGGGTTATGCATAAAAATGGTCGGCAGGCTACCATGGCTGGGCCCCATAGGatggatgacaatgcccccatccacatggcacaagtggtcactgaatggtttgatgagcatgaaaatgatgtaaaccatatgccatggccgtctcagtcaccagatctcaacccaatttaaCACTTAGGCccatgggagattctggagccaAGCCTAAAACAGTGTTTCCCACcaccaattcaattcaatgggctttattggcatgggaaacatgttaacattgccaaagcaagtgaggtagataatatataaaagtgaaataaacaataaaaattaacagtaaacagtaaattgtttcaaaacaataaagacattacaaacgtcatattacgtatatatacagtgttgcaacgatgtacaaatggttaagggtacacaagagaaaataaataagcataaatatgggtgtatttacaatggtgtttgttcttcactggttgcccttttcttgtggcaacgggtcacaaatcttgctgctgtgatgcacactgtggaatttcacccagtagatatgggagtttatcaaaattgggtttgttttcaaattctttgtagatctgtgtaatctgagggaaatatgtctctctaatatggtcttacattggacaggaggttaggaattgcagctcagtttccacctcattttgtgggcagtgtgcacatagcctgtcttctcttgaaagccatgtctgcctatggcggcctttctcaatggcaaggctatgctcactgagtctgtacatagtcaaagctatcaacaaaacaccaaattatggaaatTCTCTTTgtagaatggtgtcgcatccctccaaaaGAGTTACAGACACTAGTAGAATgtatgccaaggcacattgaagctgttctggctcgtggtggcacaATGCCCAATTTacacactttatgttggtgtttcctttattttggaagtTACCTGTATGTCGTATTGAATTGAAATCAGCTGGGTGATGATTTAGTCTGGCGATTATAATGTCTTGTTGGACAACTATGCCATAGTCTAGGTCTATGTCTACGTTATAACATGCCGATATAGAAGCGTATGAAGACAATTTGACTAGACTAGAGTGAGAAAAGGTGCAGAGCACGTGGTAGTAACTCCCTTGTCCGGGACAGTAGCTATTATTAGACTATAAACTAATCGGTCTACATTTCCACGGATGACGAATTCGCTATTTTGAATATATCAGTAGACCCACAATataagtaaaataaaaatgtcaaatatattGAAAGTTAAAAGCATCTTCAACTGTGAAATTTAAATGTACATAGATTTATTTGGTTGCTAATAGACTGGCCTACATGCGTACGTGAATTTATTTAAAACAAGGCTTCTACTGCTTTCTAGAACAGGAACACAGGCATGGAACGAGATTCAGCCCAGAACAGAGTCAATGGAGAGTCGTCGATGGCCTATGATGCCTGGGCAGCGCAGGGACTAAGTCGGTCTAAGTCTCCTAGCTGTCATAAGGTATAATATATAGGCCGAACTGAACTACCAAAACGGAATAAATGTTTATAAGCCCTTTGAGGATGTTAGGCCTAAAGGTAGGCTAGGTCTATTGTCAACGTTATAGTTCTTAATTCATCCATGCAACCTGACGGGAACTCTCCGTGGTCCTGAATAGGCCTCACTACTGAGGAACTAATAGGCAGAGTCCATCTCAATTTGTTACAGGTATCCCTACTACGGGATCTATCTAGAAGTAGCTTTTTTAACAGATATGCCTAATGTCTTGTGTTCCTTTATACCGGTAGGCCTATTTCACATAAACATTTCTCTGAAACCTTTCCCCTTTCCCAAAATCACCGACAATGAAATAATACATGCACCCTCAGCATTTATTTATTGGTTATATTGTACACAACATTCCAAGTGTATGCTACCCAGGCCAAGCATTGAAAATAGTTTCAAAAACGTgacattattaaaaaatatatatcagaaTTGATTTCCTTAACAACCACTTACCTGAGAGATCTCGACAATACTCTTTCAATAATTCAGAAACCTTCAAATTATATGTATCCTCTGATTTATTGGCTCCATCAAACATTATTATGCTATATATGATATTCAGTCTAAAAAGGTACTCTTTTGCCTGCTGCAAATGTATAATAAATTGTATATTTGATGTTGTTTTGTAGGCTATTGTTTTACAGCAAAACCTTTTTTTATATAGGCTGCATTTGAATGGACTAGGCTACTAGCATTTGTACAACCAAGCCAGTgatacattgttaatatggttcCTATAGGTGGCATTGACTCTTTAACTCATGACAAGGCGTAATGACGGTGACCTGACCATACAGGCCTCGGGAAGTCTAGAACAATATCTGTCATTTTAATTCACTTCATTCATTTGTTGTCAGTTGGGCTATTTGTGTAATATTTGGGGACTTTGTCAAGAATTTCTAAACAAGAAAGTTGCCCAAACGAATAGCAATATCTCATGACATGAAGGCTTAGCCTATGGATAGTTATAGGCTACATGAAATGCAAGGCAACGTTCTAAGAGACTCAGAAATAGTACAATTAATCAGTTATGGTCACTGTTGCCTGTCTTTGACAGCTCATTTGTGGGCATTTTTACTAGACGAAACTTAAAATATCTTTGATGAAATGCTATTTATAGCTCTAGATCCACACACATGCTAACTTTGCAGGCGACCTGTTTAAATGGGGAATATGTATATGTAGAGTATAGTTGGAAACATCTTTAGAGGGAACAATTTTGTTAATATAATTCATGTCTCCGGCTTGTGACGCAGACTGCTGGATATGGCAGGATGGCGCCTTTGCCTCATTGCGTTTCGATTAGCCTAGAGGCTACTTGTTTCAGTTGGAAAAATCGATCTATTTCAATTATACCATGAGTTATCTCGTTTGAATATAGGCCTAGCTGGTGTATTGAGCAATAGGCCTCCTTTAGTGGTGCCATGGAAGCGAGATAGACTAGCCTTGATATTGTAATTATATTTCTCTCATTTAAATGATCGAATTCATAATTCAGTCCAAAACCATTAAATCACCTACTCAATTAGACCTATTCCACTGTGCAAAAACGGGTTGAataaacgttgtttccacgtcatttcaacaacaacaaaaaacgtcaTCAACTTAAGAGAATTTCGTATTTTTTCTAACTTTTCACCTATTCAATGACaatgtgacattttttgttgatttcacgttgaattcatgttagttgacaactcgaCGTTGAAaggacgtctgtgcccagtgggatatttGATAATATACTTATGAAGGTGGTTCTAGTAGCCTAGTTCTGAATGTATCCAAAATAAGTGACATTTTCTCTGTACATGCAATTTTGGATATTGCCCTCATATTTATCCTACTAGTATTTCATTGATCTCCGATATTCACATGACAGCTGTGTGTTGAAATGTACGCATAGAAATGGTTGCGGTTACATCGATGCTTCATGACCACAGGGCCTTGCATAGCCAAGGAGCAGACCTGTTCCGTTCATTGAAATGTACCTACTCATTATTTGACTGGAGGTCAGATGTAATAGGTCTGGTTTCCCATTCAGTCTAGTAATAAACTAAACGCAGATCTGGTTTGGATATAGATATAAAATCTATGCATTTTCTAAGAGCCAGAAGCCACCAAAACCACCCACTACTTTACGCATTGCGCATGCACTCAGAAGAgtgaacacgcacgcacacacacacacaaacacaccctgtcATCCAAAACACACCCTGTCATCTCAACGCAAATATGATATTAATGGTCAGTATGAAAAGGTTTCGTTTCTGTCTTCAGCGCGTAATGGGGGTAGATTGAATGCCTATATCAGTGAACACGATGCTGT

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1596635 False 4978 lncRNA 0.39 1 61773041 61778018
TU1596634 True 4901 lncRNA 0.39 1 61773202 61778102

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110492507 LOC106566595 coding downstream 83962 61687247 ~ 61689079 (-)
LOC110492509 LOC106566095 coding downstream 171618 61595093 ~ 61601423 (-)
dnah12 dnah12 coding downstream 178220 61558700 ~ 61594821 (-)
asb14b LOC106566601 coding downstream 214619 61552330 ~ 61558422 (-)
LOC110492491 LOC106566602 coding downstream 221287 61525712 ~ 61551754 (-)
LOC110492496 LOC106566592 coding upstream 1016 61779118 ~ 61796715 (-)
LOC110492510 LOC106566591 coding upstream 36442 61814544 ~ 61943821 (-)
LOC110529871 zbtb46 coding upstream 403127 62181229 ~ 62311208 (-)
uckl1b uckl1 coding upstream 550686 62328788 ~ 62386980 (-)
LOC118939568 NA coding upstream 564264 62342366 ~ 62347109 (-)
G1398118 NA non-coding downstream 9804 61762525 ~ 61763237 (-)
G1398116 NA non-coding downstream 15151 61755971 ~ 61757890 (-)
G1398110 NA non-coding downstream 29012 61743828 ~ 61744029 (-)
G1398101 NA non-coding downstream 40220 61732574 ~ 61732821 (-)
G1398047 NA non-coding downstream 133657 61637703 ~ 61639384 (-)
G1398126 NA non-coding upstream 21216 61799318 ~ 61799737 (-)
G1398132 NA non-coding upstream 30295 61808397 ~ 61812453 (-)
G1398133 NA non-coding upstream 35782 61813884 ~ 61814480 (-)
G1398142 NA non-coding upstream 50378 61828480 ~ 61828761 (-)
G1398185 NA non-coding upstream 135100 61913202 ~ 61913587 (-)
abhd6b LOC106566659 other downstream 1018170 60753006 ~ 60758788 (-)
G1396543 NA other downstream 1079005 60693609 ~ 60694036 (-)
LOC118939463 NA other downstream 1109525 60661556 ~ 60672085 (-)
G1396467 NA other downstream 1191006 60554756 ~ 60582035 (-)
G1394978 LOC106566621 other downstream 2416192 59354200 ~ 59356849 (-)
G1398619 NA other upstream 956641 62734743 ~ 62735569 (-)
G1399235 NA other upstream 1421017 63199119 ~ 63292201 (-)
G1399367 NA other upstream 1606747 63384849 ~ 63385262 (-)
G1400503 zhx3 other upstream 2325268 64103370 ~ 64105039 (-)
G1400552 NA other upstream 2478824 64256926 ~ 64257433 (-)

Expression


Co-expression Network