G1398132


Basic Information

Item Value
gene id G1398132
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 61808397 ~ 61812453 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1596648
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>TU1596649
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Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106583681

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1596648 False 3970 lncRNA 0.37 2 61808397 61812453
TU1596649 True 3651 lncRNA 0.37 3 61808397 61812453

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110492496 LOC106566592 coding downstream 11682 61779118 ~ 61796715 (-)
LOC110492507 LOC106566595 coding downstream 119318 61687247 ~ 61689079 (-)
LOC110492509 LOC106566095 coding downstream 206974 61595093 ~ 61601423 (-)
dnah12 dnah12 coding downstream 213576 61558700 ~ 61594821 (-)
asb14b LOC106566601 coding downstream 249975 61552330 ~ 61558422 (-)
LOC110492510 LOC106566591 coding upstream 2091 61814544 ~ 61943821 (-)
LOC110529871 zbtb46 coding upstream 368776 62181229 ~ 62311208 (-)
uckl1b uckl1 coding upstream 516335 62328788 ~ 62386980 (-)
LOC118939568 NA coding upstream 529913 62342366 ~ 62347109 (-)
LOC110492495 znf512b coding upstream 574975 62387428 ~ 62459484 (-)
G1398126 NA non-coding downstream 8660 61799318 ~ 61799737 (-)
G1398120 NA non-coding downstream 30295 61773041 ~ 61778102 (-)
G1398118 NA non-coding downstream 45160 61762525 ~ 61763237 (-)
G1398116 NA non-coding downstream 50507 61755971 ~ 61757890 (-)
G1398110 NA non-coding downstream 64368 61743828 ~ 61744029 (-)
G1398133 NA non-coding upstream 1431 61813884 ~ 61814480 (-)
G1398142 NA non-coding upstream 16027 61828480 ~ 61828761 (-)
G1398185 NA non-coding upstream 100749 61913202 ~ 61913587 (-)
G1398231 NA non-coding upstream 169225 61981678 ~ 61981894 (-)
G1398243 NA non-coding upstream 189558 62002011 ~ 62002243 (-)
abhd6b LOC106566659 other downstream 1053526 60753006 ~ 60758788 (-)
G1396543 NA other downstream 1114361 60693609 ~ 60694036 (-)
LOC118939463 NA other downstream 1144881 60661556 ~ 60672085 (-)
G1396467 NA other downstream 1226362 60554756 ~ 60582035 (-)
G1394978 LOC106566621 other downstream 2451548 59354200 ~ 59356849 (-)
G1398619 NA other upstream 922290 62734743 ~ 62735569 (-)
G1399235 NA other upstream 1386666 63199119 ~ 63292201 (-)
G1399367 NA other upstream 1572396 63384849 ~ 63385262 (-)
G1400503 zhx3 other upstream 2290917 64103370 ~ 64105039 (-)
G1400552 NA other upstream 2444473 64256926 ~ 64257433 (-)

Expression


Co-expression Network