G1406514



Basic Information


Item Value
gene id G1406514
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 71260322 ~ 71260817 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU1606514
tctatgtctccctatgtctatgtctctatgtctatgtctccctatgtctatgtctctctatgtATATGTCTCCCTATGTCTATGTCTCCCTATGTCTATGTCTCCCtatgtctatgtctctctatgtctatgTCGCCCTATGTCTATGTCTCCCTATGTCTATGTCTCCCtatgtctatgtctctctatgtctatgtctccctatgtctatgtctctctatgtctatgtctccctatgtctatgtctctctatgtccATGTCTCCCtatgtctatgtctctctatgtctatgtctctctgtctccctatgtatatgtctctctatgtctatgtctatgtctatgtctctctatgtctatgtctctatgtctatgtctccctatgtctatgtctctc

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1606514 True 396 TUCP 0.41 2 71260322 71260817

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
trnah-gug-49 NA coding downstream 214721 71045530 ~ 71045601 (-)
trnat-agu-70 NA coding downstream 215738 71044511 ~ 71044584 (-)
trnat-agu-69 NA coding downstream 217114 71043135 ~ 71043208 (-)
trnat-agu-68 NA coding downstream 218490 71041759 ~ 71041832 (-)
trnat-agu-67 NA coding downstream 219851 71040398 ~ 71040471 (-)
LOC110492672 LOC106566404 coding upstream 481159 71741976 ~ 71764421 (-)
LOC118939604 NA coding upstream 545453 71806270 ~ 71806324 (-)
LOC118939585 NA coding upstream 582330 71843147 ~ 71850380 (-)
LOC110492674 rbm15 coding upstream 592040 71852857 ~ 71858795 (-)
alx3 LOC106566393 coding upstream 605533 71866350 ~ 71881855 (-)
G1406511 NA non-coding downstream 4139 71255964 ~ 71256183 (-)
G1406506 NA non-coding downstream 49561 71210249 ~ 71210761 (-)
G1406504 NA non-coding downstream 50428 71209559 ~ 71209894 (-)
G1406500 NA non-coding downstream 57984 71199077 ~ 71202338 (-)
G1406493 NA non-coding downstream 65226 71193862 ~ 71195096 (-)
G1406519 NA non-coding upstream 2709 71263526 ~ 71263750 (-)
G1406527 NA non-coding upstream 11508 71272325 ~ 71272537 (-)
G1406602 NA non-coding upstream 36936 71297753 ~ 71298363 (-)
G1406606 NA non-coding upstream 41732 71302549 ~ 71303632 (-)
G1406607 NA non-coding upstream 43528 71304345 ~ 71304753 (-)
G1406228 NA other downstream 518143 70735647 ~ 70742179 (-)
LOC110492660 LOC106566428 other downstream 1039066 70216538 ~ 70221552 (-)
G1405917 NA other downstream 1164781 70078657 ~ 70095541 (-)
G1405172 NA other downstream 1742209 69517755 ~ 69518113 (-)
G1405016 nsfl1c other downstream 1979963 69277827 ~ 69280359 (-)
G1406752 NA other upstream 241662 71501118 ~ 71547366 (-)
G1406760 NA other upstream 279141 71539958 ~ 71543469 (-)
G1407628 NA other upstream 1070989 72331806 ~ 72332715 (-)
G1407755 NA other upstream 1174612 72435429 ~ 72437847 (-)
G1408615 NA other upstream 1969995 73230812 ~ 73232954 (-)

Expression



Co-expression Network