G1406752


Basic Information

Item Value
gene id G1406752
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 71501118 ~ 71547366 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1606863
gaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagaggagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctgttatccacatggaactaaaagacatcaggtatattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggagataaaagaggagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggagataaaagaggagacatcaggtatattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagaggagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctgttatccacatggaactaaaagacatcaggtctgttatccacatggaactaaaagtcatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagacatcaggtctgttatcaacatggaactaaaagacatcaggtctattatccacatggaactaaaagaggagacatcaggtctattatccacatggaactaaaatacatcatgtctattatccacatggagataaaagaggagacatcaggtctattgtccacatggaactaaaatacatttCCCAAATGGCAAAACTAAGAGATATTTTCCTGAACTTTCTGGACTAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCTGGATTAAAAACACTGTCTAATCTCCTGGATTAAAAACACTGTCTAATCTCCAGAACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCAGAACTAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAAACACTGTATAATCTCCAGAACTAAAAAGCACTGTCTAATCTCCTGGATTAAAAACACTGTCTAATCTCCAGGACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCTGGATTAAAAACACTGTCTAATCTCCAGGACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAACACTGTCTAATCTCCTGCACTAAAAAACACTGTCTAATCTCCTGGATTAAAAACACTGTCTAATCT
>TU1606848
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>TU1606857
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>TU1606869
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>TU1606885
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>TU1606868
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>TU1606889
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>TU1606880
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>TU1606892
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>TU1606886
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>TU1606874
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>TU1606877
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>TU1606872
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>TU1606887
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>TU1606851
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>TU1606876
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>TU1606853
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1606863 False 1544 lncRNA 0.37 4 71501118 71512467
TU1606848 False 632 lncRNA 0.38 2 71502479 71528807
TU1606849 False 383 TUCP 0.38 2 71502479 71527677
TU1606862 False 664 lncRNA 0.38 2 71502479 71523662
TU1606857 False 1138 lncRNA 0.37 4 71503199 71514394
TU1606869 False 902 lncRNA 0.37 2 71503199 71507488
TU1606885 False 290 lncRNA 0.38 2 71503199 71537301
TU1606868 False 239 lncRNA 0.36 2 71509682 71511983
TU1606861 False 252 lncRNA 0.35 2 71510597 71511627
TU1606889 False 427 lncRNA 0.37 2 71510597 71515154
TU1606880 False 772 lncRNA 0.37 6 71512103 71547366
TU1606892 False 535 lncRNA 0.37 3 71514133 71522942
TU1606886 False 421 lncRNA 0.38 2 71520733 71522942
TU1606874 False 281 lncRNA 0.38 2 71523140 71524105
TU1606877 False 423 lncRNA 0.36 2 71523841 71532303
TU1606872 False 856 lncRNA 0.36 2 71529079 71547366
TU1606887 False 1525 TUCP 0.36 2 71529079 71545845
TU1606851 False 838 TUCP 0.36 3 71534565 71544501
TU1606876 False 1162 TUCP 0.36 2 71536312 71545845
TU1606853 True 346 lncRNA 0.38 2 71542411 71547366

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
trnah-gug-49 NA coding downstream 455517 71045530 ~ 71045601 (-)
trnat-agu-70 NA coding downstream 456534 71044511 ~ 71044584 (-)
trnat-agu-69 NA coding downstream 457910 71043135 ~ 71043208 (-)
trnat-agu-68 NA coding downstream 459286 71041759 ~ 71041832 (-)
trnat-agu-67 NA coding downstream 460647 71040398 ~ 71040471 (-)
LOC110492672 LOC106566404 coding upstream 194610 71741976 ~ 71764421 (-)
LOC118939604 NA coding upstream 258904 71806270 ~ 71806324 (-)
LOC118939585 NA coding upstream 295781 71843147 ~ 71850380 (-)
LOC110492674 rbm15 coding upstream 305491 71852857 ~ 71858795 (-)
alx3 LOC106566393 coding upstream 318984 71866350 ~ 71881855 (-)
G1406705 NA non-coding downstream 11496 71489268 ~ 71489622 (-)
G1406694 NA non-coding downstream 69806 71428696 ~ 71431312 (-)
G1406649 LOC106566323 non-coding downstream 113407 71382839 ~ 71387711 (-)
G1406651 NA non-coding downstream 115155 71384608 ~ 71385963 (-)
G1406644 NA non-coding downstream 123492 71377415 ~ 71377626 (-)
G1406762 NA non-coding upstream 3709 71551075 ~ 71551546 (-)
G1406764 NA non-coding upstream 9205 71556571 ~ 71556854 (-)
G1406765 NA non-coding upstream 9888 71557254 ~ 71557499 (-)
G1406766 NA non-coding upstream 10400 71557766 ~ 71558190 (-)
G1406895 NA non-coding upstream 72064 71619430 ~ 71620029 (-)
G1406514 NA other downstream 240301 71260322 ~ 71260817 (-)
G1406228 NA other downstream 758939 70735647 ~ 70742179 (-)
LOC110492660 LOC106566428 other downstream 1279862 70216538 ~ 70221552 (-)
G1405917 NA other downstream 1405577 70078657 ~ 70095541 (-)
G1405172 NA other downstream 1983005 69517755 ~ 69518113 (-)
G1407628 NA other upstream 784440 72331806 ~ 72332715 (-)
G1407755 NA other upstream 888063 72435429 ~ 72437847 (-)
G1408615 NA other upstream 1683446 73230812 ~ 73232954 (-)
ppdpfb LOC106566296 other upstream 2222490 73769856 ~ 73777432 (-)
rps21 LOC106572905 other upstream 2625507 74172873 ~ 74182639 (-)

Expression


Co-expression Network