XLOC_033065 (kbtbd12)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_033065
gene name kbtbd12
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 40715637 ~ 40722480 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00064252
AGCATAGATCATGTAGAGAGCATGATGGTATGAAATTTGACCCCGCTCTCTTGGCCAGTACTGAAAGCCTTTCCCTGCATTTCAAGCTGGGGAAAAAAAGTATTACAAAATCACTATGGTTGCTGTGCAAAATGATGATAAAAACTTTCTGCACCTACTGTAGTATTTAATAACATTGAGAGTTCAAGAAACATGTGAAATATGTTTTCATGTCTCCCCCTTTGCTAGTTTGACAAATCATGGTCTATAATTAGCTCTGTTGCTTAGCTGGAATGGCCATGGAAGGCTGAGTTGACAGAGCATGCTCTCTCCCCCAGTGTTTACAGTCAGACGCGAAGCAGCCAGCCTGTTTGTGTCGAGGTAATGGACGAACTGTTGCCTGAAGGCAGACACCACAGGAAGCCAGAGATCTGGTACGATTTACTGATGCATGTGCTAATATAATGCTATGTGACTAGCCTGTGACTGATAAAACAATAACTATCTTTCTGTTGACGTGTCAAAGCATTGACCTGTTAAGCACTGACCCTTGGGCGAGATAAAAATGACTTGTGCATACAAAATTAACTTTCTGTATACTTTCCACTAGCGTTAgctaattgtttgttttttctctcttCAGATATCATTGACCCCTTTTTAAAGACCTCCAGGATGTATTTAGACAACGTGTAACACTTCGCTAAGTTTTAAGCTATCTAAACACAGAACTAAAATGGATCTGAGAGCCAAGCATGGTTTAACGCTGTTGGAACAGCTCAACCGAATGCGGGATGCCGAGCAGTTAACAGACGTGGTTTTAGTTGCTGAAGGTGTAAGCTTCCCATGTCACCGTGCAGTGCTTTCTGCCTTCAGCCCTTACTTTCGCGTAATGTTCACCTGTGGCCTGCGTGAATGTTCCAACCGTCAGGTGGTGTTAAGAGACATGCCGGCCCCAAGCCTGGCTCTCCTGCTGGAATACATGTACAGCTCCAATCTTCCGCTCACTGCAGACAATGTGCAGGGCATCTCTGTTGCGGCTTTTCTTCTACAGATGGACGATGTGTTCAGTCGTTGTCAGATCTACATGATTGACAACATGGATACTACAAATTGCTTGGGAATCTACTATTATGCCCGGGATCTAGGAGCAGAGGAGTTGGCCGACCAGGCTCAGCGCTACCTGCGGCAGCATTTCACTGAAGTGTGTTATGGGGAGGAAGTGCTGGAGTTAGAGGCACACCAGCTCGGGGCGTTATTGAGCTCAGACGACCTCAACGTTTCACGAGAAGAGAGCATTTTGGATGTGGTGATGCGCTGGGTGAAGTACTGTCCCGGAGATGTTGGGTCAGAGGAAGAGAACCGGGCCAGGCACCTTCCAGAGCTACTAAAGAAAGTACGTCTTCCACTTGTGGGTGTGGATTACTTGAAAGGGACAATGAAGCGTAACACAGCACTGCTAGTTGATGCTGAGTGTCTTCAGATAATGGAGGAGGCAATTGAAGCAGCAAGCTTGGATTCAGATGCTCCACCTCGACGACTGAAGCTGCGCTACGGTATGGAGACTACGGACCTGCTGCTCTGCATTGGTAATGAGGGCGGAGGGATACGCTCACGTTATGGAAGCTACACTGAGCGCAGCTTCTGTTATGCTCCCACCACTGGTCGGACACTTTTTATCACCTCCCCACGATACGGTGAAGCGCTTGGATATGTCTTTGCTGGGGTGGTGACTGAGAAGAATGAAATTGTGGTGTCAGGAGAGCTAGGAGCCAGAAAGATGGCAAGGCATAAAGACAAAAACGTGGAGATTTTCATGTACAACAAGGAAGCCCAGGGCTCCTGGAAGCACTTGAGCTCAGCGGAATATCGTGATTCTTATGCACTGAGCTCTTTGGGAGAAAATCTGTACCTGATTGGGGGCCAGATGAAGTTGAAGAACCAGTACCATATCACCAATAGTGTTGAGCGCTGGTCTCTACAAGGTGGGCCTTGGCGTAGTACTGCTCCTCTGCCAATGCCACTGGCTTATCATAGTGTAGTTCGGATGAAGGGCCGCTTATATGTGCTTGGAGGACGAACACCTCAGTCATTCCGCACAGATGACGAGCCTGACCGTATGAGTAATCGCCTGCTTGAATATGACCCAGAAACCAACAAGTGGAATGAACTTGGTCCTATGAAATTTTCAAAATACCGTTGCAGCGCAGTCGCACTCAATGGAGAAATCTACGTCCTAGGAGGTATTGGATGTGAAGGTGTGGATCGTGGCCAGTCACGTTACTGCCTTAATGTAGTGGAGATCTACAACCCCGATGGTGACTTCTGGAGAGATGGTCCTCCTTTGCCATGGCCTCTCCTGACACTTCGGAGCAATGCATCAAACGCTGGTGTTGTTGATGGCAAACTTTATGTCTGTGGATACTACAAAGGGGCAGATCGTCATGATACCATCACTAAAGACATCCTCCAGTTGGATCCATGGGAAAATGTATGGACTGTGGTGGCAAAGCAGGCTCTGATGCACGACAGTTATGATGTGTGTTTGGTGGCAAATCTGAACCCCCGTGGACTCATGCCTCCTCCTGCTGACTTGGTAGAGGAATAACACTCTTCAACAGATTTCGCATTAAACAAATAATGCCTTTAATGTCATTCACAGGATAAGAGGATTTAGATAGATCTAGAGAGTGTAAAACTTTCTAAAATAGATATGAATTTGTACTTTAAAATCAGTTAGGTTTGTAATGCTGTATGTGCCTactttgatttgatttacatttGTGGATATGTGATGGTATGAAATACTCTTACAGGTTAGATTAAGTAACACTCAGCAAAGTTAtgctaaaatgtaattttactaAACTATAATAGTAAAAATACATTGCATGGAGTCACACAATACATATATGTACTGCaatttattaaacatgttaaagtttCAAACTTAAATTAGATAAATATGTCATAACTGCAAACCaagttgaatatattttaaaactattttgtacTTATTAAAGTTATACTGACATTTGTTAAGCTACACATTTCTGGAATAGGATTTGTGAAAAAATATGACATAGGTTTATATTATATCAGTATGtgctaaataaacagaaaaatattgCCAAAGCACAGAAACAGAAGGTAACATCCATGGATAGAAAAGTGGTTAAAGAATAAGTTTCACTTGTTCAAAGGCAGTCTGAAGTTCTATCTTCCTAGAAAATTAAGTATTCTCCATCTTACTCTGAGTCATTGGTAAAGTCAAAGAGCTGCCAGAGGCCTCCTTCTCCTTCAGTGACACAAGCTTTAGGTTCAGGTGCAACATTTTCCCACTCAGCCATCTTGTATTCCACTATCATTTGGGAGCTGTCTGTGTCCTCAGACCACAAGTTTAAGGGATTTAATAATTGTTTAGCCACACACCTACTGACTGGTGCAACTGGGGCTTGCTTCGGTAATCTTGGATGATCctcttcaacatttttttttgcaaatttccaGTTGTCAACAGAAGAGAGTGGTACTCTGTCTTTTTGTTCACATGGAAGGTCTTCACTTTGGCTGTCTTCTGAGAACTTTGTTGCTCCTTTTTTTCTCACTGCTTGTCTTTGTGGAAGAACCAAGGCTCTCCTTTTTCCCCGGTAGTTCAGTGCTTTTTGGCGCCTCTTAGGTTCTTTAAGTCGTGGCATGGCATTAGTGCCCAATTTATTCTCTCTCACAAACATTGGTTTTTCAGACTCCAGGGGTCTATCTACAAATTTTCTTCTGTGGTCCTCTGTGGATGCAGTGGACTGATCATCCACAAGTGGGATAGAAGGTCTGCTCTCAACTAACTTTTTGCACCAAAATTCCTGTGAAGCATCAAGGAAAACCTCTTCAGTGACTAGTGTCTGCTGCCTTGGTACAGGCAGAGCATGTGCATTTCTGTTTTGTGTCTTTTCTGTTGTAAGAGGACATTGGTTCTGTTCTACAGCTTTTCCTGAATAAATGACAGGCCTGCTAAATATCATCTTTTTCTCGTCATGTTTTTCAGCCAACATTACACAGAACCTTTCAAACAGTCTTGGTGATGTCTGAACCTCACTGTCAATCATTCTGGCAGAGCCAGGTCCTGCTGTCGGCTTATGTATAGAAATCAAAGTGCAGAGTTGAGACAGAATTTTTCCCAGCATGCCCTGCTCTTTGCTTTGCTCTGCTTTCAGGGCTTCCAGATCTCGTTGGAGGTTAAGCATATTTGAGCTTAATTCTTTTGCAGCCAGAGCACTCTAATTGGATAGAAAATAAATGTGGCGTAACTGGCTAAATCAACACAGAGTACATTCATAATACCTTTAACACAGATTGTTTCAGTTATAATTGTAGCCCTTACCTTGGCTTCCCTGTCTGTTAattctgtttgtgtttggttctgCAGAGTCTCAAACTGACATGTTATACCCATTTTCAAACTGTTTAAATAACCTTCAACTGCAATGGAGAACAAAATATCACAGGCTATGAATATCTActgcatttaaaatttttaaacatttttaaagcacattGGTGCTATTGaaatctaatataatattatcTGTTTAGTAAAACTAAAAACATACTTGTTTTTGAAAAATGATCCATTCTCTCTACCAAAATGTTCCTGGTAATGTCATTACTTCCATCAAAGCGGTTTAATAAGGTCtctctggtctaaaaaggaataGGTAAGTGAAAGTCTAGTGATACTGAAACCATTAAACATGCATGTTTTACTTACATTTTCCAGATATTCCTGCAGTTTTAGAATTCCATTAGTAAGAAATTCCCTATAAAGAGAAACAGTTATATAACAACATGTGAGCACAGAAACTAAGCTATGTAAAAATTGCATTAGAAAACTTAAAACAGTCATCTGATTAAAAGATAGTTTTTTTCACTGTGAGGATCAAGAGTAAATACCTTTCatatttttctttggcttttCTCTTCTCTTCCTCAAATCTGTCCAAGACGCCAACAGATTTGCCACTGGTGAAGCTTGGGAATTTCCCATCACTGCCAAACAAAAAAGGCTTAGAACTATAACTGCTGGACACGGTCATTTCCTTcatctgaaaaaaatgtaaacagtttaatattaaaataatattgataa
>TCONS_00064253
GGAAGGCTGAGTTGACAGAGCATGCTCTCTCCCCCAGTGTTTACAGTCAGACGCGAAGCAGCCAGCCTGTTTGTGTCGAGGTAATGGACGAACTGTTGCCTGAAGGCAGACACCACAGGAAGCCAGAGATCTGATATCATTGACCCCTTTTTAAAGACCTCCAGGATGTATTTAGACAACGTGTAACACTTCGCTAAGTTTTAAGCTATCTAAACACAGAACTAAAATGGATCTGAGAGCCAAGCATGGTTTAACGCTGTTGGAACAGCTCAACCGAATGCGGGATGCCGAGCAGTTAACAGACGTGGTTTTAGTTGCTGAAGGTGTAAGCTTCCCATGTCACCGTGCAGTGCTTTCTGCCTTCAGCCCTTACTTTCGCGTAATGTTCACCTGTGGCCTGCGTGAATGTTCCAACCGTCAGGTGGTGTTAAGAGACATGCCGGCCCCAAGCCTGGCTCTCCTGCTGGAATACATGTACAGCTCCAATCTTCCGCTCACTGCAGACAATGTGCAGGGCATCTCTGTTGCGGCTTTTCTTCTACAGATGGACGATGTGTTCAGTCGTTGTCAGATCTACATGATTGACAACATGGATACTACAAATTGCTTGGGAATCTACTATTATGCCCGGGATCTAGGAGCAGAGGAGTTGGCCGACCAGGCTCAGCGCTACCTGCGGCAGCATTTCACTGAAGTGTGTTATGGGGAGGAAGTGCTGGAGTTAGAGGCACACCAGCTCGGGGCGTTATTGAGCTCAGACGACCTCAACGTTTCACGAGAAGAGAGCATTTTGGATGTGGTGATGCGCTGGGTGAAGTACTGTCCCGGAGATGTTGGGTCAGAGGAAGAGAACCGGGCCAGGCACCTTCCAGAGCTACTAAAGAAAGTACGTCTTCCACTTGTGGGTGTGGATTACTTGAAAGGGACAATGAAGCGTAACACAGCACTGCTAGTTGATGCTGAGTGTCTTCAGATAATGGAGGAGGCAATTGAAGCAGCAAGCTTGGATTCAGATGCTCCACCTCGACGACTGAAGCTGCGCTACGGTATGGAGACTACGGACCTGCTGCTCTGCATTGGTAATGAGGGCGGAGGGATACGCTCACGTTATGGAAGCTACACTGAGCGCAGCTTCTGTTATGCTCCCACCACTGGTCGGACACTTTTTATCACCTCCCCACGATACGGTGAAGCGCTTGGATATGTCTTTGCTGGGGTGGTGACTGAGAAGAATGAAATTGTGGTGTCAGGAGAGCTAGGAGCCAGAAAGATGGCAAGGCATAAAGACAAAAACGTGGAGATTTTCATGTACAACAAGGAAGCCCAGGGCTCCTGGAAGCACTTGAGCTCAGCGGAATATCGTGATTCTTATGCACTGAGCTCTTTGGGAGAAAATCTGTACCTGATTGGGGGCCAGATGAAGTTGAAGAACCAGTACCATATCACCAATAGTGTTGAGCGCTGGTCTCTACAAGGTGGGCCTTGGCGTAGTACTGCTCCTCTGCCAATGCCACTGGCTTATCATAGTGTAGTTCGGATGAAGGGCCGCTTATATGTGCTTGGAGGACGAACACCTCAGTCATTCCGCACAGATGACGAGCCTGACCGTATGAGTAATCGCCTGCTTGAATATGACCCAGAAACCAACAAGTGGAATGAACTTGGTCCTATGAAATTTTCAAAATACCGTTGCAGCGCAGTCGCACTCAATGGAGAAATCTACGTCCTAGGAGGTATTGGATGTGAAGGTGTGGATCGTGGCCAGTCACGTTACTGCCTTAATGTAGTGGAGATCTACAACCCCGATGGTGACTTCTGGAGAGATGGTCCTCCTTTGCCATGGCCTCTCCTGACACTTCGGAGCAATGCATCAAACGCTGGTGTTGTTGATGGCAAACTTTATGTCTGTGGATACTACAAAGGGGCAGATCGTCATGATACCATCACTAAAGACATCCTCCAGTTGGATCCATGGGAAAATGTATGGACTGTGGTGGCAAAGCAGGCTCTGATGCACGACAGTTATGATGTGTGTTTGGTGGCAAATCTGAACCCCCGTGGACTCATGCCTCCTCCTGCTGACTTGGTAGAGGAATAACACTCTTCAACAGATTTCGCATTAAACAAATAATGCCTTTAATGTCATTCACAGGATAAGAGGATTTAGATAGATCTAGAGAGTGTAAAACTTTCTAAAATAGATATGAATTTGTACTTTAAAATCAGTTAGGTTTGTAATGCTGTATGTGCCTactttgatttgatttacatttGTGGATATGTGATGGTATGAAATACTCTTACAGGTTAGATTAAGTAACACTCAGCAAAGTTAtgctaaaatgtaattttactaAACTATAATAGTAAAAATACATTGCATGGAGTCACACAATACATATATGTACTGCaatttattaaacatgttaaagtttCAAACTTAAATTAGATAAA

Function

symbol description
kbtbd12 Is expressed in myotome. Orthologous to human KBTBD12 (kelch repeat and BTB domain containing 12).

GO: NA

KEGG:

id description
ko04121 Ubiquitin system

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-050904-1 Is expressed in myotome. Orthologous to human KBTBD12 (kelch repeat and BTB domain containing 12).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000001882

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00064252 False 5122 mRNA 0.42 5 40715637 40722480
TCONS_00064253 True 2454 mRNA 0.47 6 40717816 40722200

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_033064 si:ch211-157b11.12 coding downstream 2433 40707162 ~ 40713204 (-)
XLOC_033063 si:ch211-157b11.14 coding downstream 18052 40689357 ~ 40697585 (-)
XLOC_033062 CR450814.2 coding downstream 48174 40667347 ~ 40667463 (-)
XLOC_033061 NA coding downstream 54313 40659954 ~ 40661324 (-)
XLOC_033060 dre-mir-200c coding downstream 59349 40656204 ~ 40656288 (-)
XLOC_033066 p4htm coding upstream 8389 40730869 ~ 40744726 (-)
XLOC_033067 arpc4 coding upstream 20887 40743367 ~ 40778294 (-)
XLOC_033068 myhb coding upstream 22957 40745437 ~ 40756138 (-)
XLOC_033069 h1-10 coding upstream 47037 40769517 ~ 40771813 (-)
XLOC_033070 CR450814.1 coding upstream 73418 40795898 ~ 40819766 (-)
XLOC_033059 dre-mir-141 non-coding downstream 59552 40656003 ~ 40656085 (-)
XLOC_033058 dre-mir-429b non-coding downstream 62399 40653129 ~ 40653238 (-)
XLOC_033074 NA non-coding upstream 133659 40856139 ~ 40864078 (-)
XLOC_033076 CR293534.1 non-coding upstream 223877 40946357 ~ 40946475 (-)
XLOC_033077 NA non-coding upstream 241206 40963686 ~ 40968341 (-)
XLOC_033085 NA non-coding upstream 729190 41451670 ~ 41452888 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000340_09794255_09797190 KBTBD12 coding CI01000340 null 9793937 ~ 9797689 (-)