G1410422



Basic Information


Item Value
gene id G1410422
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 75997919 ~ 76008316 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU1611526
tagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagactagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagtgtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagtgtagtgtagtgtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagactagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagtgtagtgtagagtagagtagagtagtgtagtgtagagtagactagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagtgtagtgtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagactagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagtgtagagtagactagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagtgtagtgtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagactagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagtgtagtgtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagactagagtag
>TU1611525
tagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtaga
>TU1611527
tgtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagactagagtagagtagagtagagtaatgtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagtgtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtaga
>TU1611523
tagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagactagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagtgtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtaatgt
>TU1611524
gtgtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtatagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagactagtgtagagtagagtagagtagagtag
>TU1611528
tagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagactagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagactagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagactagactagactagactagactagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagactagtgtagagtagagtagactagagtagagtagtgtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagtgtagactagactagagtagagtagagtagagtagactagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagactagtgtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagtgtagagtaga
>TU1611531
tagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagactagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagactagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagactagactagactagactagactagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagactagtgtagagtagagtagactagagtagagtagtgtagtgtagagtagagtagtgtagagtagtgtagagtagtgtagactagactagagtagagtagagtagagtagactagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagactagtgtagagtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagtgtagagtagagtagagtagtgtagagtagagtagagt

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1611526 False 963 lncRNA 0.40 6 75997919 76008316
TU1611525 False 244 lncRNA 0.40 2 76000518 76008316
TU1611527 False 316 lncRNA 0.40 2 76000518 76001133
TU1611523 False 371 lncRNA 0.40 3 76004661 76008316
TU1611524 False 226 lncRNA 0.40 2 76004839 76007224
TU1611528 False 729 lncRNA 0.40 3 76006828 76008316
TU1611531 True 711 lncRNA 0.40 2 76007311 76008316

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110492917 LOC106566358 coding downstream 382797 75600034 ~ 75615122 (-)
LOC118939468 NA coding downstream 625014 75371620 ~ 75372905 (-)
LOC110491183 LOC106566345 coding downstream 950946 75029607 ~ 75046973 (-)
irak1 LOC106566344 coding downstream 982540 74986625 ~ 75015379 (-)
LOC110492703 LOC106566343 coding downstream 1013084 74922068 ~ 74984835 (-)
LOC110492699 tcea2 coding upstream 95893 76104209 ~ 76119590 (-)
LOC110492709 LOC106566328 coding upstream 552941 76561257 ~ 76642094 (-)
usp21 LOC106566311 coding upstream 649587 76657903 ~ 76693758 (-)
LOC110514470 uba1 coding upstream 697473 76705789 ~ 76774764 (-)
LOC118939598 LOC106572974 coding upstream 798835 76807151 ~ 76997020 (-)
G1410402 NA non-coding downstream 27776 75969196 ~ 75970143 (-)
G1410298 NA non-coding downstream 36392 75961318 ~ 75961527 (-)
G1410290 NA non-coding downstream 52073 75945594 ~ 75945846 (-)
G1410288 NA non-coding downstream 56117 75940707 ~ 75941802 (-)
G1410274 NA non-coding downstream 78527 75919177 ~ 75919392 (-)
G1410428 NA non-coding upstream 11736 76020052 ~ 76020467 (-)
G1410465 NA non-coding upstream 83115 76091431 ~ 76094052 (-)
G1410468 NA non-coding upstream 91351 76099667 ~ 76100856 (-)
G1410470 NA non-coding upstream 92711 76101027 ~ 76102220 (-)
G1410472 NA non-coding upstream 99727 76108043 ~ 76109361 (-)
G1410213 NA other downstream 133463 75807474 ~ 75864456 (-)
G1410190 NA other downstream 241440 75755742 ~ 75756479 (-)
G1409928 NA other downstream 562379 75435054 ~ 75435540 (-)
G1409847 NA other downstream 628296 75368890 ~ 75369623 (-)
G1410456 NA other upstream 52753 76061069 ~ 76061732 (-)
G1410487 LOC106566354 other upstream 156327 76164643 ~ 76165488 (-)
G1410557 NA other upstream 244905 76253221 ~ 76311947 (-)
G1410696 NA other upstream 548724 76557040 ~ 76558174 (-)

Expression



Co-expression Network