G1410587


Basic Information

Item Value
gene id G1410587
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 76414286 ~ 76418992 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1611754
TATTATTCCCCATAAAAACAAATCTCTTCACAATGTATTTACAGGCACATCCGGTGTCACACTAGACACACGCCAGAGTGACAGACATGTGGCTGATCTCCAGCTCTCACTCAACTCCCCAATGTCATTACAAACCACTGTTTAGTGTCACATTTGAGTTGGATTATTGTCCCTAGCCTGACCGGGCCAAAAGTAGTGTACCATATAGGCAATAGGATGGCATAGGGGATAGAGACCTCTTCATTAAAATAGGTCCAGACCTGTGTGTTGTTGACGACCCAGAATGGGAAAGAATATAAAATTGTACAGCCAGTAGAAAAACACAACAGTTAACATCACAaacgcaccctattcccttcatagtgcactactttagaccagggaatATTGGGAAGCCCAGGTGGAGAAGCCCAGGTGAGGAAGCCGAGGTGGGAAGCCCAGGTGAGGAAGCCCAGGTGGGGAAGCCCAGGTGAGGAAGCccagagggctctggtctaaagtggtgcactatgtaggagaTAGGGTTCCCTTAGCACGTTGCTGCTCTGATTTTAGACGATTAATAAAACAGCATGCAGAGAATCACTAAACTACAACTACAGACACCGGTTCAGTTAAAACTACAGTCCTAGGAGCCAGACACCGGTTCAGTTAAAACTACAGTCCTAGGAGCCAGACACCGGTTCAGAAAAGAACATGCAACATAACACTCACTAGTAATAGGAAGTAACACAACGGACACGTTCCAGGATGACTACACTGCAGATGCCTGCCTAGATAGCTGTTATGTTAAACACCTAACCACATCCTATTATATAGCAATCTGATGCCCGATTGTGCCACTCAATGACGTGGTGCAGAACAATGGGTGGATGCAATGCATCTGTAACGTAGTCGGCCTGGAACGcaaacaggtttctagaaatgACTAGGAAGGAATTGACTTAAACCTTTAAACCGCTCCAATCAAAACAGTGTACAACACAGCCAAGTCAAAAAACATCCTTTAAAATCACACCGCCTGCGTCGCtaaaacggcaccctattccctatatagtgcactagtctGGTTAAACGCAGTTCACTGTAAAGGgcatagggtgtgatttgggaggCTACCCACTGTCAATAAATCAAGCCATACATATTCATGACCAGGAGCTCCAAACACAGAGAACAAAGTGTTAGGAGGGAAAAGTTATTAAGATCACCATTCAGCAATATACCTGTACAAACCCAAGACAGATTAATACATAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAATCTCTAACCCAAAACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCAAGACAGATTAATACATAAAGAACCTCTAACCCAAAACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAAACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAATCTCTAACCCAAAACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTACCCCAAGACATTTTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAGAATAATACATAAAGGATCTCTAACCAAGACAGATTAATACATAAATAACCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTAACCCAAGACAGATTAAAACATAACAGATCTGTATGTCCACTAACCAGGAGATGGGTCAAAGTGTGCAACCTAAAATAGTACCCTATAGagggcactactatagaccagggtccataggaaagagggttccatagggctctggtctaaagtagtgcactatatagggaatagggttccatagggctctggtctaaagtagtgcactacatctcagtgcaagaggcgtcagtacagtccctggttcgaatccaggctgtatcccatagggcagcgcacaattgtcccagcgtcgttcgggtttggccggggtaggccgtcgttgtaaacaAGAAtgtcttaattaactgacttgcctttcaGACAGAGCCAAAGAGAGGAACCACAATTCAGGGTTACACTAGTAACGAGAGAGTGTTAGGTAAATATAGCAATACTGAGTCTGTGGAGTCAGAGCACACCGAACAGGTAACAGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACAGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACAGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACAGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCATCTGTAACAGGTTCTGTCAGTCAGACGTGAGATAAGACAATCACCTCAGATCATCAGAAGAGAATCTCCAGCTTTTCCCTGTTATCTTTACAAATTCAAAACAGGTTCAAAAATATTATACGCTTTAAGTCGTTTCAAAAGTTGAAAACGGCAGCTTTGGTTGGTATGGGATTGGGGATGGAATATAAATAGGCACTATTTACAGGTAATAAATGAGTTTCTATACAGTGCGTGTGTTCAATGTAACAACCTGCTCAACACAGTTGGTTTTTAAAATGACTCAAATCTGCTCAACTCCACCACAGCCCCCTCTTCTGGTCAGACTTGGTGTTCTTGTCCTTTATATTCCCCAGTACATCCCCTATGAGACTTATTGCTAGGAATTCTTTGTCTGCTGCCTGTTTTATTGATTTAGCCTTTATTAGATCAGGAAGTcctactgagaccaaggtctgtTTATTAGATCAGGAAGTCCTACTGAGACCAAGgtctgtTTTACAGATGAGCCTGTTGTACGATGTATTATTTGGTATAGCTTTAACCCATCATCCTCGTTCCTGTATACGGGTTGAAATGGCAGATTTGGATACTGATAAACGCCCTGAATTGGAACGCAGTGTCTGTACGGTAACATGCTATACATAACATCAGGCGCtgtgggttttgactgacagggCCCTATTCACATTCCGTCCCTAGTTAGAAGTCAGTGACCTTATTCTCCCTCAGGGCGGTGACCTGCTCTAGGCCacaggtcaggggttagaggtcagtgaCCTTATTCTCCCTCAGGGATGTCGGCCACAGGTCAGGAGTCAGAGATCAAGGGTTAAAGGTCAGCGACATTGTTCTCCACCAGGGAGGCGACCTGCTCTAGGCCACAGATCAGAGatcaggggttaaaggtcagtGACCTTGTTCTCCACCAGGGCGGCGACCTGCTGTAGACGATAGGCCAG
>TU1611755
TATTATTCCCCATAAAAACAAATCTCTTCACAATGTATTTACAGGCACATCCGGTGTCACACTAGACACACGCCAGAGTGACAGACATGTGGCTGATCTCCAGCTCTCACTCAACTCCCCAATGTCATTACAAACCACTGTTTAGTGTCACATTTGAGTTGGATTATTGTCCCTAGCCTGACCGGGCCAAAAGTAGTGTACCATATAGGCAATAGGATGGCATAGGGGATAGAGACCTCTTCATTAAAATAGGTCCAGACCTGTGTGTTGTTGACGACCCAGAATGGGAAAGAATATAAAATTGTACAGCCAGTAGAAAAACACAACAGTTAACATCACAaacgcaccctattcccttcatagtgcactactttagaccagggaatATTGGGAAGCCCAGGTGGAGAAGCCCAGGTGAGGAAGCCGAGGTGGGGAAGCCCAGGTGAGGAAGCCGAGGTGGGAAGCCCAGGTGGGGAAGCCCAGGTGAGGAAGCccagagggctctggtctaaagtggtgcactatgtaggagaTAGGGTTCCCTTAGCACGTTGCTGCTCTGATTTTAGACGATTAATAAAACAGCATGCAGAGAATCACTAAACTACAACTACAGACACCGGTTCAGTTAAAACTACAGTCCTAGGAGCCAGACACCGGTTCAGTTAAAACTACAGTCCTAGGAGCCAGACACCGGTTCAGAAAAGAACATGCAACATAACACTCACTAGTAATAGGAAGTAACACAACGGACACGTTCCAGGATGACTACACTGCAGATGCCTGCCTAGATAGCTGTTATGTTAAACACCTAACCACATCCTATTATATAGCAATCTGATGCCCGATTGTGCCACTCAATGACGTGGTGCAGAACAATGGGTGGATGCAATGCATCTGTAACGTAGTCGGCCTGGAACGcaaacaggtttctagaaatgACTAGGAAGGAATTGACTTAAACCTTTAAACCGCTCCAATCAAAACAGTGTACAACACAGCCAAGTCAAAAAACATCCTTTAAAATCACACCGCCTGCGTCGCtaaaacggcaccctattccctatatagtgcactagtctGGTTAAACGCAGTTCACTGTAAAGGgcatagggtgtgatttgggaggCTACCCACTGTCAATAAATCAAGCCATACATATTCATGACCAGGAGCTCCAAACACAGAGAACAAAGTGTTAGGAGGGAAAAGTTATTAAGATCACCATTCAGCAATATACCTGTACAAACCCAAGACAGATTAATACATAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAATCTCTAACCCAAAACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCAAGACAGATTAATACATAAAGAACCTCTAACCCAAAACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAAACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAATCTCTAACCCAAAACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTACCCCAAGACATTTTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAGAATAATACATAAAGGATCTCTAACCAAGACAGATTAATACATAAATAACCTCTAACCCAAGACAGATTAATACATAAAGAATCTAACCCAAGACAGATTAAAACATAACAGATCTGTATGTCCACTAACCAGGAGATGGGTCAAAGTGTGCAACCTAAAATAGTACCCTATAGagggcactactatagaccagggtccataggaaagagggttccatagggctctggtctaaagtagtgcactatatagggaatagggttccatagggctctggtctaaagtagtgcactacatctcagtgcaagaggcgtcagtacagtccctggttcgaatccaggctgtatcccatagggcagcgcacaattgtcccagcgtcgttcgggtttggccggggtaggccgtcgttgtaaacaAGAAtgtcttaattaactgacttgcctttcaGACAGAGCCAAAGAGAGGAACCACAATTCAGGGTTACACTAGTAACGAGAGAGTGTTAGGTAAATATAGCAATACTGAGTCTGTGGAGTCAGAGCACACCGAACAGGTAACAGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACAGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACAGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACAGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCACGTGTAACTGGATAGGTCAGGGGTCACCATCTGTAACAGGTTCTGTCAGTCAGACGTGAGATAAGACAATCACCTCAGATCATCAGAAGAGAATCTCCAGCTTTTCCCTGTTATCTTTACAAATTCAAAACAGGTTCAAAAATATTATACGCTTTAAGTCGTTTCAAAAGTTGAAAACGGCAGCTTTGGTTGGTATGGGATTGGGGATGGAATATAAATAGGCACTATTTACAGGTAATAAATGAGTTTCTATACAGTGCGTGTGTTCAATGTAACAACCTGCTCAACACAGTTGGTTTTTAAAATGACTCAAATCTGCTCAACTCCACCACAGCCCCCTCTTCTGGTCAGACTTGGTGTTCTTGTCCTTTATATTCCCCAGTACATCCCCTATGAGACTTATTGCTAGGAATTCTTTGTCTGCTGCCTGTTTTATTGATTTAGCCTTTATTAGATCAGGAAGTcctactgagaccaaggtctgtTTATTAGATCAGGAAGTCCTACTGAGACCAAGgtctgtTTTACAGATGAGCCTGTTGTACGATGTATTATTTGGTATAGCTTTAACCCATCATCCTCGTTCCTGTATACGGGTTGAAATGGCAGATTTGGATACTGATAAACGCCCTGAATTGGAACGCAGTGTCTGTACGGTAACATGCTATACATAACATCAGGCGCtgtgggttttgactgacagggCCCTATTCACATTCCGTCCCTAGTTAGAAGTCAGTGACCTTATTCTCCCTCAGGGCGGTGACCTGCTCTAGGCCacaggtcaggggttagaggtcagtgaCCTTATTCTCCCTCAGGGATGTCGGCCACAGGTCAGGAGTCAGAGATCAAGGGTTAAAGGTCAGCGACATTGTTCTCCACCAGGGAGGCGACCTGCTCTAGGCCACAGATCAGAGatcaggggttaaaggtcagtGACCTTGTTCTCCACCAGGGCGGCGACCTGCTGTAGACGATAGGCCAG

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106593816 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1611754 False 3566 lncRNA 0.43 7 76414286 76418992
TU1611755 True 3580 lncRNA 0.43 8 76414286 76418992

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110492699 tcea2 coding downstream 294696 76104209 ~ 76119590 (-)
LOC110492917 LOC106566358 coding downstream 799164 75600034 ~ 75615122 (-)
LOC118939468 NA coding downstream 1041381 75371620 ~ 75372905 (-)
LOC110491183 LOC106566345 coding downstream 1367313 75029607 ~ 75046973 (-)
irak1 LOC106566344 coding downstream 1398907 74986625 ~ 75015379 (-)
LOC110492709 LOC106566328 coding upstream 142265 76561257 ~ 76642094 (-)
usp21 LOC106566311 coding upstream 238911 76657903 ~ 76693758 (-)
LOC110514470 uba1 coding upstream 286797 76705789 ~ 76774764 (-)
LOC118939598 LOC106572974 coding upstream 388159 76807151 ~ 76997020 (-)
LOC110492706 LOC106566322 coding upstream 683088 77102080 ~ 77104717 (-)
G1410585 NA non-coding downstream 1601 76412412 ~ 76412685 (-)
G1410584 NA non-coding downstream 22390 76391579 ~ 76391896 (-)
G1410573 LOC106594084 non-coding downstream 48270 76365563 ~ 76366016 (-)
G1410571 LOC106572959 non-coding downstream 76432 76337530 ~ 76337854 (-)
G1410567 NA non-coding downstream 90286 76322276 ~ 76324000 (-)
G1410588 NA non-coding upstream 72 76419064 ~ 76419314 (-)
G1410705 NA non-coding upstream 124179 76543171 ~ 76544862 (-)
G1410696 NA non-coding upstream 138048 76557040 ~ 76558174 (-)
G1410697 NA non-coding upstream 140477 76559469 ~ 76559727 (-)
G1410711 NA non-coding upstream 152311 76571303 ~ 76575833 (-)
G1410557 NA other downstream 102339 76253221 ~ 76311947 (-)
G1410487 LOC106566354 other downstream 248798 76164643 ~ 76165488 (-)
G1410456 NA other downstream 352554 76061069 ~ 76061732 (-)
G1410288 NA other downstream 472484 75940707 ~ 75941802 (-)
G1410701 NA other upstream 223788 76642780 ~ 76645664 (-)
G1410773 NA other upstream 373428 76792420 ~ 76795053 (-)
G1410776 LOC106591762 other upstream 376591 76795583 ~ 76797111 (-)
G1410911 NA other upstream 542478 76961470 ~ 76972119 (-)

Expression


Co-expression Network