LOC118940222


Basic Information

Item Value
gene id LOC118940222
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 4486626 ~ 4489118 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036948702.1
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>XM_036948700.1
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>TU1617357
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036948702.1 False 1419 mRNA 0.44 2 4486628 4488122
XM_036948704.1 False 1388 mRNA 0.44 2 4486628 4488122
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XM_036948700.1 False 918 mRNA 0.56 3 4486628 4489118
TU1617357 True 546 TUCP 0.59 2 4486626 4487247

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118940224 NA coding upstream 7822 4478431 ~ 4478806 (+)
LOC118940215 LOC106563992 coding upstream 72051 4238052 ~ 4414577 (+)
LOC118940063 LOC106593486 coding upstream 266794 4207720 ~ 4219834 (+)
LOC110493327 LOC106563993 coding upstream 286409 4194575 ~ 4200219 (+)
LOC110495002 LOC106593218 coding upstream 300804 4179792 ~ 4185824 (+)
LOC110533195 LOC106591134 coding downstream 206 4489324 ~ 4500670 (+)
LOC110517082 NA coding downstream 11644 4500762 ~ 4520671 (+)
LOC118940223 NA coding downstream 33206 4522324 ~ 4523128 (+)
LOC110514597 arpc1a coding downstream 59375 4548493 ~ 4565339 (+)
LOC118940219 arc1b coding downstream 77504 4566622 ~ 4582980 (+)
G1414660 LOC106591133 non-coding upstream 6299 4476241 ~ 4480329 (+)
G1414749 NA non-coding upstream 24964 4458337 ~ 4461664 (+)
G1414747 NA non-coding upstream 38890 4447200 ~ 4447738 (+)
G1414738 NA non-coding upstream 60151 4425918 ~ 4426477 (+)
G1414730 NA non-coding upstream 91134 4395009 ~ 4395494 (+)
G1414759 NA non-coding downstream 36962 4526080 ~ 4526314 (+)
G1414760 NA non-coding downstream 37850 4526968 ~ 4527273 (+)
G1414761 NA non-coding downstream 40912 4530030 ~ 4534088 (+)
LOC118940211 NA other upstream 367056 4115570 ~ 4119613 (+)
G1414190 NA other upstream 593408 3890763 ~ 3893220 (+)
LOC118940205 LOC106585892 other upstream 810607 3670220 ~ 3678312 (+)
G1414430 NA other upstream 893713 3587244 ~ 3592915 (+)
LOC110506850 LOC106593733 other upstream 960642 3519620 ~ 3526117 (+)
radil LOC106592570 other downstream 142568 4631686 ~ 4726137 (+)
G1414786 NA other downstream 162655 4651773 ~ 4652894 (+)
G1414801 NA other downstream 240813 4729387 ~ 4734664 (+)
G1414826 NA other downstream 310405 4799523 ~ 4853325 (+)

Expression


Co-expression Network