XLOC_033273


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_033273
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 59168060 ~ 59171539 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00065269
ttatttctgaaaacaaaacaatatttttattttaaaacaatacttatctagaaaaagcttcttgatttaggaatttttagacatctggactagaaacaaggtAAAAACTTTTGCATTAATGTTGCAGTGTGATAAATAAAGGTTCTATATTGACTGTTAAAGCCACAGGGATCTCTCTTTCGCTGATAAGCAGTGCTCATTTCAAGTATATGCATACtatttgaattaaataattgaatgtaAATAGCAGCCTTTGCAATTTAATGAGCCATACAGCGATTTAGAtctgattaatcatgcagccctaaacaAAGTCTTAGAATTATTTATAGCTCAAATGCACTGATTGTGTGTCCGTCGTCACATTTTCCTGTTCATCTGCACAGAATCATCTTAAAGTCAACATCAAATCAGTCAAAACATCGATTCAGTGATGCTTCGTCATTCTAAATAAATCCTGTTCGCTTCATTAAATGAATAAGCAAATAAATCTCTGCAAATCCTCTGATGACTGGATAAATGTAATGAGcaatgataatgatgatgttaTTTTACACGGCATCtctgaaaataaaacagtaaCAACACTTATCTCTCATTTGTTTGTCGTGTTTTGGTTTTAGTTTGATTACATTTGTGCAGCCACAGTCAACAAATGCTGGACGCTAAAAGAATaatgttgggttgtttttaacccaatgttgggtcaaatatcgACAaacccaaagttttttttttccaattatggCAGATTCATGAACCATTCATctactctaaaaatgctgggttattatAACATAACGTTGGGTCAAATTAATGTTGGGTTAATGTTCTTGATAAAAGATTTAAATTACAGTTTTAAACTTAACATTTGGCTTTGTCTATATTTTATCCAGCATTGggtttaaaacaacccagcacttTTTAGAGTGCATAATTAAACCTCACGTGAAAATAATAAATGGTTATGGCATAACAGCTCTGGCTTTTTAAAGAGAATAAAATCCATAATAACCATTTATATTTCATCTTATGTtgttgctgggttgttttaatgtTGGGTCACAtttggacaaacccaacagttgggttgtttttttttttacaattatagaTTTATATTACACTTTAAAGCCAACATTTGGGTTCGCCCATTATTggacacacacaataaaaaatgctgggttgttatgACATGATGCTGGGTCAAATTTAAACAAAACCAACAGATGGGttaatgtttttttcaattatagattcaaatgacatttttaaacccAACATTTGGGCTTGTATATATTTGACCCATTGGGTTAAACTAATCTagcatattaattttttttgagtgATTTACCCTCAAACTGATATcgatattttcatattttcaattcatctttaattCTATAGAGCCTTTTACAGTCCATATTGTGTCAAATACAGAGGAATGAaaaaagaataatcataataagCTATAAtaacatttcatattttatcttgTGTTCATTATGGCAGATTCATGAATCAGCCATAATGTAACAAATCATCCACtcttaaaaaaatgctgggttgtaatCATAATGTTGGGTCAAATTTGAACAAACCCAACACTTGGGTTAATGTTtttgataaattatttaaattacagtTTTAAATCTAACATTTGGCTTTGTCTATATTTTATCCAGCATTGGGTTTAATACAACCCAGCACATTTTAGAGTGTATAAATGAACCTCATGTGAACAATGAATGACTATGGCGTAAAACGTTCTGACTTTTTAAAGAGAATAAAAAGCCATAGCAgtaattaatatttcattttgtgTTCATGAACTGGGTTTTTGTAACATAACATTGGGTCACATCTGGACAAACCCAATAGCTGGGTTAATATTTTCAATTCTAGATTTAAATGACACTTCTAAACCCAACATTTGGGTCATTGGGTTAAAACAGTCCAGCAGTTTTTGTTTCTATAGAGAGTATAATATAAACTCCACctgaaattttcatattttgttcaTAATGACATATTCATGAATAATTGATCAACGCGAGTCGTTCAAAAGAAAATAACATGTGTTCATGATCAGCGTCTGTCTCTCCACGACATCACAGATCTAGTTGTCCTTCATCTGATATTCAGTGATCATCATCCTCTTCATCAGCGTCATTATCATCGGTCAGTCAGGTCTAGTCCAGTGGCTGTTGATTTGAACAGGAGGGAATCCTTCAAATGATTCGGTTCAGACTGAATCTTTGTGATTTGATAGCAGATGATGAAAGCTGGCTTTGATCTCCTAAATCACACTGAAAAGCAGACGCTCCTGTTCTCCAGCGGGTCCTTTCACACCTGCTCCTTTAGTTCCGCTGAATCACATTAGTGTTCACGTTTCCATTTGATTCAGTCCGTTGTTCACTTCAAGTTCGTGAATACAGCACAATCCTGGAGTGCTTCGTTTATGTTGAGAACGGGATCCAATCAACCCAACAAGCAACAGTAAAGCACACATTTCTGGATTAAACCAGCTGCTGTATTCAgatgtgctgtgcattatgggatggaGACAAGTTTGTTGTTTTTAGAGAAATGTAGGTCGTCATGGGTCCTAAAATCTGTACCTCACTTTATATTAGCAACTGTCGGATGGATACAAGTTATATCTGAGTCAGAAATCAGCTTTTCAGATCCAAGTGGACCTCTAATTTGCTCTAAATAGCCTTTGTTTTAATTCCAGGAGTGGTCATGGAATGCAGTTT

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00065269 True 2759 lncRNA 0.34 2 59168060 59171539

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_033272 CABZ01111575.1 coding downstream 31273 59136671 ~ 59136787 (-)
XLOC_033271 NA coding downstream 99157 59066955 ~ 59068903 (-)
XLOC_033270 NA coding downstream 114855 59050986 ~ 59053205 (-)
XLOC_033269 NA coding downstream 117232 59047907 ~ 59050828 (-)
XLOC_033268 mars1 coding downstream 193041 58921240 ~ 58975019 (-)
XLOC_033274 ndufa4l2b coding upstream 83597 59255136 ~ 59271436 (-)
XLOC_033275 fam210b coding upstream 178918 59350457 ~ 59357256 (-)
XLOC_033276 ppp1r16b coding upstream 199282 59370821 ~ 59388625 (-)
XLOC_033277 NA coding upstream 224308 59395847 ~ 59421470 (-)
XLOC_033278 gli1 coding upstream 254609 59426148 ~ 59505589 (-)
XLOC_033264 NA non-coding downstream 434503 58731298 ~ 58733557 (-)
XLOC_033280 CABZ01117510.1 non-coding upstream 513606 59685145 ~ 59685261 (-)
XLOC_033281 NA non-coding upstream 664091 59835630 ~ 59853683 (-)
XLOC_033283 NA non-coding upstream 802163 59973702 ~ 59974747 (-)
XLOC_033289 NA non-coding upstream 1096268 60267807 ~ 60269211 (-)

Expression


Co-expression Network