LOC110493969 (LOC106565220)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110493969
gene name LOC106565220
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 46243761 ~ 46252957 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021568605.2
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Function


NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036949985.1 False 3900 mRNA 0.48 3 46243866 46252957
XM_021568603.2 True 4147 mRNA 0.48 3 46243924 46252957

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110493964 LOC106565225 coding upstream 416717 45753769 ~ 45827044 (+)
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LOC110493956 LOC106565228 coding upstream 717363 45518726 ~ 45526398 (+)
trnaq-uug-4 NA coding upstream 890212 45353478 ~ 45353549 (+)
LOC110493971 NA coding downstream 22850 46275807 ~ 46278239 (+)
LOC110493972 LOC106565215 coding downstream 49456 46302413 ~ 46346158 (+)
LOC110493973 LOC106565216 coding downstream 100973 46353930 ~ 46361034 (+)
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LOC110493975 chchd6 coding downstream 123303 46376260 ~ 46436526 (+)
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G1455068 NA non-coding upstream 49165 46194377 ~ 46194596 (+)
G1455067 NA non-coding upstream 49553 46193860 ~ 46194208 (+)
G1455066 NA non-coding upstream 49970 46193555 ~ 46193791 (+)
G1455060 NA non-coding upstream 59089 46184448 ~ 46184672 (+)
G1455131 NA non-coding downstream 44552 46297509 ~ 46297720 (+)
G1455166 NA non-coding downstream 129005 46381962 ~ 46386611 (+)
G1455191 NA non-coding downstream 172456 46425413 ~ 46461287 (+)
G1455669 NA non-coding downstream 210429 46463386 ~ 46463600 (+)
G1454824 NA other upstream 385260 45856249 ~ 45858501 (+)
G1454127 NA other upstream 907238 45335294 ~ 45336523 (+)
G1454049 NA other upstream 984190 45258475 ~ 45259571 (+)
G1453914 NA other upstream 1172836 45069971 ~ 45070925 (+)
G1453889 NA other upstream 1192756 45050729 ~ 45051005 (+)
G1456570 NA other downstream 975262 47228219 ~ 47228796 (+)
LOC100135862 LOC106565314 other downstream 1552401 47805358 ~ 47807518 (+)
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LOC110494013 LOC106565177 other downstream 2136125 48389082 ~ 48424478 (+)

Expression



Co-expression Network