LOC110494141 (LOC106565378)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110494141
gene name LOC106565378
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 55811948 ~ 55819195 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021568914.2
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>TU1676826
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>TU1676827
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>TU1676828
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>TU1676825
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021568914.2 False 3786 mRNA 0.36 6 55811948 55818326
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TU1676825 True 1182 lncRNA 0.34 1 55817148 55818329

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110494133 LOC106565377 coding upstream 22019 55785027 ~ 55789929 (+)
LOC118940664 NA coding upstream 22337 55789483 ~ 55789611 (+)
LOC118940663 NA coding upstream 22910 55788910 ~ 55789038 (+)
LOC118940659 NA coding upstream 23632 55788168 ~ 55788316 (+)
LOC118940662 NA coding upstream 24642 55787178 ~ 55787306 (+)
LOC118940477 NA coding downstream 6273 55824599 ~ 55828869 (+)
LOC110493222 NA coding downstream 115246 55933572 ~ 55946587 (+)
LOC110494134 LOC106565385 coding downstream 211797 56030123 ~ 56039321 (+)
LOC110494131 LOC106565386 coding downstream 237965 56056291 ~ 56081057 (+)
LOC110494143 LOC106565389 coding downstream 269823 56088149 ~ 56127481 (+)
G1465932 NA non-coding upstream 205559 55606145 ~ 55606389 (+)
G1465866 NA non-coding upstream 261694 55549921 ~ 55550254 (+)
G1465833 NA non-coding upstream 289808 55521903 ~ 55522140 (+)
G1465770 NA non-coding upstream 334363 55477292 ~ 55477585 (+)
G1465242 NA non-coding upstream 735221 55076458 ~ 55076727 (+)
G1466021 NA non-coding downstream 7214 55825540 ~ 55827889 (+)
G1466081 NA non-coding downstream 112883 55931209 ~ 55932588 (+)
G1466095 NA non-coding downstream 133246 55951572 ~ 55952010 (+)
G1466096 NA non-coding downstream 133733 55952059 ~ 55952379 (+)
LOC110494110 LOC106565356 other upstream 1337476 54471705 ~ 54474472 (+)
LOC110494100 LOC106565348 other upstream 1547332 54256327 ~ 54264616 (+)
G1464092 LOC106565344 other upstream 1622331 54147039 ~ 54189617 (+)
G1460249 LOC106565103 other upstream 4721059 51080132 ~ 51137770 (+)
LOC110494047 btg2 other upstream 4914504 50894903 ~ 50897444 (+)
G1466124 NA other downstream 178322 55996648 ~ 55998347 (+)
G1466131 NA other downstream 197251 56015577 ~ 56016613 (+)
G1466224 gem other downstream 400916 56219242 ~ 56220946 (+)
LOC110494160 LOC105017078 other downstream 762065 56575737 ~ 56584088 (+)

Expression


Co-expression Network