LOC110494662 (LOC106565996)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110494662
gene name LOC106565996
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 79926360 ~ 79930803 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021569927.2
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>XR_002469303.2
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Function

NR:

description
TAR DNA-binding protein 43-like

GO: NA

KEGG:

id description
K23600 TARDBP, TDP43; TAR DNA-binding protein 43

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XR_002469303.2 True 3289 mRNA 0.44 6 79926360 79930803

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110494660 LOC106565999 coding upstream 44108 79874333 ~ 79882252 (+)
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LOC110493268 LOC106582605 coding upstream 82047 79547816 ~ 79844313 (+)
hyal1 LOC106565982 coding upstream 524475 79398640 ~ 79401885 (+)
LOC110493270 LOC106565994 coding downstream 29058 79959861 ~ 79980095 (+)
LOC110495196 LOC106565991 coding downstream 84306 80015109 ~ 80017775 (+)
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LOC110494682 edem1 coding downstream 107923 80038726 ~ 80047063 (+)
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G1493733 NA non-coding downstream 42209 79973012 ~ 79973225 (+)
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tusc2 tusc2 other upstream 540923 79382417 ~ 79387551 (+)
LOC110493267 LOC106565976 other upstream 590288 79321093 ~ 79336076 (+)
G1492310 NA other upstream 1150633 78770747 ~ 78775727 (+)
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G1495362 NA other downstream 1406214 81337017 ~ 81338163 (+)
LOC110494696 LOC106582736 other downstream 1501408 81432188 ~ 81602161 (+)
LOC110494698 LOC106566043 other downstream 1897929 81828571 ~ 81847540 (+)
G1496351 LOC106566032 other downstream 2232403 82163138 ~ 82169750 (+)

Expression


Co-expression Network