LOC118940161


Basic Information

Item Value
gene id LOC118940161
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 82024067 ~ 82026625 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036948438.1
ATGAACAACAAGATGAACAGCAAGATGAACAGTAGGATGAACAGGAAGATGAACAGTAAGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACCACAAGACGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGCAAGATGAACCGCAAGATGACCAACAGGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAGTAGGACGAACAACAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGGACAACAAGATGAGCAGTAGGGTTAACAACAAGATGGACAGTAGGATGAACAGCAagatgaacaaaaatatgaacagtAGGATGAACAACAAGATGGACAGTAAGATGAACAGCAAGATGAACCACAAGATGAACAGTGGGATGAAGAGCAAGATGAACAACAAGTTGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACACCAAGATGAACAGCAAGATGACCAACAGGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGGACAACAAGATGAGCAGTAGCGTGAACAACAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCCAGATGAACAACAAGATGGACAGTTGGATGAACAACAagatgaacaaaaatatgaacaatAGGATGAACAAGATGGACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGACCAACAGGATGAACAGCAAGATGAACATCTATATGAACAGAAGGATGAACAGCAAGATGAATAACAAGATGGACAGTAGGATGAACAGCAagatgaacaaaaatatgaacaataggatgaacaaaaatatgaacaatAGGATGAACAACAAGATGAACAACAAGATGAACAACAAGATGACCAACAGGATGAACAGCAAGATGAGCATCTATATGAACAGAAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAATATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACCACAAGACGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGCAAGATGAACCGCAAGATGACCAACAGGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAGTAGGACGAACAACAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGGACAACAAGATGAGCAGTAGGGTTAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAAAAAGATGAACAGTAGGACGAACCACAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCGAGATGAACAACAAGATGGACAACAAGATGAGCAGTAGGGTGAACAACAAGATGGACAGTAGGATGAACAGCAagatgaacaaaaatatgaacagtAGGATGAACAACAAGATGGACAGTAAGATGAACAGCAAGATGAACCACAAGATGAACAGTGGGATGAAGAGCAAGATGAACAACAAGTTGAACAACAAGATGAACAGCAAGATGACCAACAGGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGGACAACAAGATGAGCAGTAGGGTGAACAACAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCCAGATGAACAAGAAGATGGACAGTTGGATGAACAACAagatgaacaaaaatatgaacaatAGGATGAACAAGATGGACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGACCAACAGGATGAACAGCAAGATGAACATCTATATGAACAGAAGGATGAACAGCAAGATGAATAACAAGATGGACAGTAGGATGAACAGCAagatgaacaaaaatatgaacagtaggatgaacaaaaatatgaacaatAGGATGAACAACAAGATGAACAACAAGATGAACAACAAGATGACCAACAGGATGAACAGCAAGATGAGCATCTATATGAACAGAAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAATATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACATCTATATGAACAGAAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAATATGAACAGTAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAATATGAACAATAGGATGAACAGCAAGATGAACAACAAGATGAACAGTAGGACGAACAGCAATATGAACAACTTTATGAACAGTTGGTTGAACAAGAATATTAACAAGAAGATGAACAATATCGTCCGCTTTTTTCCTCAGTAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036948438.1 True 2559 mRNA 0.39 1 82024067 82026625

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110495197 NA coding upstream 96146 81926651 ~ 81927921 (+)
LOC110494701 LOC106566040 coding upstream 112283 81904768 ~ 81911784 (+)
LOC110494700 tshb coding upstream 131434 81890557 ~ 81892633 (+)
LOC118940109 NA coding upstream 161588 81861551 ~ 81862479 (+)
LOC110494698 LOC106566043 coding upstream 176527 81828571 ~ 81847540 (+)
LOC110494703 LOC106566038 coding downstream 10948 82037573 ~ 82047285 (+)
LOC110494705 LOC106566037 coding downstream 29674 82041470 ~ 82063859 (+)
LOC110494706 LOC106566035 coding downstream 75399 82102024 ~ 82105799 (+)
LOC110494708 LOC106566034 coding downstream 125546 82152171 ~ 82155889 (+)
LOC110493273 LOC106566076 coding downstream 192316 82218941 ~ 82220659 (+)
G1496042 NA non-coding upstream 121943 81901913 ~ 81902124 (+)
G1496040 NA non-coding upstream 123677 81900184 ~ 81900390 (+)
G1496031 NA non-coding upstream 135805 81888039 ~ 81888262 (+)
G1496030 LOC106566041 non-coding upstream 136327 81884283 ~ 81887740 (+)
G1496027 NA non-coding upstream 145988 81873661 ~ 81878079 (+)
G1496261 NA non-coding downstream 40115 82066740 ~ 82067138 (+)
G1496262 NA non-coding downstream 48012 82074637 ~ 82075690 (+)
G1496265 NA non-coding downstream 50937 82077562 ~ 82077769 (+)
G1496267 NA non-coding downstream 53771 82080396 ~ 82080595 (+)
LOC110494696 LOC106582736 other upstream 421910 81432188 ~ 81602161 (+)
G1495362 NA other upstream 685904 81337017 ~ 81338163 (+)
G1495346 NA other upstream 730141 81293440 ~ 81293926 (+)
tusc2 tusc2 other upstream 2638630 79382417 ~ 79387551 (+)
G1496351 LOC106566032 other downstream 136581 82163138 ~ 82169750 (+)
G1497918 NA other downstream 1587640 83614265 ~ 83634495 (+)
LOC110494749 LOC106566083 other downstream 1853307 83879805 ~ 83890067 (+)
G1498583 NA other downstream 2099212 84125837 ~ 84174177 (+)
G1498913 NA other downstream 2469304 84495929 ~ 84497398 (+)

Expression


Co-expression Network