G1452369


Basic Information

Item Value
gene id G1452369
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 43508719 ~ 43565770 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1661848
tgtcttgtcttgtcctgccctgccctgtcttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcctgtcctgtcttgtcttgtcctgtcctgtcctgtcttgtactgccctgtcttgtcctgccttgtcttgtcctgccctgtcctgtcctgccctgtcctgtcctgtcctgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccctgccctgccttgtcttgtcctgccttgtcctgtcctgccctgtcctgtcctgtcctgtcctgtcctgtcttgtcttgtcttgccctgtcttgtcctgccttgtcttgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgtcttgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcctgtcctgtcttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcttgccctgtcctgccttgtcttgcactgtcctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcctgtcctgtcttgcactgtcttgtcctgccctgtcctgtctttttttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcttgccttgtcctaacttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcatgccttgtcttgccctgtcctgccttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgccttgtcctgccttgtcttgccttgccctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcttgccctgacctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcttgccttgtcctgccttgtattgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgcctg
>TU1661859
tgtcttgtcttgtcctgccctgccctgtcttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcctgtcctgtcttgtcttgtcctgtcctgtcctgtcttgtactgccctgtcttgtcctgccttgtcttgtcctgccctgtcctgtcctgccctgtcctgtcctgtcctgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccctgccctgccttgtcttgtcctgccttgtcctgtcctgccctgtcctgtcctgtcctgtcctgtcctgtcttgtcttgtcttgccctgtcttgtcctgccttgtcttgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgtcttgtcctgccctgccttgtcctgtccagtcctgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcttgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgccctgccctgtcttgtcttgtcttgtcttgccttgtcctgtcttgtcttgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgtcttgtcttgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgtcctgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcctgtcttgcct
>TU1661856
gttacaattggcaattgccatatggcatttgccatATACTTTACACGAATCAACGCCGCtttgggtggtattggacatcgtgtatatggtttgtccaatgccaatatgttgccattcatttttgtccaattcaggggggtattcccttacttgtcttgtcttgtcttgtcctgccttgtcttgtcctgccctgccctgccctgccttgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgacctgccttgccttgtcctgtcctgtcctgtcctgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgacctgccttgccttgtcctgtcctgtcctgtcctgtcttgccctgccctgccttgtcttgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcctgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcctgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgccctgccctgtcttgtcctgccttgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcctgtcttgtcttgtcttgtcctgccctgccctgccctgccttgccctgccctgccttgtcttgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgccctgccctgccctgtcttgccttgtcttgtcttgtcttgtcctgccttgtcctgtcctgccttgtcctgtcctgccctgtcctgtcctgtcctgtcctgccctgtcctgtcctgccctgccctgccctgccc
>TU1661863
cagtcttgtcctgtcttgtcctgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgccctgccctgtcttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcctgtcctgtcttgtcttgtcctgtcctgtcctgtcttgtactgccctgtcttgtcctgccttgtcttgtcctgccctgtcctgtcctgccctgtcttgtcttgtcttgtcctgtcttttcctgccctgtcttgtcctgtcctgccctgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgtcttgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcctgccctgccttttcctgccttgtcttgtcctgccctgtcctgtcctgtcttgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccttgtcttgtcttgtcttgtcctgccttgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgtcttgtcctgtcttgtcctgtcttgtcctgccctgtcctgtcttgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgccttgtcttgtcttgtcctgccctgtcctgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccttgtcctgtcttgtcttgtcctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcctgtcctgccctgtcttgtc
>TU1661864
cagtcttgtcctgtcttgtcctgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgccctgccctgtcttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcctgtcctgtcttgtcttgtcctgtcctgtcctgtcttgtactgccctgtcttgtcctgccttgtcttgtcctgccctgtcctgtcctgccctgtcttgtcttgtcttgtcctgtcttttcctgccctgtcttgtcctgtcctgccctgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgtcttgtcctgccctgtcttgtcctgtcctgccctgtcttgtcctgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcttgtcttgtcctgccttgtcctgccctgtcttgtcctgccctgtcctgtcctgtcttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcttgccctgtcctgccttgtcttgcactgtcctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcctgtcctgtcttgccctgtcctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcctgtcctgtcctgtcttgcactgtcttgtcctgccctgtcctgtctttttttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcttgccttgtcctaacttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcatgccttgtcttgccctgtcctgccttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcctgcattgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcttgccctgacctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgcctt
>TU1661862
ccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcctgtcctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcctgtcttgcct
>TU1661851
ccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccttgtcctgtcttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttttcttgtcctgccttgtcttgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttctcctgtcttgccttgtcctgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcttgccttgtcctgtcttgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgccctgtcctgccctgtcttgccctgtcttgtcttgtcttgtcttgtcttgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgtcttgtcttgtcctgtcctgtcttgtcctgtcttgccctgtcctgtcctgtcctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgccttgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcttgccctgtcctgtcctgtcttgcct

Function

NR:

description
Atrial natriuretic peptide receptor 1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1661848 False 1626 lncRNA 0.57 3 43508719 43552834
TU1661859 False 735 lncRNA 0.56 2 43508719 43562011
TU1661856 False 826 TUCP 0.54 3 43541664 43563701
TU1661863 False 780 lncRNA 0.56 5 43542369 43565770
TU1661864 False 1572 lncRNA 0.57 6 43542369 43555284
TU1661862 False 283 lncRNA 0.59 3 43554431 43562011
TU1661851 True 813 lncRNA 0.56 3 43555791 43562011

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118940464 LOC107581013 coding upstream 49516 43458743 ~ 43459203 (+)
LOC118940465 zgc:163040 coding upstream 50463 43445921 ~ 43458256 (+)
LOC118940460 LOC108414267 coding upstream 56286 43450554 ~ 43452433 (+)
LOC118940462 LOC103395674 coding upstream 66683 43441506 ~ 43442036 (+)
LOC118940146 LOC106906734 coding upstream 67567 43440766 ~ 43441152 (+)
plxnb1b LOC106565257 coding downstream 374147 43939917 ~ 44074496 (+)
LOC110493929 LOC106565256 coding downstream 516526 43985916 ~ 44097283 (+)
setd5 LOC106565254 coding downstream 533186 44098956 ~ 44148363 (+)
mtmr14 mtmr14 coding downstream 706514 44272284 ~ 44315602 (+)
LOC110493933 LOC106565248 coding downstream 758945 44324715 ~ 44545834 (+)
G1452364 NA non-coding upstream 10959 43497536 ~ 43497760 (+)
LOC118940144 LOC106024139 non-coding upstream 167333 43332315 ~ 43341386 (+)
G1452090 NA non-coding upstream 181787 43326718 ~ 43326932 (+)
G1452089 NA non-coding upstream 182021 43326395 ~ 43326698 (+)
G1452087 NA non-coding upstream 187697 43320785 ~ 43321022 (+)
G1452394 NA non-coding downstream 1631 43567401 ~ 43574306 (+)
G1452398 NA non-coding downstream 33890 43599660 ~ 43599912 (+)
G1452401 NA non-coding downstream 69362 43635132 ~ 43635333 (+)
G1452406 NA non-coding downstream 100513 43666283 ~ 43666899 (+)
G1452408 NA non-coding downstream 122525 43688295 ~ 43688514 (+)
G1452362 NA other upstream 16651 43491174 ~ 43492068 (+)
G1452359 NA other upstream 25026 43482260 ~ 43483693 (+)
G1451948 LOC570405 other upstream 48887 43328586 ~ 43459832 (+)
G1451956 LOC106958509 other upstream 98903 43329099 ~ 43409816 (+)
G1450387 NA other upstream 1618204 41792883 ~ 41890515 (+)
G1452399 NA other downstream 40543 43606313 ~ 43606781 (+)
G1452804 LOC105896813 other downstream 947299 44513069 ~ 44520477 (+)
G1453605 LOC106565239 other downstream 1270227 44835997 ~ 44854739 (+)
G1453889 NA other downstream 1484959 45050729 ~ 45051005 (+)
G1453914 NA other downstream 1504201 45069971 ~ 45070925 (+)
G1452366 NA non-coding upstream 24288 43499894 ~ 43517376 (+)

Expression


Co-expression Network