G1474425 (LOC106565679)


Basic Information

Item Value
gene id G1474425
gene name LOC106565679
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 63133825 ~ 63145087 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1686196
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>TU1686197
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Function

NR:

description
integrin beta-7-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1686196 False 6387 TUCP 0.44 2 63133825 63140248
TU1686197 True 6189 TUCP 0.44 3 63133825 63145087

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110494331 LOC106565516 coding downstream 116751 62990855 ~ 63022358 (-)
smarcc2 LOC106583239 coding downstream 148923 62971037 ~ 62984902 (-)
LOC110493237 endou coding downstream 183374 62941748 ~ 62950451 (-)
LOC110494326 LOC106565520 coding downstream 193974 62935363 ~ 62939851 (-)
LOC110494325 LOC106565522 coding downstream 215653 62848969 ~ 62918172 (-)
LOC110494336 LOC106565676 coding upstream 56349 63201436 ~ 63210497 (-)
LOC110494343 LOC106565671 coding upstream 126698 63271785 ~ 63352919 (-)
LOC110494345 LOC106565669 coding upstream 227893 63372980 ~ 63396065 (-)
LOC110494346 LOC106565668 coding upstream 258764 63403851 ~ 63409818 (-)
LOC110494348 LOC106565663 coding upstream 339387 63484474 ~ 63489636 (-)
G1474393 NA non-coding downstream 88066 63045527 ~ 63045759 (-)
G1474389 NA non-coding downstream 96045 63037531 ~ 63037780 (-)
G1474358 NA non-coding downstream 181012 62952562 ~ 62952813 (-)
G1474489 espl1 non-coding upstream 41232 63186319 ~ 63188421 (-)
G1474446 pfdn5 non-coding upstream 43488 63188575 ~ 63195159 (-)
G1474447 NA non-coding upstream 55080 63200167 ~ 63201204 (-)
G1474494 NA non-coding upstream 68844 63213931 ~ 63214137 (-)
G1474500 NA non-coding upstream 73595 63218682 ~ 63218912 (-)
G1474395 NA other downstream 33073 63048639 ~ 63100752 (-)
G1473866 NA other downstream 403322 62730153 ~ 62730503 (-)
ccdc174 NA other downstream 883187 62246379 ~ 62250654 (-)
G1471564 NA other downstream 2494490 60638180 ~ 60639335 (-)
G1471219 srgap3 other downstream 2757233 60375633 ~ 60376864 (-)
G1474741 LOC100136012 other upstream 365029 63510116 ~ 63510543 (-)
mrpl20 mrpl20 other upstream 950020 64094912 ~ 64097564 (-)
G1475493 NA other upstream 989092 64134179 ~ 64135341 (-)
G1475896 LOC106565632 other upstream 1433241 64578328 ~ 64579253 (-)

Expression


Co-expression Network