G1476471


Basic Information

Item Value
gene id G1476471
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 65617667 ~ 65620002 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1688591
taatagtagtggtgtaatagtgttaatagtatcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtggtggtgtaatagtgttaatagtagctgtagtagtggtgtattagtgttaatagtagcagtagtgatgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaataggattaatagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagcagtagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtggtggtgtAATAGTCTtaatagtagctgtagtagtggtGTATTAGTGTTAATAGCAGTactagtggtgtaatagtgttaatagtagtggtgtaatagtgttaatagtatcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtggtggtgtaatagtgttaatagtagctgtagtagtggtgtattagtgttaatagtagcagtagtgatgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtattaatagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtaatggtttaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagtggtgtaatagtgttaatagtatcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtggtggtgtaatagtgttaatagtagctgtagtagtggtgtattagtgttaatagtagcagtagtgatgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaataggattaatagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtaatggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtattaatagcagtagtggtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtattaatagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtaatGGTGTAATAGTATTAATagcagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtggtggtgtAATAGTCTtaatagtagctgtagtagtggtGTATTAGTGTTAATAGCAGTactagtggtgtaatagtgttaatagttgtagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagtggtgtaatagtgttaatagtatcagtagtagtggtgtaataatgttaatagtatcagtagtagtggtgtaataatgttaatagtagtggtgtaatagtgttaatagtatcagtagtggtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaacaGTGTTAATTGCAtcagtagtggtgtaatagtgttaatagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtgatgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagtgGTGTATTAgtgttaatagtagcagtagtagtggtgtattAGTGTTAATAGCAGTactagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaacaGTGTTAATTGCAtcagtagtggtgtaatagtgttaatagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtgttaatagtagtggtgtaatagtgttaatagtagcagtagtgatgtaatagtgttaatagtagcagtagtagtggtgtaatagtattaatagcagtagtagtggt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1688591 True 1899 lncRNA 0.33 2 65617667 65620002

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110494410 LOC106565693 coding upstream 38723 65572367 ~ 65578944 (+)
LOC118940487 oncmyk-dab coding upstream 65010 65523697 ~ 65552657 (+)
LOC118940493 NA coding upstream 162837 65453352 ~ 65454830 (+)
LOC110494396 LOC106565619 coding upstream 602877 64996582 ~ 65014790 (+)
LOC110494394 LOC106565623 coding upstream 703473 64896863 ~ 64914194 (+)
LOC110494417 LOC106565918 coding downstream 771394 66391396 ~ 66401187 (+)
pax7a pax7a coding downstream 845453 66465455 ~ 66527607 (+)
park7 park7 coding downstream 939475 66559477 ~ 66566440 (+)
kcnab2a kcnab2 coding downstream 946777 66566779 ~ 66780792 (+)
akr7a3 LOC100194670 coding downstream 1165514 66785516 ~ 66790374 (+)
G1476599 NA non-coding upstream 76255 65540441 ~ 65541412 (+)
G1476460 NA non-coding upstream 79716 65534720 ~ 65537951 (+)
G1476568 NA non-coding upstream 117148 65441015 ~ 65500519 (+)
G1476551 NA non-coding upstream 215032 65395711 ~ 65402635 (+)
G1476642 NA non-coding downstream 34336 65654338 ~ 65654572 (+)
G1476858 NA non-coding downstream 63215 65683217 ~ 65683552 (+)
G1476861 NA non-coding downstream 67836 65687838 ~ 65688040 (+)
G1476870 NA non-coding downstream 83447 65703449 ~ 65703883 (+)
G1476872 NA non-coding downstream 86422 65706424 ~ 65706684 (+)
G1476569 NA other upstream 150900 65418091 ~ 65466767 (+)
G1476520 NA other upstream 290504 65325877 ~ 65327163 (+)
G1476510 NA other upstream 313539 65303417 ~ 65304128 (+)
LOC110494389 NA other upstream 837192 64755321 ~ 64780475 (+)
LOC110494386 LOC106565630 other upstream 995498 64608194 ~ 64625111 (+)
G1476898 NA other downstream 161777 65781779 ~ 65783335 (+)
G1477313 NA other downstream 668870 66288872 ~ 66290448 (+)
G1477578 LOC100194703 other downstream 937035 66557037 ~ 66557512 (+)
G1477697 NA other downstream 1097371 66717373 ~ 66718688 (+)

Expression


Co-expression Network