G1499225


Basic Information

Item Value
gene id G1499225
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 84914942 ~ 84916728 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1713952
tctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggcgtcaatatgccacacacacaatatgtaTGCGCGTGTGTACACAGAAAATTTGCAGGTGTTAAAATCTCGTTGTAAAGGTGAAAAGTGTCATGAGTCTTCTACATACCTGAGCGTTGATGctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaatACCAGTGtcatatctgagtgttgattctagtggggttaatACCAGTGtcatatctgagtgttgattctagtgcggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtgaGGTTAACACTagtgttatatctgagtgttgattctagtgcggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattatagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgggtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttataactgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaaaaccagtgttatatctgagtgttgattctagtgaggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgggtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttataactgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtggggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagtgaggttaacaccagtgttatatctgagtgttgattctagttGATTctaatcttctgtataccacccctatcttgtcacaacacaactgattggttcaaacgcattaagaaagaaagacattccacaaatttacttttaagaaggcacaccgtttcattgaaatgcattccaggtgattacctcttgaagctggttgagagaatgccaagagtgtacaaagctgttatcaatatattttgatttgtttaacactttttttggttacaacatgattccatatgtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1713952 True 1547 lncRNA 0.40 2 84914942 84916728

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
aurka stk6 coding upstream 35682 84871814 ~ 84879260 (+)
LOC110494766 LOC106566111 coding upstream 45560 84858685 ~ 84869382 (+)
LOC110494765 LOC106566109 coding upstream 57473 84853325 ~ 84857469 (+)
ddx19 LOC106566108 coding upstream 66591 84840517 ~ 84848351 (+)
si:dkey-33m11.6 LOC105030694 coding upstream 115954 84797188 ~ 84798988 (+)
LOC118940501 NA coding downstream 31617 84948345 ~ 84950742 (+)
LOC118940502 ppp1r16b coding downstream 125445 85042173 ~ 85212327 (+)
fam210b LOC106566122 coding downstream 312963 85229691 ~ 85241799 (+)
LOC110494772 LOC105007909 coding downstream 352394 85269122 ~ 85288116 (+)
LOC118940504 NA coding downstream 402675 85319403 ~ 85320964 (+)
G1499215 NA non-coding upstream 21970 84892733 ~ 84892972 (+)
G1499197 NA non-coding upstream 78406 84827206 ~ 84836536 (+)
G1499180 NA non-coding upstream 141773 84772884 ~ 84773169 (+)
G1499177 NA non-coding upstream 144963 84769648 ~ 84769979 (+)
G1499169 NA non-coding upstream 176755 84737312 ~ 84738187 (+)
G1499238 NA non-coding downstream 40928 84957656 ~ 84958022 (+)
G1499257 NA non-coding downstream 84959 85001687 ~ 85001910 (+)
G1499258 NA non-coding downstream 85445 85002173 ~ 85002501 (+)
G1499266 NA non-coding downstream 108643 85025371 ~ 85028920 (+)
G1499263 NA non-coding downstream 113221 85029949 ~ 85033529 (+)
G1499159 NA other upstream 103757 84810531 ~ 84811185 (+)
LOC110493283 LOC106566114 other upstream 122442 84789132 ~ 84793175 (+)
LOC110493280 LOC106566113 other upstream 229559 84379789 ~ 84685383 (+)
G1498912 NA other upstream 349335 84516117 ~ 84567678 (+)
G1498913 NA other upstream 417544 84495929 ~ 84497398 (+)
G1499347 NA other downstream 298065 85214793 ~ 85216073 (+)
G1499374 NA other downstream 375057 85291785 ~ 85293121 (+)
G1499923 LOC106566127 other downstream 708715 85625443 ~ 85711859 (+)
G1500198 NA other downstream 1350600 86267328 ~ 86268175 (+)

Expression


Co-expression Network