G1499347


Basic Information

Item Value
gene id G1499347
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 85214793 ~ 85216073 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1714100
ttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggcagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagtagaagggtgttttactatgtcagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagtagaagggtgttttactatggtaaaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatgtcagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggcagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatgtcagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagtagaagggtgttttactatggtaaaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatgtcagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagtagaagggtgttttactatggcagaagggtgttttactatggtagaagtagaagggtgttttactatgtcagaagggtattttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgtttactatgtcagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatgtcagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatggtagaagggtgttttactatgtcagaagggtgttttactatagtagaagggtgtttt

Function

NR:

description
mucin-1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1714100 True 1281 TUCP 0.38 1 85214793 85216073

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118940502 ppp1r16b coding upstream 2466 85042173 ~ 85212327 (+)
LOC118940501 NA coding upstream 264051 84948345 ~ 84950742 (+)
aurka stk6 coding upstream 335533 84871814 ~ 84879260 (+)
LOC110494766 LOC106566111 coding upstream 345411 84858685 ~ 84869382 (+)
LOC110494765 LOC106566109 coding upstream 357324 84853325 ~ 84857469 (+)
fam210b LOC106566122 coding downstream 13618 85229691 ~ 85241799 (+)
LOC110494772 LOC105007909 coding downstream 53049 85269122 ~ 85288116 (+)
LOC118940504 NA coding downstream 103330 85319403 ~ 85320964 (+)
LOC118940506 NA coding downstream 111189 85327147 ~ 85362000 (+)
LOC110493284 LOC106566126 coding downstream 514469 85730542 ~ 85824609 (+)
G1499344 NA non-coding upstream 16612 85195899 ~ 85198181 (+)
G1499331 NA non-coding upstream 63945 85149455 ~ 85150848 (+)
G1499276 NA non-coding upstream 165643 85048067 ~ 85049150 (+)
G1499263 NA non-coding upstream 181264 85029949 ~ 85033529 (+)
G1499266 NA non-coding upstream 185873 85025371 ~ 85028920 (+)
G1499348 NA non-coding downstream 61 85216134 ~ 85216364 (+)
G1499157 NA non-coding downstream 5042 85221115 ~ 85221484 (+)
G1499156 NA non-coding downstream 7440 85223513 ~ 85225700 (+)
G1499155 NA non-coding downstream 26590 85242663 ~ 85244786 (+)
G1499366 NA non-coding downstream 55848 85271921 ~ 85272726 (+)
G1499159 NA other upstream 403608 84810531 ~ 84811185 (+)
LOC110493283 LOC106566114 other upstream 422293 84789132 ~ 84793175 (+)
LOC110493280 LOC106566113 other upstream 529410 84379789 ~ 84685383 (+)
G1498912 NA other upstream 649186 84516117 ~ 84567678 (+)
G1498913 NA other upstream 717395 84495929 ~ 84497398 (+)
G1499374 NA other downstream 75712 85291785 ~ 85293121 (+)
G1499923 LOC106566127 other downstream 409370 85625443 ~ 85711859 (+)
G1500198 NA other downstream 1051255 86267328 ~ 86268175 (+)
G1500239 NA other downstream 1166225 86382298 ~ 86383545 (+)

Expression


Co-expression Network