G1500565


Basic Information

Item Value
gene id G1500565
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 85795822 ~ 85827130 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1715646
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>TU1715648
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>TU1715649
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>TU1715651
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>TU1715653
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Function

NR:

description
PREDICTED: microtubule-associated protein 6-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1715646 False 990 lncRNA 0.51 8 85795822 85827130
TU1715648 False 1400 lncRNA 0.54 7 85795822 85827130
TU1715649 False 2788 lncRNA 0.56 5 85795822 85827130
TU1715651 False 1237 lncRNA 0.53 7 85795822 85827130
TU1715653 True 3215 lncRNA 0.56 4 85795822 85827130

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110494776 LOC106566127 coding downstream 82692 85710201 ~ 85713130 (-)
LOC110494775 LOC106566119 coding downstream 370428 85344521 ~ 85425394 (-)
shmt2 shmt2 coding downstream 453156 85300306 ~ 85342666 (-)
LOC110493286 LOC106566136 coding upstream 291445 86118575 ~ 86183605 (-)
LOC110494779 ddit3 coding upstream 409424 86236554 ~ 86242991 (-)
dctn2 LOC106566142 coding upstream 422102 86249232 ~ 86276059 (-)
igsf8 igsf8 coding upstream 713669 86540799 ~ 86555989 (-)
sp7 sp7 coding upstream 778810 86605940 ~ 86610581 (-)
G1500557 NA non-coding downstream 16872 85776280 ~ 85778950 (-)
G1500533 NA non-coding downstream 27826 85721611 ~ 85767996 (-)
G1500504 NA non-coding downstream 44479 85669647 ~ 85751343 (-)
G1500517 NA non-coding downstream 112718 85682675 ~ 85683104 (-)
G1500513 NA non-coding downstream 113500 85677329 ~ 85682322 (-)
G1500587 NA non-coding upstream 5099 85832229 ~ 85834039 (-)
G1500624 NA non-coding upstream 97888 85925018 ~ 85925783 (-)
G1500627 NA non-coding upstream 105948 85933078 ~ 85933418 (-)
G1500652 NA non-coding upstream 165525 85992655 ~ 85993163 (-)
G1500666 NA non-coding upstream 204920 86032050 ~ 86032503 (-)
G1499684 NA other downstream 507705 85251788 ~ 85288117 (-)
G1499671 NA other downstream 572703 85221125 ~ 85223119 (-)
G1498522 NA other downstream 1738430 84051010 ~ 84057392 (-)
G1498442 NA other downstream 1812928 83982341 ~ 83982894 (-)
G1498077 NA other downstream 2190069 83605243 ~ 83605753 (-)
G1500834 LOC106566150 other upstream 622549 86449679 ~ 86450734 (-)
LOC110493290 map3k12 other upstream 970935 86798065 ~ 86880836 (-)
G1501650 LOC106566166 other upstream 1306928 87134058 ~ 87166800 (-)
G1501745 NA other upstream 1567650 87394780 ~ 87395835 (-)

Expression


Co-expression Network