G1502566


Basic Information

Item Value
gene id G1502566
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 88550366 ~ 88552831 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1718044
CAGCTAGATAATGTTCTATCTACAGTATGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAgataatgttgtatctacagtatggtCCAGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAgataatgttgtatctacagtatggtCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGACCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGACCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATAATGTATCTACAATATGGTCCTGTCTAAGGAGTGATCAGCTAGATAATGATGTATCTACAATATGGTCTTGTCTAAGGAGTGATCAGCTAGATAATGATGTATCTACAATATGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAgataatgttgtatctacagtatggtCCAGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAgataatgttgtatctacagtatggtCCAGTCTAGTGAGTGATCAAATAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATGATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCATGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTATAATGAGTAATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAgataatgttgtatctacagtatggtCCAGTCTAATGAGTGATCAGCTAgataatgttgtatctacagtatggtCCAGTCTAGTGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGGTAATGTTGTATCTCTGATTCTGTCTAATGAGTAATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAAGGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGCATTGCTGGTCCTGTCTAATGAGTAATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATATTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTAATCAGCTAGATAATGCTGTGTCTTTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTAATCAGCTAGATAATGTTGTGTCTTTGGTCCTGTCAAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTGTCTTTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTTGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTACTGAGTGATCAGCTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCAGCTAGATAATGTTTTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTAATCAGCTAGATAATGTTTTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGCTCATTTAGATAATGTTGTATCTCTGGTCCTGTCTAATGAGTGATCCGCTAAACGTTGGTGACTGCATCAAGTCAGTCAATGGCATCAACC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1718044 True 1859 TUCP 0.39 3 88550366 88552831

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
zgc:171566 LOC106566184 coding downstream 304861 88233684 ~ 88245505 (-)
LOC110494815 NA coding downstream 366609 88181683 ~ 88183757 (-)
dnsl3 dnsl3 coding downstream 375021 88162116 ~ 88175346 (-)
LOC110493297 LOC106566189 coding downstream 391362 88144616 ~ 88159004 (-)
LOC110495200 LOC106566159 coding downstream 1042778 87494104 ~ 87507588 (-)
LOC110493292 NA coding upstream 320089 88872775 ~ 88877452 (-)
LOC118940510 LOC106566201 coding upstream 349027 88901858 ~ 88907675 (-)
pcbp4 LOC106566209 coding upstream 1024741 89575961 ~ 89725809 (-)
LOC118940164 NA coding upstream 1246843 89799674 ~ 89801444 (-)
LOC110494821 NA coding upstream 1950445 90503276 ~ 90504931 (-)
G1502561 NA non-coding downstream 7093 88542888 ~ 88543273 (-)
G1502539 NA non-coding downstream 14902 88484936 ~ 88535464 (-)
G1502537 NA non-coding downstream 66681 88482851 ~ 88483685 (-)
G1502533 NA non-coding downstream 77266 88472857 ~ 88473100 (-)
G1502528 NA non-coding downstream 98596 88451510 ~ 88451770 (-)
G1502576 NA non-coding upstream 17561 88570392 ~ 88570597 (-)
G1502587 NA non-coding upstream 51344 88604175 ~ 88605272 (-)
G1502588 NA non-coding upstream 57881 88610712 ~ 88611461 (-)
G1502599 NA non-coding upstream 80045 88632876 ~ 88633098 (-)
G1502603 NA non-coding upstream 84233 88637064 ~ 88638415 (-)
G1502489 NA other downstream 124861 88358152 ~ 88425505 (-)
G1501745 NA other downstream 1154531 87394780 ~ 87395835 (-)
G1501650 LOC106566166 other downstream 1391122 87134058 ~ 87166800 (-)
LOC110493290 map3k12 other downstream 1743835 86798065 ~ 86880836 (-)
G1503624 NA other upstream 1133584 89686415 ~ 89686877 (-)
G1505789 NA other upstream 3562462 92115293 ~ 92170717 (-)
G1506160 NA other upstream 3785222 92338053 ~ 92339443 (-)

Expression


Co-expression Network