G1505523


Basic Information

Item Value
gene id G1505523
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 91707529 ~ 91713623 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1721542
TCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACGCTCCTCCACAGCTATTATTTAAAAAGTTGTGTTGTCGTCTGCTGACACCCAGAGTTCCAAACTCATTCTTatttattgaatacattttttttctttataCTCTTATTAATATGTATAAAAAATATGATAATGGCATTTCCACCTAGTTGGTGAAGGAAGACCTTTCTATCAGTCTACTTGGCAGGGCTTTGTAATGTGTTATTGTCCAGAAATACATTGTTCTGGTTAATTAACAACGGAGAAATGCTTTGGAGGACTAAAATAGGTTTAGAAAGCAACTTGCTAGAAAAGCAACTTGCTAGACATGTATTACCATCTTCTAACAAAACAAAACTGAAAAAAGTGTTATCTTAATTTGTTTTAACCTTTTTAAAAAAGGGGGCATTTGCATAAAATGAAGTTTCCTAAAGGAAAATGTGTTTTAGTTTGCGGCCAAACAAACCACCAGAGACGACAGcagcgttccaaatggcaccctattccctatagtgtactactatagaccagagccctattccttatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccttatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccttattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagaaccctattcccaatagtgtactactttagaccagagccctattccctatagtgtactacaatagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgtactactatagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgtactactttagaccatagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcacttctttagaccatagccctattccctatagtgtactactttagaccatagccctattccctatagtgtactactttagaccagagccctattccctatagtgtactacttgtatttttattaaatttaacctttatttaactaggtaagtaaattaagaacaaattcttatttacaatgacggccaaaaccggacaacgctgagccaattgtgtgccgccctttgggactcccaatcgcggccggttgtgatacagcctggaatcaaaccagggtctgtagtgacacctctagctaCACCTCtagctacttttgaccagagcccaatggtccctggtcaaaagtagtgcactatatagggaatagggtgccattttgaacaAAGATAATGGAATATACTAATCAAAATGTTACAAAAGATGAAAAGGAAAATCCACACGAGTCAATaaagggaggagaagaagaagtggGAATTCTTCCTCTGTGGTTGATGTTATCAGTGTTTCCATAGATCTGAGAAATTACTTgtagaagaaaaatatatatatatattacccgAGAGTATCTTtttccttttgttgttgttgcatggaTGGATATTTTTTTAAGAATTATAATATGACATCTTTATGACAACTTTGAATGTGAgctataaaacatttatttaaga
>TU1721543
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>TU1721546
TCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACGCTCCTCCACAGCTATTATTTAAAAAGTTGTGTTGTCGTCTGCTGACACCCAGAGTTCCAAACTCATTCTTatttattgaatacattttttttctttataCTCTTATTAATATGTATAAAAAATATGATAATGGCATTTCCACCTAGTTGGTGAAGGAAGACCTTTCTATCAGTCTACTTGGCAGGGCTTTGTAATGTGTTATTGTCCAGAAATACATTGTTCTGGTTAATTAACAACGGAGAAATGCTTTGGAGGACTAAAATAGGTTTAGAAAGCAACTTGCTAGAAAAGCAACTTGCTAGACATGTATTACCATCTTCTAACAAAACAAAACTGAAAAAAGTGTTATCTTAATTTGTTTTAACCTTTTTAAAAAAGGGGGCATTTGCATAAAATGAAGTTTCCTAAAGGAAAATGTGTTTTAGTTTGCGGCCAAACAAACCACCAGAGACGACAGcagcgttccaaatggcaccctattccctatagtgtactactatagaccagagccctattccttatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccttatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcacttctttagaccatagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccatagcCCCATtccctatagtgtactactttagaccatagccctattccctatagtgtactactttagaccagagccctattccctatagtgtactacttgtatttttattaaatttaacctttatttaactaggtaagtaaattaagaacaaattcttatttacaatgacggccaaaaccggacaacgctgagccaattgtgtgccgccctttgggactcccaatcgcggccggttgtgatacagcctggaatcaaaccagggtctgtagtgacacctctagctaCACCTCtagctacttttgaccagagcccaatggtccctggtcaaaagtagtgcactatatagggaatagggtgccattttgaacaAAGATAATGGAATATACTAATCAAAATGTTACAAAAGATGAAAAGGAAAATCCACACGAGTCAATaaagggaggagaagaagaagtggGAATTCTTCCTCTGTGGTTGATGTTATCAGTGTTTCCATAGATCTGAGAAATTACTTgtagaagaaaaatatatatatatattacccgAGAGTATCTTtttccttttgttgttgttgcatggaTGGATATTTTTTTAAGAATTATAATATGACATCTTTATGACAACTTTGAATGTGAgctataaaacatttatttaaga
>TU1721547
gtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtctgtcggtCATCTAATTTAGAAACCGGTCCGTTATATATTGTTGCTTTTTATACTCATCTCTCTTATTCAGTTCCAAAAACCGACTGTTTCATTTAAAGTTGTAGAATGTaattatttaaatatatttagttCCTGATCTTGGTCAGTCCCTCCCTCTACCAGTGTCTGGTATTTAGGCCGGTCCCAGCCCAGGTATGTCTGGGCCATGTCCCATTGGGACTCCCGTCATCCTTACAACTTTCTCTGATTTTATGATCTTGAAAATATCAAATATCtctttcctttaaaaaaaaaaattgcactgtAGAAGGTGAATTGAAAGCATCAAAgcatgattattataatttttaaaaaaaatgtttttaaaatgttactTATTTTCTTCTGGCGGCGTTTAAGTCACGTCAAGGGTCGGATTTCTCGCCAGACCTGGATTCAAATCATTTCAGATACTTTAAGcagggcttgattgagcttgcatGGCAAAATGAAACAAATAGAATAGTCACAAAACTGCAAATCCTCCTGCCCGTGATCTGGAACAACAGGCACACTGAAGTCAACACTCAAAGCATTTAAAAGATTTTGAGAAACATACAGGGAGcatctacagtcctgttatgtccTCTCTGATTTTGAAGTAgtacttgaacccaggtctgctactCTCTCACCACCGATACACAGTGAACCCTTGGTCCTCCATTTTAACACATGTAGCAGAAAGTTAGTAAGAGATTGTCCACTCttcctccaccactctcttcctcttctgtGTCCTCCCTTTGTCCCCCAACCTACTCACCATGGAGTGAGAGGCAGTCATTTGGGTTAGGGTGTTTCTCTGTGTAGATTGGTTGTAGAATGTTGCACTGTAGCCATAAATCATAACAGTTGATGTGGATAATTTTTTCCCCCTCCTCTGCTGTTAGAGATGAGAGCTTTACTGTAAAACAGGGAAGAGCAGCATGCTCTGGCAGGATGCAGGTCTGGTCTTTTTTTCAGTTGAATATCACTGATAGGTGTGTGTACACTTTCCCCAAATGTGTAAAGAACAGGAAGGCCCTCACACTGTTGATGCTCCACGCGCTTTATCAACAACGTTTCAATCCGACACAGCCCAGTCACAAAGTTTTTAAGGACGTGCGTATGACCACACAACCTTtctaacaaataaaaataaacgttcccaaaattcccaggttttatCGAGAAACCCCAGTTGGAAGGTTCCCAGAATCATGGATGGCGTAAAGCAGGAAATCCGGAATCCTTCTATCAATAGTTCTGGAAAAACCTATGGGTTTTTGGGGGGAAGTTACCAGAACTTTGCAACCCTACTCTGACTAAAAGCACTACTGTGCTATAATATTTTATCTTTAAGTCTATCTATGCTCTAATTCTACACAAGCACGTGAACTGACTTTTTAGACGTGTCCAGAATTATAAAACCACTTATTACTACTGCAGTCAGATTAGCTCAACATAACAAAACTGTTGACTGACTTAAGGTTTAGAGATGTATCTACTACATTCTATTCTGACTCTAGAACCAAATCTATTCGGTTCTAGAACCAATTCTATTCGGTTCTAGAACCAATTCTATTCGGTTCTAGAACCAATTCTATTCGGTTCTAGAACCAATTCTATTcggttctatttgtgtttcaatTTGTGCTCCCTTGTTTCTGGATATTGCCGTTTATGGAGAAAATAGTTTCCAGTAAAAAAAATCAAGTCACGCTCCTCCACAGCTATTATTTAAAAAGTTGTGTTGTCGTCTGCTGACACCCAGAGTTCCAAACTCATTCTTatttattgaatacattttttttctttataCTCTTATTAATATGTATAAAAAATATGATAATGGCATTTCCACCTAGTTGGTGAAGGAAGACCTTTCTATCAGTCTACTTGGCAGGGCTTTGTAATGTGTTATTGTCCAGAAATACATTGTTCTGGTTAATTAACAACGGAGAAATGCTTTGGAGGACTAAAATAGGTTTAGAAAGCAACTTGCTAGAAAAGCAACTTGCTAGACATGTATTACCATCTTCTAACAAAACAAAACTGAAAAAAGTGTTATCTTAATTTGTTTTAACCTTTTTAAAAAAGGGGGCATTTGCATAAAATGAAGTTTCCTAAAGGAAAATGTGTTTTAGTTTGCGGCCAAACAAACCACCAGAGACGACAGcagcgttccaaatggcaccctattccttatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccttatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccttattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagaaccctattcccaatagtgtactactttagaccagagccctattccctatagtgtactactttagaccagagccctattccctatagtgtactacttgtatttttattaaatttaacctttatttaactaggtaagtaaattaagaacaaattcttatttacaatgacggccaaaaccggacaacgctgagccaattgtgtgccgccctttgggactcccaatcgcggccggttgtgatacagcctggaatcaaaccagggtctgtagtgacacctctagctaCACCTCtagctacttttgaccagagcccaatggtccctggtcaaaagtagtgcactatatagggaatagggtgccattttgaacaAAGATAATGGAATATACTAATCAAAATGTTACAAAAGATGAAAAGGAAAATCCACACGAGTCAATaaagggaggagaagaagaagtggGAATTCTTCCTCTGTGGTTGATGTTATCAGTGTTTCCATAGATCTGAGAAATTACTTgtagaagaaaaatatatatatatattacccgAGAGTATCTTtttccttttgttgttgttgcatggaTGGATATTTTTTTAAGAATTATAATATGACATCTTTATGACAACTTTGAATGTGAgctataaaacatttatttaaga
>TU1721548
CTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTTTTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACGCTCCTCCACAGCTATTATTTAAAAAGTTGTGTTGTCGTCTGCTGACACCCAGAGTTCCAAACTCATTCTTatttattgaatacattttttttctttataCTCTTATTAATATGTATAAAAAATATGATAATGGCATTTCCACCTAGTTGGTGAAGGAAGACCTTTCTATCAGTCTACTTGGCAGGGCTTTGTAATGTGTTATTGTCCAGAAATACATTGTTCTGGTTAATTAACAACGGAGAAATGCTTTGGAGGACTAAAATAGGTTTAGAAAGCAACTTGCTAGAAAAGCAACTTGCTAGACATGTATTACCATCTTCTAACAAAACAAAACTGAAAAAAGTGTTATCTTAATTTGTTTTAACCTTTTTAAAAAAGGGGGCATTTGCATAAAATGAAGTTTCCTAAAGGAAAATGTGTTTTAGTTTGCGGCCAAACAAACCACCAGAGACGACAGcagcgttccaaatggcaccctattccctatagtgtactactatagaccagagccctattccttatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccttatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccctatatagtgcactactttagaccagagccttattccctatatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagaaccctattcccaatagtgtactactttagaccagagccctattccctatagtgtactacaatagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgtactactatagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgtactactttagaccagagccctattccctatagtgcacttctttagaccatagccctattccctatagtgcactactttagaccagagccctattccctatagtgcactactttagaccatagcCCCATtccctatagtgtactactttagaccatagccctattccctatagtgtactactttagaccagagccctattccctatagtgtactacttgtatttttattaaatttaacctttatttaactaggtaagtaaattaagaacaaattcttatttacaatgacggccaaaaccggacaacgctgagccaattgtgtgccgccctttgggactcccaatcgcggccggttgtgatacagcctggaatcaaaccagggtctgtagtgacacctctagctaCACCTCtagctacttttgaccagagcccaatggtccctggtcaaaagtagtgcactatatagggaatagggtgccattttgaacaAAGATAATGGAATATACTAATCAAAATGTTACAAAAGATGAAAAGGAAAATCCACACGAGTCAATaaagggaggagaagaagaagtggGAATTCTTCCTCTGTGGTTGATGTTATCAGTGTTTCCATAGATCTGAGAAATTACTTgtagaagaaaaatatatatatatattacccgAGAGTATCTTtttccttttgttgttgttgcatggaTGGATATTTTTTTAAGAATTATAATATGACATCTTTATGACAACTTTGAATGTGAgctataaaacatttatttaaga
>TU1721545
gtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtctgtcggtCATCTAATTTAGAAACCGGTCCGTTATATATTGTTGCTTTTTATACTCATCTCTCTTATTCAGTTCCAAAAACCGACTGTTTCATTTAAAGTTGTAGAATGTaattatttaaatatatttagttCCTGATCTTGGTCAGTCCCTCCCTCTACCAGTGTCTGGTATTTAGGCCGGTCCCAGCCCAGGTATGTCTGGGCCATGTCCCATTGGGACTCCCGTCATCCTTACAACTTTCTCTGATTTTATGATCTTGAAAATATCAAATATCtctttcctttaaaaaaaaaaattgcactgtAGAAGGTGAATTGAAAGCATCAAAgcatgattattataatttttaaaaaaaatgtttttaaaatgttactTATTTTCTTCTGGCGGCGTTTAAGTCACGTCAAGGGTCGGATTTCTCGCCAGACCTGGATTCAAATCATTTCAGATACTTTAAGcagggcttgattgagcttgcatGGCAAAATGAAACAAATAGAATAGTCACAAAACTGCAAATCCTCCTGCCCGTGATCTGGAACAACAGGCACACTGAAGTCAACACTCAAAGCATTTAAAAGATTTTGAGAAACATACAGGGAGcatctacagtcctgttatgtccTCTCTGATTTTGAAGTAgtacttgaacccaggtctgctactCTCTCACCACCGATACACAGTGAACCCTTGGTCCTCCATTTTAACACATGTAGCAGAAAGTTAGTAAGAGATTGTCCACTCttcctccaccactctcttcctcttctgtGTCCTCCCTTTGTCCCCCAACCTACTCACCATGGAGTGAGAGGCAGTCATTTGGGTTAGGGTGTTTCTCTGTGTAGATTGGTTGTAGAATGTTGCACTGTAGCCATAAATCATAACAGTTGATGTGGATAATTTTTTCCCCCTCCTCTGCTGTTAGAGATGAGAGCTTTACTGTAAAACAGGGAAGAGCAGCATGCTCTGGCAGGATGCAGGTCTGGTCTTTTTTTCAGTTGAATATCACTGATAGGTGTGTGTACACTTTCCCCAAATGTGTAAAGAACAGGAAGGCCCTCACACTGTTGATGCTCCACGCGCTTTATCAACAACGTTTCAATCCGACACAGCCCAGTCACAAAGTTTTTAAGGACGTGCGTATGACCACACAACCTTtctaacaaataaaaataaacgttcccaaaattcccaggttttatCGAGAAACCCCAGTTGGAAGGTTCCCAGAATCATGGATGGCGTAAAGCAGGAAATCCGGAATCCTTCTATCAATAGTTCTGGAAAAACCTATGGGTTTTTGGGGGGAAGTTACCAGAACTTTGCAACCCTACTCTGACTAAAAGCACTACTGTGCTATAATATTTTATCTTTAAGTCTATCTATGCTCTAATTCTACACAAGCACGTGAACTGACTTTTTAGACGTGTCCAGAATTATAAAACCACTTATTACTACTGCAGTCAGATTAGCTCAACATAACAAAACTGTTGACTGACTTAAGGTTTAGAGATGTATCTACTACATTCTATTCTGACTCTAGAACCAAATCTATTCGGTTCTAGAACCAATTCTATTCGGTTCTAGAACCAATTCTATTCGGTTCTAGAACCAATTCTATTCGGTTCTAGAACCAATTCTATTcggttctatttgtgtttcaatTTGTGCTCCCTTGTTTCTGGATATTGCCGTTTATGGAGAAAATAGTTTCCAGTAAAAAAAAGTCAAGTCACGCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTTTTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCACAACTATTATTTAAAAAGTCAAGTCACTCTCCTCCAC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1721542 False 1945 lncRNA 0.38 2 91707529 91709543
TU1721543 False 1980 lncRNA 0.39 2 91707529 91709543
TU1721546 False 1517 lncRNA 0.37 2 91707529 91709543
TU1721547 False 3253 lncRNA 0.39 4 91707529 91713623
TU1721548 False 2110 lncRNA 0.38 3 91707529 91710425
TU1721545 True 2094 lncRNA 0.39 2 91710002 91713623

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110494829 LOC106566223 coding downstream 10898 91665447 ~ 91696631 (-)
LOC110494831 LOC106566219 coding downstream 295442 91410448 ~ 91412087 (-)
LOC110493301 LOC105007334 coding downstream 841235 90505071 ~ 90866294 (-)
LOC110494821 NA coding downstream 1202598 90503276 ~ 90504931 (-)
LOC118940164 NA coding downstream 1906085 89799674 ~ 89801444 (-)
LOC110493304 LOC106566225 coding upstream 156 91713779 ~ 91810291 (-)
LOC118940165 NA coding upstream 99506 91813129 ~ 91814185 (-)
LOC118940513 NA coding upstream 304026 92017649 ~ 92019442 (-)
LOC110504500 LOC106566229 coding upstream 451113 92164736 ~ 92168102 (-)
LOC118940113 NA coding upstream 721296 92434919 ~ 92435933 (-)
G1505547 NA non-coding downstream 2543 91704427 ~ 91704986 (-)
G1505538 NA non-coding downstream 16354 91690447 ~ 91691175 (-)
G1505512 NA non-coding downstream 47148 91658824 ~ 91660381 (-)
G1505307 NA non-coding downstream 72832 91634476 ~ 91634697 (-)
G1505302 NA non-coding downstream 98727 91604348 ~ 91608802 (-)
G1505555 NA non-coding upstream 12842 91726465 ~ 91731707 (-)
G1505566 NA non-coding upstream 42513 91756136 ~ 91757809 (-)
G1505588 NA non-coding upstream 98725 91812348 ~ 91812561 (-)
G1505591 NA non-coding upstream 104284 91817907 ~ 91818121 (-)
G1503624 NA other downstream 2020652 89686415 ~ 89686877 (-)
pcbp4 LOC106566209 other downstream 2128678 89575961 ~ 89725809 (-)
LOC110493292 NA other downstream 2833003 88872775 ~ 88877452 (-)
G1502566 NA other downstream 3154698 88550366 ~ 88552831 (-)
G1502489 NA other downstream 3282024 88358152 ~ 88425505 (-)
G1505789 NA other upstream 401670 92115293 ~ 92170717 (-)
G1506160 NA other upstream 624430 92338053 ~ 92339443 (-)
G1506231 NA other upstream 782389 92494406 ~ 92498948 (-)
LOC110494834 NA other upstream 1115287 92828908 ~ 92836438 (-)
G1506543 NA other upstream 1149479 92863102 ~ 92863974 (-)

Expression

G1505523 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 80.
End of interactive chart.

G1505523 Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
G1505523 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 1500.
End of interactive chart.

Co-expression Network