G1508419


Basic Information

Item Value
gene id G1508419
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 94848744 ~ 94861338 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1725136
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>TU1725138
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>TU1725140
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Function

NR:

description
Transposable element Tc1 transposase

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1725136 False 3067 lncRNA 0.36 2 94848744 94851842
TU1725138 False 1774 lncRNA 0.33 2 94848776 94850581
TU1725140 True 8332 lncRNA 0.48 3 94850827 94861338
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110494864 LOC106566281 coding upstream 294474 94550615 ~ 94554270 (+)
nuf2 nuf2 coding upstream 418311 94398543 ~ 94430433 (+)
LOC110494863 NA coding upstream 492321 94355439 ~ 94356423 (+)
LOC110494842 LOC106566274 coding upstream 596742 93973703 ~ 94252002 (+)
LOC110494855 LOC106592089 coding upstream 959907 93806042 ~ 93888837 (+)
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G1508416 NA non-coding upstream 8327 94840183 ~ 94840417 (+)
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G1508404 NA non-coding upstream 29979 94818389 ~ 94818765 (+)
G1508333 NA non-coding upstream 139190 94709340 ~ 94709554 (+)
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G1508469 NA non-coding downstream 62050 94923388 ~ 94924081 (+)
G1508489 NA non-coding downstream 105442 94966780 ~ 94970310 (+)
G1508496 NA non-coding downstream 122156 94983494 ~ 94985441 (+)
G1508593 NA non-coding downstream 161272 95022610 ~ 95022942 (+)
G1508290 NA other upstream 174807 94673563 ~ 94673937 (+)
G1507612 NA other upstream 497633 94350213 ~ 94351111 (+)
G1506889 NA other upstream 1271140 93576817 ~ 93577604 (+)
G1506406 NA other upstream 1981710 92866206 ~ 92867034 (+)
G1505924 LOC106566233 other upstream 2398803 92447734 ~ 92467632 (+)
G1508614 NA other downstream 220066 95081404 ~ 95082050 (+)
G1508618 NA other downstream 228930 95090268 ~ 95090709 (+)
G1508727 NA other downstream 301157 95162495 ~ 95163208 (+)

Expression

G1508419 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 6.
End of interactive chart.

G1508419 Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
G1508419 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 300.
End of interactive chart.

Co-expression Network