G1508646


Basic Information

Item Value
gene id G1508646
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 95128376 ~ 95131206 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1725441
ACTTATATACAACATATGTCACTCCAGGTTAATTTGAGTCCcataaaacaaaaacaatcaGAAGTGTATTAATGTAAAGTTGGATCCTGTATCAGTTTCTCCTGTCAAACAGTCGAGTCATCAGCTAGCAGGAGAGGCAGAGACACTGATGGAAAGAGGGTGAGTATCCTGACAGCTTGGTAACCAACATGGTCCTGTATATGACCCATGGTCCTGTTTATGACCCATGGTCCTGTATATGACCCATGGTCCTGTATATGACCCTTGGTCCTGTTTATGACCCATGGTCCTGTTTATGACCCAGAAAAAACCTTATCCCCTTGGTTAGGAGAGTCATCCTCATGCCCTCCCTCACTCTAATAATCACCCTGATGGGAGGCTGGATATTTAGCTGACACACTGCATGGCTGGCTGGAAGCAATTCCCGAGTATCGAGTTGGTGTTGAGTTAGGGTTaggctgtgtgtgtctatgtggtgtgtagtgtctatgtgtgtctatgtgtgtgtctatgtgtgtgtctatgtttgtgtcaatgtgtgtgcctatgtgtatgtctatgtgagtgtgtgtgagtgctgaGTTAGGGTCTTGCTCCCCAGCCAATATCCTGCTAATCTCCATGCCTTCCCCACCCCAGCCAATATCCTGTTAATCTCCATGCGTTCCCCCACGCTAGTCAGTGTTCCTCAGgccacctcctcttcttctcctcccctcttcttccctctccatgttcctctcctcctcccctcctcctcccctcctcctccccattcccatccACCTCCATCCTCCCTAGGTCTGCCAGAGGGATTCACTTCCTTTAAACAAGCTCGGAAAGAGGTCAAATTCCTGTAGGttattcctcttctcctcccacccttcctcttccactcctccattcctctcctcccttcaccctctaccctcccctcttttcctccctccctccaccccttctctcctcctcccctcttcccctcctccattcctctcctcccttcgcCCTCCCTtcaccctccccttctctcctccctccttccctcctctcctcctcccctcttccattcctctcctccctttaccctctaccctccccttctctcctacctccatcctctcctgtcctccctctcctccctccacccattctctcctcctcccctcctcccctcttccagTCTGTCTGTATTCCATGTAGAAAATCTAACTCCTGTCTAAAGCTCAATAATCAGTTTCCCTTCATCATCACTACTGCTACTGTCCTCTTGATCCTCCAGGCTACTACTCTGCACTCCCCCAACCCTGCTCACACAGTCTGCTGTATGGGCCCTAACCCTGCTCACACAGTCTGCTGTATGGGCCCTAACCCTGCTCAAACAGTCTACTGTAGGGGCCCTAAACCTGCTCACACACTCTGTTGTAGGGGCCCTAAACCTGCTCACACACTGTGCTGCAGGGACCATAAACCTGCTCACGCACTGTGCTGTAGGGAAGGGGTGTGTCTGTCCTGCCCTGCTGGTATCACTAAAGACTGGGGTGCTGTGGCATACAGTGGGGTCAGGGTCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGGgtcagggtggtggggtcagggtCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGGgtcagggtggtggggtcagggtCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGGGTCAGGGTGGTGGGTTCAGGGTCATTTGAAGAGGTGGTCCGTGGTGGGGTCAGGGTGGTGGGTTCAGGGTCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGTGTCAGGGTGGTGGGTTCAGGGTCATTTGAAGAGCTGGTCTGTTGGTTATACAATGGGTCTTTTTCTGAAGTTAAGTTGATCTGCTGCTGAGGGGCCTTTGAAAGGTTGTGAGACACGTTGGTTGGTGTCTGATATAGATGACTGTAAAGTGGCAGCGATGTCCAGATGCTGTGACGGGAATCTGCTTCATCCTGCCATAGAGAGAAGTATCAGAGTTTTAGAGTTAGTATGTAAGCATGGGGAGGAAGGGCAACAGTTCCAGGTCATTCTTGTAGCTCCACAATGTCTTGGATAGTTTAAGAAGGAATGCCAGCAGCCCGAACAGACAGACcatcagacagacacatagatagTCTACTAACCCAGACTGACCCAgagctgtgtcccaaatagcaaaCATTTCTCTTTATCAAAATAACATCAAAGTTTGTTGGTCATGTACAcatatttgcagatgttatcgcaggtgcaatgaaatgcttgtgtttctagctccaacactgCAGGAATAATACCAAGAAAACAATACAAAACTATagtaacatacagtggggcaaaaaagcatttagtcagccaccaattgtgcaagttctcccacttaaaaagatgagaggcctgtaatttccatcataggtacacttcaactatgacagacaaaatgagaaaaaaattcagaaaatcacattgtaggattttgaatgaatttatttgcaaattatggtggaaaataaatatttggtcaataacaaaagtttatctcaatactttgttatataccctttgttggcaatgacagaggtcaaacgttttctgtcagttttcacaaggttttcacacactgttgctggtattttggcccattcctccatgca
>TU1725439
ACTTATATACAACATATGTCACTCCAGGTTAATTTGAGTCCcataaaacaaaaacaatcaGAAGTGTATTAATGTAAAGTTGGATCCTGTATCAGTTTCTCCTGTCAAACAGTCGAGTCATCAGCTAGCAGGAGAGGCAGAGACACTGATGGAAAGAGGGTGAGTATCCTGACAGCTTGGTAACCAACATGGTCCTGTATATGACCCATGGTCCTGTTTATGACCCATGGTCCTGTATATGACCCATGGTCCTGTATATGACCCATGGTCCTGTATATGACCCAAGGTCCTGTTTATGACCCATGGTCCTGTATATGACCCATGGTCCTGTATATGACCCTTGGTCCTGTTTATGACCCATGGTCCTGTTTATGACCCAGAAAAAACCTTATCCCCTTGGTTAGGAGAGTCATCCTCATGCCCTCCCTCACTCTAATAATCACCCTGATGGGAGGCTGGATATTTAGCTGACACACTGCATGGCTGGCTGGAAGCAATTCCCGAGTATCGAGTTGGTGTTGAGTTAGGGTTaggctgtgtgtgtctatgtggtgtgtagtgtctatgtgtgtctatgtgtgtgtctatgtgtgtgtctatgtttgtgtcaatgtgtgtgcctatgtgtatgtctatgtgagtgtgtgtgagtgctgaGTTAGGGTCTTGCTCCCCAGCCAATATCCTGCTAATCTCCATGCCTTCCCCACCCCAGCCAATATCCTGTTAATCTCCATGCGTTCCCCCACGCTAGTCAGTGTTCCTCAGgccacctcctcttcttctcctcccctcttcttccctctccatgttcctctcctcctcccctcctcctcccctcctcctccccattcccatccACCTCCATCCTCCCTAGGTCTGCCAGAGGGATTCACTTCCTTTAAACAAGCTCGGAAAGAGGTCAAATTCCTGTAGGttattcctcttctcctcccacccttcctcttccactcctccattcctctcctcccttcaccctctaccctcccctcttttcctccctccctccaccccttctctcctcctcccctcttcccctcctccattcctctcctcccttcgcCCTCCCTtcaccctccccttctctcctccctccttccctcctctcctcctcccctcttccattcctctcctccctttaccctctaccctccccttctctcctacctccatcctctcctgtcctccctctcctccctccacccattctctcctcctcccctcctcccctcttccagTCTGTCTGTATTCCATGTAGAAAATCTAACTCCTGTCTAAAGCTCAATAATCAGTTTCCCTTCATCATCACTACTGCTACTGTCCTCTTGATCCTCCAGGCTACTACTCTGCACTCCCCCAACCCTGCTCACACAGTCTGCTGTATGGGCCCTAACCCTGCTCACACAGTCTGCTGTATGGGCCCTAACCCTGCTCAAACAGTCTACTGTAGGGGCCCTAAACCTGCTCACACACTCTGTTGTAGGGGCCCTAAACCTGCTCACACACTGTGCTGCAGGGACCATAAACCTGCTCACGCACTGTGCTGTAGGGAAGGGGTGTGTCTGTCCTGCCCTGCTGGTATCACTAAAGACTGGGGTGCTGTGGCATACAGTGGGGTCAGGGTCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGGgtcagggtggtggggtcagggtCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGGgtcagggtggtggggtcagggtCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGGGTCAGGGTGGTGGGTTCAGGGTCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGGgtcagggtggtggggtcagggtCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGTGTCAGGGTGGTGGGTTCAGGGTCATTTGAAGAGCTGGTCCGTGGTGGTgtcagggtggtggggtcagggtCATTTGAAGAGCTGGTCTGTTGGTTATACAATGGGTCTTTTTCTGAAGTTAAGTTGATCTGCTGCTGAGGGGCCTTTGAAAGGTTGTGAGACACGTTGGTTGGTGTCTGATATAGATGACTGTAAAGTGGCAGCGATGTCCAGATGCTGTGACGGGAATCTGCTT

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106531739

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1725441 False 2659 lncRNA 0.49 4 95128376 95131206
TU1725439 True 2098 lncRNA 0.52 2 95129061 95131206

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cstf1 cstf1 coding downstream 80910 95028386 ~ 95047466 (-)
phf2 phf2 coding downstream 132138 94861445 ~ 94996238 (-)
LOC118940516 NA coding downstream 268296 94851926 ~ 94861352 (-)
acad9 acad9 coding downstream 609172 94484281 ~ 94519204 (-)
LOC110494858 LOC106566283 coding downstream 735444 94363767 ~ 94392932 (-)
LOC110493309 LOC106566266 coding upstream 29481 95160687 ~ 95164816 (-)
G1508691 NA non-coding downstream 1985 95125085 ~ 95126391 (-)
G1508690 NA non-coding downstream 5938 95122233 ~ 95122438 (-)
G1508689 NA non-coding downstream 6384 95121656 ~ 95121992 (-)
G1508682 NA non-coding downstream 14640 95111925 ~ 95113736 (-)
G1508680 NA non-coding downstream 23566 95104402 ~ 95104810 (-)
G1508701 NA non-coding upstream 11196 95142402 ~ 95142615 (-)
G1508707 NA non-coding upstream 14222 95145428 ~ 95145771 (-)
G1508712 NA non-coding upstream 17458 95148664 ~ 95151728 (-)
G1508721 NA non-coding upstream 27144 95158350 ~ 95158615 (-)
G1508725 NA non-coding upstream 27759 95158965 ~ 95159450 (-)
G1508666 NA other downstream 47813 95070982 ~ 95080563 (-)
G1508667 NA other downstream 61013 95065645 ~ 95067363 (-)
G1507961 timp4 other downstream 930297 94164090 ~ 94198079 (-)
LOC110493308 NA other downstream 1598438 93500200 ~ 93529938 (-)

Expression


Co-expression Network