LOC110496075 (LOC106588237)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110496075
gene name LOC106588237
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 34959423 ~ 34986188 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021571751.2
TGGAGGATGCTGCAACCAAATGCACTGCGGTAAAAAAATATAACGACAGACAGGGGGCGAGAAGTCTATTATTCGCAATGCAACCCTGGGAGAAACATCTCTTCTAGGCCTACAAATCCAGGGTCATTTGATGGGTGGAATAATTTTTGCCACTCAAAAGGATCAATAATAATAATCCATCAGAAGGAACAGATAGCCTACATTTCCCCGGAAAAAGGACAGATCGGCATAAGGAGGCAATTTTGTTCAGAAGGGACAACGTGAGGACAGTAAAATGTCATTTCGGAGGAAGCAACTTCAGTCCCTACCATTTCTTACTTTGCTCAAACAAAGTCTTTCTGGATAACATCTCAAAGGAATATCACACTCTCAAGTGTTCAAAGAGACTGTTGGGATATTTTTTGATAGCTTTTGAGGCTTCTCAGCCCTAGGATCTGTACTATCATTGCTACATTACACCCGAGGACATGTCTGCTGTGCGGCTGCTGCTCCTGTCTCTGCTTTGTGCCCTCTTTGTGTCCCTGTGCAATGGGGCCTGTTCAGAGGTGGACTCGGACACTGAGGCCGTTGCAGGCAAAGGGTTCAAACTGGGCTGCATCTCCTGTAAGATGAGGCCCGAGGTGGAGGCTTCTGCCACGGTCGACTGGTATTTCAAGGCCAAAGGGGAAGCTGACTATGCACATATATATAATTACAATGAGGAGGGCCCCCACATTGTGGATGAGCGCTTTGAGGACCGAGTGGACTGGAACGGCAGTAAGAGGAGCCAAGACATACAGGATGCGTCCATCTACGTCTTCAATGTCACCTTCAATGACTCGGGCACCTACCGTTGCTTCTTCCACCGGCTCCTGACGTACGAGTTCTACGAATACCAGACCGTTGTCAGCAAGCTTGTGCACCTGAAAGTGGTGGCTAAAGccaccaGAGGGACAGCCTCCATAGTCTCTGAGGTGATGATGTACGTGTCCATCATCGGGCTACAGGCTTGGCTCTACATAGAGATGGTATACTGCTTCAGAAAGATCTCAGCTGCAGGAGAGGAAGCAATAAGAGAAAGCGCGAATGCAGAATATTTAGCTATTGCCTCGGAGAGTAAAGATAACTGTGCAGGAGTGCAAGTGGCAGAATAAAACAGGTATATCATGAAAAAAACTGTTATCAGCAAGTAAAAGGATACGTAAACTCAAAGCATAAACAATGGAAATGCAGCACAGCACATAGTAGCCTACAAAATTCAAGTATCGGAGTGATATTTGCAATGGGCTCAGCCAAACAATGTATGTGATGGATTCGACTTCCACTTTATATCCCTACTGCAGCGTGCTGGTGGCAAACTTTCCAGAGTCAATTATTTGAAAGAGTCAATTCATAAGAGTATAAAAGTAAAGTAAATAGTTTTAAGTAAGTGTAAGTGTATaagtattattttattttattttatttgattcaagtgcgctaatgttagctagaccTAGTAGGCTGGTTCTGTTGTGGTAGAGTTAACAAAGGCCTGGGCCATCCACCAAGCCAATAACTCTAATGTTGACTACAATGATAAACTATTGGCTGCATAACTATAAAACATTGGTGAGCTTCCATCCTAGAGGAAAGCTGATCGTTTATCATTCTACAGTCCTacacctgtcaatcaactgatCAAAGCAGTCTACTGCAGGCTGCCTATTGATAAGGTGGTAACACAAGACCATTCacgaggtctctaacacacagacaggctaCTGGTTCAGTGACCATTCAGTACTTTTAGGGTGTGTTCATTGTCAACTGCAAATAATAGGCTACTTCAATGTACATGTAGGCCTAGTGAAAAATTATATAGTAACTTGTATTTAAATGTAGCAATTCAACAACAAATGCCATTTAGCCTGCACATATTGTACTGCATGCCATTGCCTTTTTGTTCCAGTGGTTTGCAAGGGATTTCCATTTTTGTAATGGTTGTCAATTCCTTTGGGTCTTCTTTTTCACTGTGCTCGTCTCTGTATGTTCTGTGCAACTATTTGCAATGCATCAGTGCAACAATCGTATCATAACTGGCCAAAAGTAATCACACCAATGCACTTTCCCTCAATTTTCCTCGACATGCATTTTCTATGCTGTTGTAGGCCTGTTTTACATTCAGCGATTAGCAAGAACAATCATGCTTCTTTCCCCGAATAAACTATTAGGCCTagtataaaaaaatctaaatgtctATAGCTTTTGTAGACTATAACTTTCACTGGGATTTCACACGAAGAGGAATGGCCTATTTCGGAGAGGCTTGCGGCATATAGCCTGTTGCGCACGGGAACAACTGGAAGAGAGAGGCTATTGATGTTTAGCCGGATTAAGAAGCGAAATATTAGCTAGATATTAGGCCATTCACTAGCTAAATATTAAACTATAGGCTAAATAGTTACCTGTCAAAGTCCGAGAAAAAGAAATGAACAGATTATGATATGGCAGATCTGTAGTGGGCAGATAGATGTGTAGTGCGTTCCAGCAGGCTGCGCTCCGTTGTCCCCAGGCACGCAAAGCTCCACTATTGATTAGTCCCAGGCCTACGTTTTTAAGCCAATAAAATAATTATACCTGGCCTACAACAACGCAGTGCAATGAGGAATGAATTATTGTTATTCAGTGAATACGAAACTATTGTCCGTGGGCTGTAAACTGCAGTAATGTAGGCTAATCTGAATAACTGCGCACACATCCCGAAATAACTGCATAGGTCAACAGCGTGGGCCTGATTATACAACAATTTTGGATCCATTTGGGTCTATCCTCAACAGTGTATAAGGTCCAGAAAGATACATTAGCAGGTCACTCATATGGTGTAGACCTATTTTGTCAGGATGTAGCCCGGTGTTAAGATAGGAGTAGCCTACTATAAATATGGACTGCTCTTTTCCATCTCCCCGCCCGTTAATGCTATAGCATATTTTACATTCAGCAAGCAAGAGCAAGCATGCATCTAAACTCCAACGGGCTATTAGTAGGCTAATGAAAATAAGTTGAAAcaagtgtccaacaagcttttgGCTTTTACTGGGAATTTAAAAGGAATAGCCGTGACAGCGGAGAGGCCAGATGCATAATTTCGCAACAGAAcaatgaagacagacaggctcGACATGTACCATATAGCCTAAATTAGAAGCGTATGCATATTCGACCATAATTCACAAGACCAATGTTAGGCTTAATACTGCAGTGCATATATCCAGTCAAAGGGGAAAAAAAGTGTATCATTAAAATAAAGCATAGGTAGTTTACAATATGTGCGCGCTCCCTCCCAGTACCCAGGTATGATGCTCGAAAATATACCCTATTGTTTCAGTTTTGTAGGGACAAGCAATGCATCCTACATAGGctacaacaacacaatgtaatgAAGAATGttattgttttcaagtgagtacaAACTCTAGTCTAGGCTGTAAACGGCAGTGAATAGCCTGTCATTTGAATAACCACTCAAAACCTGGCATTTAGAATGCATATTCATTTTGAAATAAGCGCATCTAGGTTGCCTGATTGGGCAACCATCTGGATCAGTTATGCTTTTTTCCAATGCAGTTTAGCCTAAAAAGTCCACACAGGACAGTAATATGGTGTATTTTGTCATTATGTATCAGCTAACAGAAACCTACTATTAAATGCAGGGATTTCTAGTGGTGCACATATGAATTGTGATCATGCATGAGCATGGAGGAAGTTGTATCCATAGTTTAGGCATTTGGCTTCTGTGTTTTAAAAGTTTTCAAAAATGAGGTGGATATCAGTCAGCTAATACACACTACTTTTGTGAGAAACATATATATTCTTTTTTTGATTATGGTTTTTCAGGGGTGCTTACACACAAAAGCATGTTTCTAATTCAAATAATTAATCATTGTGTGTCGTGCATCAAGGTATTTTTTTCTGTTGTAATGATCCAAGTGTATGTACATTTATATTAAGAGGTATTGTGAGAGAATTAATCTGATTGAATGGCTATCAAGATAACTTTATCACACactgtatttcagttttttttctccCAATGACTTGGGtgcaattttcacaagtatgtggtacattttcacaactctaaTCACAAAAATAATGTTTCAAAACTCTAAGCACATTTCCCATTGACTGAGTACAACAAACAAATTCAAAGTCACAAGTTCGCTGCACCAAATCACTCTTTCAATTTGTATACATGTTCAATCTAAGTAACTGTTTTTCAAAATGCAATGTTCACTTTGCTGTTGATTTTCTTGTCATTTGTTAACAACACAATTCACTTAATCATACTGCTCAAAACTGATAAATACTGAACCACAATTATGTAGTTCCTAGTTAACGTATGTAGTTTGATAACTGCTGAACACTGAAAAATGATATTTCAAATGTATCAATTTGACATCAATTTATGGTGGAAGGTAAAACAAACCATATATGGATATGGCTGTAAATACTACATTATAATTTTTTCCATCAGCCAGTGTGCTTCAATGGGACACAATCGAAAAGAATCACTCTACAtgtacaccaccgttcaaaagtttggggtcacttgtgttacctaatccaggtttatcattttaaagggctatttgatcattaga
>XM_021571752.2
TGGAGGATGCTGCAACCAAATGCACTGCGGTAAAAAAATATAACGACAGACAGGGGGCGAGAAGTCTATTATTCGCAATGCAACCCTGGGAGAAACATCTCTTCTAGGCCTACAAATCCAGGGTCATTTGATGGGTGGAATAATTTTTGCCACTCAAAAGGATCAATAATAATAATCCATCAGAAGGAACAGATAGCCTACATTTCCCCGGAAAAAGGACAGATCGGCATAAGGAGGCAATTTTGTTCAGAAGGGACAACGTGAGGACAGTAAAATAGAAGTGCATGGCACTAAGAGCATGGCACAACGAGCATGGCGCCTGCAACACCAAGATTGTGGGTTCTATTCCCCGGAACACCAGTCATTTCGGAGGAAGCAACTTCAGTCCCTACCATTTCTTACTTTGCTCAAACAAAGTCTTTCTGGATAACATCTCAAAGGAATATCACACTCTCAAGTGTTCAAAGAGACTGTTGGGATATTTTTTGATAGCTTTTGAGGCTTCTCAGCCCTAGGATCTGTACTATCATTGCTACATTACACCCGAGGACATGTCTGCTGTGCGGCTGCTGCTCCTGTCTCTGCTTTGTGCCCTCTTTGTGTCCCTGTGCAATGGGGCCTGTTCAGAGGTGGACTCGGACACTGAGGCCGTTGCAGGCAAAGGGTTCAAACTGGGCTGCATCTCCTGTAAGATGAGGCCCGAGGTGGAGGCTTCTGCCACGGTCGACTGGTATTTCAAGGCCAAAGGGGAAGCTGACTATGCACATATATATAATTACAATGAGGAGGGCCCCCACATTGTGGATGAGCGCTTTGAGGACCGAGTGGACTGGAACGGCAGTAAGAGGAGCCAAGACATACAGGATGCGTCCATCTACGTCTTCAATGTCACCTTCAATGACTCGGGCACCTACCGTTGCTTCTTCCACCGGCTCCTGACGTACGAGTTCTACGAATACCAGACCGTTGTCAGCAAGCTTGTGCACCTGAAAGTGGTGGCTAAAGccaccaGAGGGACAGCCTCCATAGTCTCTGAGGTGATGATGTACGTGTCCATCATCGGGCTACAGGCTTGGCTCTACATAGAGATGGTATACTGCTTCAGAAAGATCTCAGCTGCAGGAGAGGAAGCAATAAGAGAAAGCGCGAATGCAGAATATTTAGCTATTGCCTCGGAGAGTAAAGATAACTGTGCAGGAGTGCAAGTGGCAGAATAAAACAGGTATATCATGAAAAAAACTGTTATCAGCAAGTAAAAGGATACGTAAACTCAAAGCATAAACAATGGAAATGCAGCACAGCACATAGTAGCCTACAAAATTCAAGTATCGGAGTGATATTTGCAATGGGCTCAGCCAAACAATGTATGTGATGGATTCGACTTCCACTTTATATCCCTACTGCAGCGTGCTGGTGGCAAACTTTCCAGAGTCAATTATTTGAAAGAGTCAATTCATAAGAGTATAAAAGTAAAGTAAATAGTTTTAAGTAAGTGTAAGTGTATaagtattattttattttattttatttgattcaagtgcgctaatgttagctagaccTAGTAGGCTGGTTCTGTTGTGGTAGAGTTAACAAAGGCCTGGGCCATCCACCAAGCCAATAACTCTAATGTTGACTACAATGATAAACTATTGGCTGCATAACTATAAAACATTGGTGAGCTTCCATCCTAGAGGAAAGCTGATCGTTTATCATTCTACAGTCCTacacctgtcaatcaactgatCAAAGCAGTCTACTGCAGGCTGCCTATTGATAAGGTGGTAACACAAGACCATTCacgaggtctctaacacacagacaggctaCTGGTTCAGTGACCATTCAGTACTTTTAGGGTGTGTTCATTGTCAACTGCAAATAATAGGCTACTTCAATGTACATGTAGGCCTAGTGAAAAATTATATAGTAACTTGTATTTAAATGTAGCAATTCAACAACAAATGCCATTTAGCCTGCACATATTGTACTGCATGCCATTGCCTTTTTGTTCCAGTGGTTTGCAAGGGATTTCCATTTTTGTAATGGTTGTCAATTCCTTTGGGTCTTCTTTTTCACTGTGCTCGTCTCTGTATGTTCTGTGCAACTATTTGCAATGCATCAGTGCAACAATCGTATCATAACTGGCCAAAAGTAATCACACCAATGCACTTTCCCTCAATTTTCCTCGACATGCATTTTCTATGCTGTTGTAGGCCTGTTTTACATTCAGCGATTAGCAAGAACAATCATGCTTCTTTCCCCGAATAAACTATTAGGCCTagtataaaaaaatctaaatgtctATAGCTTTTGTAGACTATAACTTTCACTGGGATTTCACACGAAGAGGAATGGCCTATTTCGGAGAGGCTTGCGGCATATAGCCTGTTGCGCACGGGAACAACTGGAAGAGAGAGGCTATTGATGTTTAGCCGGATTAAGAAGCGAAATATTAGCTAGATATTAGGCCATTCACTAGCTAAATATTAAACTATAGGCTAAATAGTTACCTGTCAAAGTCCGAGAAAAAGAAATGAACAGATTATGATATGGCAGATCTGTAGTGGGCAGATAGATGTGTAGTGCGTTCCAGCAGGCTGCGCTCCGTTGTCCCCAGGCACGCAAAGCTCCACTATTGATTAGTCCCAGGCCTACGTTTTTAAGCCAATAAAATAATTATACCTGGCCTACAACAACGCAGTGCAATGAGGAATGAATTATTGTTATTCAGTGAATACGAAACTATTGTCCGTGGGCTGTAAACTGCAGTAATGTAGGCTAATCTGAATAACTGCGCACACATCCCGAAATAACTGCATAGGTCAACAGCGTGGGCCTGATTATACAACAATTTTGGATCCATTTGGGTCTATCCTCAACAGTGTATAAGGTCCAGAAAGATACATTAGCAGGTCACTCATATGGTGTAGACCTATTTTGTCAGGATGTAGCCCGGTGTTAAGATAGGAGTAGCCTACTATAAATATGGACTGCTCTTTTCCATCTCCCCGCCCGTTAATGCTATAGCATATTTTACATTCAGCAAGCAAGAGCAAGCATGCATCTAAACTCCAACGGGCTATTAGTAGGCTAATGAAAATAAGTTGAAAcaagtgtccaacaagcttttgGCTTTTACTGGGAATTTAAAAGGAATAGCCGTGACAGCGGAGAGGCCAGATGCATAATTTCGCAACAGAAcaatgaagacagacaggctcGACATGTACCATATAGCCTAAATTAGAAGCGTATGCATATTCGACCATAATTCACAAGACCAATGTTAGGCTTAATACTGCAGTGCATATATCCAGTCAAAGGGGAAAAAAAGTGTATCATTAAAATAAAGCATAGGTAGTTTACAATATGTGCGCGCTCCCTCCCAGTACCCAGGTATGATGCTCGAAAATATACCCTATTGTTTCAGTTTTGTAGGGACAAGCAATGCATCCTACATAGGctacaacaacacaatgtaatgAAGAATGttattgttttcaagtgagtacaAACTCTAGTCTAGGCTGTAAACGGCAGTGAATAGCCTGTCATTTGAATAACCACTCAAAACCTGGCATTTAGAATGCATATTCATTTTGAAATAAGCGCATCTAGGTTGCCTGATTGGGCAACCATCTGGATCAGTTATGCTTTTTTCCAATGCAGTTTAGCCTAAAAAGTCCACACAGGACAGTAATATGGTGTATTTTGTCATTATGTATCAGCTAACAGAAACCTACTATTAAATGCAGGGATTTCTAGTGGTGCACATATGAATTGTGATCATGCATGAGCATGGAGGAAGTTGTATCCATAGTTTAGGCATTTGGCTTCTGTGTTTTAAAAGTTTTCAAAAATGAGGTGGATATCAGTCAGCTAATACACACTACTTTTGTGAGAAACATATATATTCTTTTTTTGATTATGGTTTTTCAGGGGTGCTTACACACAAAAGCATGTTTCTAATTCAAATAATTAATCATTGTGTGTCGTGCATCAAGGTATTTTTTTCTGTTGTAATGATCCAAGTGTATGTACATTTATATTAAGAGGTATTGTGAGAGAATTAATCTGATTGAATGGCTATCAAGATAACTTTATCACACactgtatttcagttttttttctccCAATGACTTGGGtgcaattttcacaagtatgtggtacattttcacaactctaaTCACAAAAATAATGTTTCAAAACTCTAAGCACATTTCCCATTGACTGAGTACAACAAACAAATTCAAAGTCACAAGTTCGCTGCACCAAATCACTCTTTCAATTTGTATACATGTTCAATCTAAGTAACTGTTTTTCAAAATGCAATGTTCACTTTGCTGTTGATTTTCTTGTCATTTGTTAACAACACAATTCACTTAATCATACTGCTCAAAACTGATAAATACTGAACCACAATTATGTAGTTCCTAGTTAACGTATGTAGTTTGATAACTGCTGAACACTGAAAAATGATATTTCAAATGTATCAATTTGACATCAATTTATGGTGGAAGGTAAAACAAACCATATATGGATATGGCTGTAAATACTACATTATAATTTTTTCCATCAGCCAGTGTGCTTCAATGGGACACAATCGAAAAGAATCACTCTACAtgtacaccaccgttcaaaagtttggggtcacttgtgttacctaatccaggtttatcattttaaagggctatttgatcattaga
>XR_005037436.1
TGGAGGATGCTGCAACCAAATGCACTGCGGTAAAAAAATATAACGACAGACAGGGGGCGAGAAGTCTATTATTCGCAATGCAACCCTGGGAGAAACATCTCTTCTAGGCCTACAAATCCAGGGTCATTTGATGGGTGGAATAATTTTTGCCACTCAAAAGGATCAATAATAATAATCCATCAGAAGGAACAGATAGCCTACATTTCCCCGGAAAAAGGACAGATCGGCATAAGGAGGCAATTTTGTTCAGAAGGGACAACGTGAGGACAGTAAAATGTGAGACAACGCAAATGATGATTATTTAAAACAAATAGCGcaataacacatttacagtgttcctaaaaaaattaaatataatCGGTATGTTGCTTATGTAGCCTAGGCCTTCTTTCTTCTGGCATGCAATTAATTATTAATTTAGCCTATGCAGTGGTTTGCGATTTTACAGTAGCCTATTAAAATAACCGAAGACCTATAATGTCGACAGATTATTCAAATAAGTGTCATATATAACCGTGTCAATGTAATTTAGAAGTAGGCCTATTATTCGAATAGAACATCAGACTACAGTTGGTATAAATAGCCTGTAAAGATAATAATAGCTCAGTGTATTTGATATTAGGACTTCAGGGAACTGATAATCCCAGGCCAGGGTATAGATTTGTAAACACTGTATCAACAAAGATCTGGAACAATAGAAAAAACGAACCATAATCATAGCTATAGTTTAGGGATGTGTAGGCTCTTTTGTAACAGCAGTAATCAGATCAATGTTGCATTAAACATTGTAACCCATGTTTAACTTGTTGATTTAAGCCAAATAAGTGAAGAACTTTTATGTGCTAGATTTAAATGTTTATCAAAACGTGTATATTGCTGCAGTCATCTTTTTAAGGGAGGCTTTTAAATAGGCCGACTGTATATTAGATTAGCACTCTTAGCCTGTATTGTGTATTATGTTTGTTCTCTAGAAAGTCTCTCCTTGGCCTATTGGCCTTATATTTGCACTTTGAAATTGAAATCATCAAGCGCCAGAGTTTTCCTAAAAAACATGAATTGTAAACCAATATTAATGGTTAAACTTGCATGTATCCTGCATGAAAAAGCATATGAGAACAGTAGTAACAATGTCAATTCATTAATGCAATAGTCTTTGATAAGAAGATTGTTTCCATTTAAAGAGAAGTGCATGGCACTAAGAGCATGGCACAACGAGCATGGCGCCTGCAACACCAAGATTGTGGGTTCTATTCCCCGGAACACCAGTCATTTCGGAGGAAGCAACTTCAGTCCCTACCATTTCTTACTTTGCTCAAACAAAGTCTTTCTGGATAACATCTCAAAGGAATATCACACTCTCAAGTGTTCAAAGAGACTGTTGGGATATTTTTTGATAGCTTTTGAGGCTTCTCAGCCCTAGGATCTGTACTATCATTGCTACATTACACCCGAGGACATGTCTGCTGTGCGGCTGCTGCTCCTGTCTCTGCTTTGTGCCCTCTTTGTGTCCCTGTGCAATGGGGCCTGTTCAGAGGTGGACTCGGACACTGAGGCCGTTGCAGGCAAAGGGTTCAAACTGGGCTGCATCTCCTGTAAGATGAGGCCCGAGGTGGAGGCTTCTGCCACGGTCGACTGGTATTTCAAGGCCAAAGGGGAAGCTGACTATGCACATATATATAATTACAATGAGGAGGGCCCCCACATTGTGGATGAGCGCTTTGAGGACCGAGTGGACTGGAACGGCAGTAAGAGGAGCCAAGACATACAGGATGCGTCCATCTACGTCTTCAATGTCACCTTCAATGACTCGGGCACCTACCGTTGCTTCTTCCACCGGCTCCTGACGTACGAGTTCTACGAATACCAGACCGTTGTCAGCAAGCTTGTGCACCTGAAAGTGGTGGCTAAAGccaccaGAGGGACAGCCTCCATAGTCTCTGAGGTGATGATGTACGTGTCCATCATCGGGCTACAGGCTTGGCTCTACATAGAGATGGTATACTGCTTCAGAAAGATCTCAGCTGCAGGAGAGGAAGCAATAAGAGAAAGCGCGAATGCAGAATATTTAGCTATTGCCTCGGAGAGTAAAGATAACTGTGCAGGAGTGCAAGTGGCAGAATAAAACAGGAAATCCGAATGGCAGCCATTTTATTAAATGGCCACCCTGGGTGACTGACATGCTTCCCAGACTGCCTCCAATCTTTAAAATGTTCCTTAATAAGTCACGGCAAACAGAGGAGATTCTCCAATTGGAAGAGGGTGTGGTGACGGAGGAGCAGACTGCAGTTACCATACAGAGTGTACAGCAGGCCGCAGCTTTTGCGGATCATAATGTTCAATACCAGTTCTGCACAGGTGAGCTCAATCAATGACCCAGGCAATTTTGTCTATATTCTTTCTGATTGTATATTCTATTTATGGTTGTCCGCACCATTTCACCAGCTCAAATTCCTGGTACATCTACATGTACTTGGATTCTGATTCTATATGAAATGTTTGGCATATTCATGTCCTGACCACCTCCCCTTGACTTTCTTCACTCCAGTTGACCTATCATGTGGTCTAGGTGACAGATGACCAGCTAGAGGCAGCAGGCAACGGTACTGGGTCAGTCAGTGTGGTCTTCACTGCTGCATTTACTGGAGCACAGCAGGCAgtagcatatgtgtgtgtgtgtg

Function

NR:

description
sodium channel subunit beta-1-like isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K04845 SCN1B; voltage-gated sodium channel type I beta

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021571751.2 False 4622 mRNA 0.40 6 34959423 34967895
XM_021571752.2 False 4706 mRNA 0.40 7 34959423 34967895
XR_005037436.1 True 2678 mRNA 0.42 9 34959423 34986188

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110496074 NA coding upstream 37672 34918537 ~ 34921751 (+)
mbpa LOC106588233 coding upstream 61010 34883492 ~ 34898413 (+)
LOC110496067 LOC106588229 coding upstream 319466 34633226 ~ 34640621 (+)
LOC110496068 slc52a2 coding upstream 326466 34627456 ~ 34632957 (+)
LOC110496065 LOC106588226 coding upstream 335187 34618554 ~ 34624236 (+)
olah sast coding downstream 145573 35131761 ~ 35139834 (+)
LOC110496082 LOC106588242 coding downstream 258009 35237754 ~ 35324664 (+)
tomm40l LOC106588243 coding downstream 348860 35335048 ~ 35348295 (+)
LOC118941149 NA coding downstream 426583 35412771 ~ 35433941 (+)
LOC118941148 NA coding downstream 454955 35441143 ~ 35504636 (+)
G1541828 NA non-coding upstream 29236 34929979 ~ 34930187 (+)
G1541827 NA non-coding upstream 29580 34929523 ~ 34929843 (+)
G1541808 NA non-coding upstream 53261 34905927 ~ 34906162 (+)
G1541793 NA non-coding upstream 86508 34872693 ~ 34872915 (+)
G1541720 atp9b non-coding upstream 167265 34782152 ~ 34792158 (+)
G1541933 NA non-coding downstream 164490 35150678 ~ 35151223 (+)
G1541942 LOC106613263 non-coding downstream 176735 35162923 ~ 35163267 (+)
G1541943 NA non-coding downstream 177448 35163636 ~ 35163856 (+)
G1541944 NA non-coding downstream 180044 35166232 ~ 35166452 (+)
G1541946 NA non-coding downstream 186573 35172761 ~ 35173007 (+)
LOC110496058 LOC106588349 other upstream 829764 34127192 ~ 34133734 (+)
G1540996 NA other upstream 880349 34078718 ~ 34079074 (+)
LOC110496043 LOC106588212 other upstream 1421859 33535229 ~ 33537569 (+)
G1540551 NA other upstream 1468302 33489337 ~ 33491121 (+)
G1541989 NA other downstream 296415 35282603 ~ 35283706 (+)
G1542037 LOC106588244 other downstream 389056 35373871 ~ 35386463 (+)
G1542052 LOC106588245 other downstream 415649 35400723 ~ 35481348 (+)
G1542051 LOC106588245 other downstream 492647 35478835 ~ 35502933 (+)
G1542090 NA other downstream 543355 35529543 ~ 35606179 (+)

Expression


Co-expression Network