LOC110496154 (LOC106588291)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110496154
gene name LOC106588291
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 38121576 ~ 38152320 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_036952672.1
AGCAGCTTGGTGAATTCCAGTGTGGAATACAAGGTCGCTACGTGTTGGGTTAAGGTCTTTACCACTTATTAATTAGTACTTGTAGTAATAGCTGAATTTAGCTGGTTAGTTAAATTAATGCcgcaaagagagaagagaagtccTGTCATTGAGCAACTGTTTTTTTTCCCAACAGTCCCTCCCTCAGTCCCCGTCATATAAAATAAGTGTCTATTTGGGTTGATGAAATAGGTGTCTGGTATGAGTGTTTAGATCAGTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTGAAGTTCAAAAAGCACCAAAAGACTGAAGGAAAAGATGGTGCAACAGCATCCACAGGGAATGATGCCACGTACTCTGAAATCTCAATTCCCAAAGCCGGACGCAACCAGCCATCTACCGACActaatgctgGTGACCCTGATTCTCAGGAGGGGTTAAAGGTCAAACCAGGTGGATATGACCCTGTCAAAGTGGTCCTGGTGACTCTCTGTTTTCTTCTGATGGGGACGGTCATTGGACTTGTGTTCCTGTATATCAGCAACCTGCCAACCAAAAACACAGAGCTCCAAATTCTGCAAGCGGCTTACAATCGAAATCTTACAGATTTGGAAAAAGCTTTTACCTCAGCTTTAATGATCAAAAACAGAGAGCTTCAAGAACTGCAAGACAAGAACAAAGATCTTCAGGAGAAGGAACGTGCAGTTTGGCAACAACATGAAGAATTGAAAAAGCAGAGAACTCCACCCTCTTGCCCTACAAACACAGGGAATAATGACTGTCCTCAACCTATGAACTGTGCTGAAGGCTGGGAGTATTATGGGGGGAAGTGCTATTACTTCTCCCCTGATAAACTGACCTGGGCTCAGAGTCGGGATGAGTGTATCACCAGGGGGGGACACCTTGTCATCATAGGGAGCCTAGAGGAGCAGACGTTCTTAGATCAGAAAAGTGGTACAAAAATAAGTACGGAGCCTGAAGACAAGTTCTGGATTGGGCTGACGGACAGTATAAACGAGAATGAGTGGTTATGGGTGGACAATTCATCTCTAAGCACAAGATTCTGGCTTGGTGACTGGGAGCCAGATGACTGGAAAGGAGAGAATTCCGAAGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGGGAACGGGGTGGTACTAAAGACGGCAAGAGTTGGTTGGATGTCAACTGTAATAAGACTCAAAGAAGAATATGTGAGACAAAATCCCCCTTGTGAAACAGTATCTTTAAGAAACTCAAAAGTTCCTTTTAAATATGTCTCTGAACAACCCCAAAtattgttaagtgtgtgtgttagtgtgggttttcaatTCATTTTTGTAAATCATGATATCTCCATTTTgcagtgcaggaaaattctcagcaacaagagTGAtacaattaagatcctacacctgtacatCATCCTGTGTGTTTTGTACATGTATATTTCTGCTTAACAGTGCTGTCTCTAGGCTAGTCATTTGAGAAAATATTGTGTGTGTCTATCCAAACCATTGAATTAATAAAGTG
>XM_036952674.1
CAGCAGCTTGGTGAATTCCAGTGTGGAATACAAGGTCGCTACGTGTTGGGTTAAGGTCTTTACCACTTATTAATTAGTACTTGTAGTAATAGCTGAATTTAGCTGGTTAGTTAAATTAATGCcgcaaagagagaagagaagtccTGTCATTGAGCAACTGTTTTTTTTCCCAACAGTCCCTCCCTCAGTCCCCGTCATATAAAATAAGTGTCTATTTGGGTTGATGAAATAGGTGTCTGGTATGAGTGTTTAGATCAGTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTGAAGTTCAAAAAGCACCAAAAGACTGAAGGAAAAGATGGTGCAACAGCATCCACAGGGAATGATGCCACGTACTCTGAAATCTCAATTCCCAAAGCCGGACGCAACCAGCCATCTACCGACActaatgctgGTGACCCTGATTCTCAGGAGGGGTTAAAGGTCAAACCAGGTGGATATGACCCTGTCAAAGTGGTCCTGGTGACTCTCTGTTTTCTTCTGATGGGGACGGTCATTGGACTTGTGTTCCTGTATATCAGCAACCTGCCAACCAAAAACACAGAGCTCCAAATTCTGCAAGCGGCTTACAATCGAAATCTTACAGATTTGGAAAAAGCTTTTACCTCAGCTTTAATGATCAAAAACAGAGAGCTTCAAGAACTGCAAGACAAGAACAAAGATCTTCAGGAGAAGGAACGTGCAGGGAATAATGACTGTCCTCAACCTATGAACTGTGCTGAAGGCTGGGAGTATTATGGGGGGAAGTGCTATTACTTCTCCCCTGATAAACTGACCTGGGCTCAGAGTCGGGATGAGTGTATCACCAGGGGGGGACACCTTGTCATCATAGGGAGCCTAGAGGAGCAGACGTTCTTAGATCAGAAAAGTGGTACAAAAATAAGTACGGAGCCTGAAGACAAGTTCTGGATTGGGCTGACGGACAGTATAAACGAGAATGAGTGGTTATGGGTGGACAATTCATCTCTAAGCACAAGATTCTGGCTTGGTGACTGGGAGCCAGATGACTGGAAAGGAGAGAATTCCGAAGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGGGAACGGGGTGGTACTAAAGACGGCAAGAGTTGGTTGGATGTCAACTGTAATAAGACTCAAAGAAGAATATGTGAGACAAAATCCCCCTTGTGAAACAGTATCTTTAAGAAACTCAAAAGTTCCTTTTAAATATGTCTCTGAACAACCCCAAAtattgttaagtgtgtgtgttagtgtgggttttcaatTCATTTTTGTAAATCATGATATCTCCATTTTgcagtgcaggaaaattctcagcaacaagagTGAtacaattaagatcctacacctgtacatCATCCTGTGTGTTTTGTACATGTATATTTCTGCTTAACAGTGCTGTCTCTAGGCTAGTCATTTGAGAAAATATTGTGTGTGTCTATCCAAACCATTGAATTAATAAAGTG
>XM_021571887.2
CTTTCAGCAGCTTGGTGAATTCCAGTGTGGAATACAAGGTCGCTACGTGTTGGGTTAAGGTCTTTACCACTTATTAATTAGTACTTGTAGTAATAGCTGAATTTAGCTGGTTAGTTAAATTAATGCcgcaaagagagaagagaagtccTGTCATTGAGCAACTGTTTTTTTTCCCAACAGTCCCTCCCTCAGTCCCCGTCATATAAAATAAGTGTCTATTTGGGTTGATGAAATAGGTGTCTGGTATGAGTGTTTAGATCAGTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTGAAGTTCAAAAAGCACCAAAAGACTGAAGGAAAAGATGGTGctgGTGACCCTGATTCTCAGGAGGGGTTAAAGGTCAAACCAGGTGGATATGACCCTGTCAAAGTGGTCCTGGTGACTCTCTGTTTTCTTCTGATGGGGACGGTCATTGGACTTGTGTTCCTGTATATCAGCAACCTGCCAACCAAAAACACAGAGCTCCAAATTCTGCAAGCGGCTTACAATCGAAATCTTACAGATTTGGAAAAAGCTTTTACCTCAGCTTTAATGATCAAAAACAGAGAGCTTCAAGAACTGCAAGACAAGAACAAAGATCTTCAGGAGAAGGAACGTGCAGTTTGGCAACAACATGAAGAATTGAAAAAGCAGAGAACTCCACCCTCTTGCCCTACAAACACAGGGAATAATGACTGTCCTCAACCTATGAACTGTGCTGAAGGCTGGGAGTATTATGGGGGGAAGTGCTATTACTTCTCCCCTGATAAACTGACCTGGGCTCAGAGTCGGGATGAGTGTATCACCAGGGGGGGACACCTTGTCATCATAGGGAGCCTAGAGGAGCAGACGTTCTTAGATCAGAAAAGTGGTACAAAAATAAGTACGGAGCCTGAAGACAAGTTCTGGATTGGGCTGACGGACAGTATAAACGAGAATGAGTGGTTATGGGTGGACAATTCATCTCTAAGCACAAGATTCTGGCTTGGTGACTGGGAGCCAGATGACTGGAAAGGAGAGAATTCCGAAGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGGGAACGGGGTGGTACTAAAGACGGCAAGAGTTGGTTGGATGTCAACTGTAATAAGACTCAAAGAAGAATATGTGAGACAAAATCCCCCTTGTGAAACAGTATCTTTAAGAAACTCAAAAGTTCCTTTTAAATATGTCTCTGAACAACCCCAAAtattgttaagtgtgtgtgttagtgtgggttttcaatTCATTTTTGTAAATCATGATATCTCCATTTTgcagtgcaggaaaattctcagcaacaagagTGAtacaattaagatcctacacctgtacatCATCCTGTGTGTTTTGTACATGTATATTTCTGCTTAACAGTGCTGTCTCTAGGCTAGTCATTTGAGAAAATATTGTGTGTGTCTATCCAAACCATTGAATTAATAAAGTG
>XM_036952673.1
CTTTCAGCAGCTTGGTGAATTCCAGTGTGGAATACAAGGTCGCTACGTGTTGGGTTAAGGTCTTTACCACTTATTAATTAGTACTTGTAGTAATAGCTGAATTTAGCTGGTTAGTTAAATTAATGCcgcaaagagagaagagaagtccTGTCATTGAGCAACTGTTTTTTTTCCCAACAGTCCCTCCCTCAGTCCCCGTCATATAAAATAAGTGTCTATTTGGGTTGATGAAATAGGTGTCTGGTATGAGTGTTTAGATCAGTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTGAAGTTCAAAAAGCACCAAAAGACTGAAGGAAAAGATGGTGCATCCACAGGGAATGATGCCACGTACTCTGAAATCTCAATTCCCAAAGCCGGACGCAACCAGCCATCTACCGACActaatgctgGTGACCCTGATTCTCAGGAGGGGTTAAAGGTCAAACCAGGTGGATATGACCCTGTCAAAGTGGTCCTGGTGACTCTCTGTTTTCTTCTGATGGGGACGGTCATTGGACTTGTGTTCCTGTATATCAGCAACCTGCCAACCAAAAACACAGAGCTCCAAATTCTGCAAGCGGCTTACAATCGAAATCTTACAGATTTGGAAAAAGCTTTTACCTCAGCTTTAATGATCAAAAACAGAGAGCTTCAAGAACTGCAAGACAAGAACAAAGATCTTCAGGAGAAGGAACGTGCAGTTTGGCAACAACATGAAGAATTGAAAAAGCAGAGAACTCCACCCTCTTGCCCTACAAACACAGGGAATAATGACTGTCCTCAACCTATGAACTGTGCTGAAGGCTGGGAGTATTATGGGGGGAAGTGCTATTACTTCTCCCCTGATAAACTGACCTGGGCTCAGAGTCGGGATGAGTGTATCACCAGGGGGGGACACCTTGTCATCATAGGGAGCCTAGAGGAGCAGACGTTCTTAGATCAGAAAAGTGGTACAAAAATAAGTACGGAGCCTGAAGACAAGTTCTGGATTGGGCTGACGGACAGTATAAACGAGAATGAGTGGTTATGGGTGGACAATTCATCTCTAAGCACAAGATTCTGGCTTGGTGACTGGGAGCCAGATGACTGGAAAGGAGAGAATTCCGAAGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGGGAACGGGGTGGTACTAAAGACGGCAAGAGTTGGTTGGATGTCAACTGTAATAAGACTCAAAGAAGAATATGTGAGACAAAATCCCCCTTGTGAAACAGTATCTTTAAGAAACTCAAAAGTTCCTTTTAAATATGTCTCTGAACAACCCCAAAtattgttaagtgtgtgtgttagtgtgggttttcaatTCATTTTTGTAAATCATGATATCTCCATTTTgcagtgcaggaaaattctcagcaacaagagTGAtacaattaagatcctacacctgtacatCATCCTGTGTGTTTTGTACATGTATATTTCTGCTTAACAGTGCTGTCTCTAGGCTAGTCATTTGAGAAAATATTGTGTGTGTCTATCCAAACCATTGAATTAATAAAGTG
>XM_021571884.2
gtCATTGCGAAACTGTTTTGCTGCTGTTTTCAACATCTTCATTCGCTCAGTTCCCATCACACAGAAGAAATTTCTATTTTGGATTGATGTAAATACGTGCCTGGtagcagtgttgaggatcagtgaccACCTCGCCCCACTGAAAGACAGACAATTGCAATAGCTAATTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTAAAGTTCAAAAAGCAACAAAGGACTGAAGGAAAAAATTGTGCAACAGCATCCACAGTGAATGATACCACACACTCTGAAATTTCCAGAACCAGGCGCAACCAGCCATCTATCGACCCTAATgctgGTGACCCTGATTCTCAGGAGGGGTTAAAGGTCAAACCAGGTGGATATGACCCTGTCAAAGTGGTCCTGGTGACTCTCTGTTTTCTTCTGATGGGGACGGTCATTGGACTTGTGTTCCTGTATATCAGCAACCTGCCAACCAAAAACACAGAGCTCCAAATTCTGCAAGCGGCTTACAATCGAAATCTTACAGATTTGGAAAAAGCTTTTACCTCAGCTTTAATGATCAAAAACAGAGAGCTTCAAGAACTGCAAGACAAGAACAAAGATCTTCAGGAGAAGGAACGTGCAGTTTGGCAACAACATGAAGAATTGAAAAAGCAGAGAACTCCACCCTCTTGCCCTACAAACACAGGGAATAATGACTGTCCTCAACCTATGAACTGTGCTGAAGGCTGGGAGTATTATGGGGGGAAGTGCTATTACTTCTCCCCTGATAAACTGACCTGGGCTCAGAGTCGGGATGAGTGTATCACCAGGGGGGGACACCTTGTCATCATAGGGAGCCTAGAGGAGCAGACGTTCTTAGATCAGAAAAGTGGTACAAAAATAAGTACGGAGCCTGAAGACAAGTTCTGGATTGGGCTGACGGACAGTATAAACGAGAATGAGTGGTTATGGGTGGACAATTCATCTCTAAGCACAAGATTCTGGCTTGGTGACTGGGAGCCAGATGACTGGAAAGGAGAGAATTCCGAAGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGGGAACGGGGTGGTACTAAAGACGGCAAGAGTTGGTTGGATGTCAACTGTAATAAGACTCAAAGAAGAATATGTGAGACAAAATCCCCCTTGTGAAACAGTATCTTTAAGAAACTCAAAAGTTCCTTTTAAATATGTCTCTGAACAACCCCAAAtattgttaagtgtgtgtgttagtgtgggttttcaatTCATTTTTGTAAATCATGATATCTCCATTTTgcagtgcaggaaaattctcagcaacaagagTGAtacaattaagatcctacacctgtacatCATCCTGTGTGTTTTGTACATGTATATTTCTGCTTAACAGTGCTGTCTCTAGGCTAGTCATTTGAGAAAATATTGTGTGTGTCTATCCAAACCATTGAATTAATAAAGTG
>XM_021571885.2
gaagtgtCATTGCGAAACTGTTTTGCTGCTGTTTTCAACATCTTCATTCGCTCAGTTCCCATCACACAGAAGAAATTTCTATTTTGGATTGATGTAAATACGTGCCTGGtagcagtgttgaggatcagtgaccACCTCGCCCCACTGAAAGACAGACAATTGCAATAGCTAATTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTAAAGTTCAAAAAGCAACAAAGGACTGAAGGAAAAAATTGTGCATCCACAGTGAATGATACCACACACTCTGAAATTTCCAGAACCAGGCGCAACCAGCCATCTATCGACCCTAATgctgGTGACCCTGATTCTCAGGAGGGGTTAAAGGTCAAACCAGGTGGATATGACCCTGTCAAAGTGGTCCTGGTGACTCTCTGTTTTCTTCTGATGGGGACGGTCATTGGACTTGTGTTCCTGTATATCAGCAACCTGCCAACCAAAAACACAGAGCTCCAAATTCTGCAAGCGGCTTACAATCGAAATCTTACAGATTTGGAAAAAGCTTTTACCTCAGCTTTAATGATCAAAAACAGAGAGCTTCAAGAACTGCAAGACAAGAACAAAGATCTTCAGGAGAAGGAACGTGCAGTTTGGCAACAACATGAAGAATTGAAAAAGCAGAGAACTCCACCCTCTTGCCCTACAAACACAGGGAATAATGACTGTCCTCAACCTATGAACTGTGCTGAAGGCTGGGAGTATTATGGGGGGAAGTGCTATTACTTCTCCCCTGATAAACTGACCTGGGCTCAGAGTCGGGATGAGTGTATCACCAGGGGGGGACACCTTGTCATCATAGGGAGCCTAGAGGAGCAGACGTTCTTAGATCAGAAAAGTGGTACAAAAATAAGTACGGAGCCTGAAGACAAGTTCTGGATTGGGCTGACGGACAGTATAAACGAGAATGAGTGGTTATGGGTGGACAATTCATCTCTAAGCACAAGATTCTGGCTTGGTGACTGGGAGCCAGATGACTGGAAAGGAGAGAATTCCGAAGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGGGAACGGGGTGGTACTAAAGACGGCAAGAGTTGGTTGGATGTCAACTGTAATAAGACTCAAAGAAGAATATGTGAGACAAAATCCCCCTTGTGAAACAGTATCTTTAAGAAACTCAAAAGTTCCTTTTAAATATGTCTCTGAACAACCCCAAAtattgttaagtgtgtgtgttagtgtgggttttcaatTCATTTTTGTAAATCATGATATCTCCATTTTgcagtgcaggaaaattctcagcaacaagagTGAtacaattaagatcctacacctgtacatCATCCTGTGTGTTTTGTACATGTATATTTCTGCTTAACAGTGCTGTCTCTAGGCTAGTCATTTGAGAAAATATTGTGTGTGTCTATCCAAACCATTGAATTAATAAAGTG
>XM_021571889.2
agaagtgtCATTGCGAAACTGTTTTGCTGCTGTTTTCAACATCTTCATTCGCTCAGTTCCCATCACACAGAAGAAATTTCTATTTTGGATTGATGTAAATACGTGCCTGGtagcagtgttgaggatcagtgaccACCTCGCCCCACTGAAAGACAGACAATTGCAATAGCTAATTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTAAAGTTCAAAAAGCAACAAAGGACTGAAGGAAAAAATTGTGCATCCACAGTGAATGATACCACACACTCTGAAATTTCCAGAACCAGGCGCAACCAGCCATCTATCGACCCTAATgcTGGTGACCCTGATTCTCAGgaggggtcaaaggtcaaacCAAGTGGATATGACCCTGTCAGAGTTGTTCTGGTGACTCTCTGTGTTCTTCTGATGGGTGCTGTCATTGGACTTGGGGTTCTCTTTTTGAAACATAATCAAGAATTGATTGTGCAGAGAACTTGCTGTAAGATCACAGagGATGAGCGTCCAATATGTGCTCATGATTGGATGTGTCACGGGAAAAACTGCTATTATTTTTCCAATGATAGTCTGACCTGGGTTGAGAGTCAGGATAAATGTGTCTCCATGGGAGGAAAGCTGGTCATCATAGACAGCCTTTATGAGCAGACAATCTTAGATAAGAAAGTTGGTGCTATAATGAGTGGTGGTGAAGACAAGTTCTGGATCGGACTGACAGACCAAAAAGAAGAGGGAAAGTGGTTATGGGTGGACGACACACCTCTAGATTCAAATAACAGCTTCTGGTTTGCTTCCCAAAATGGCAAGAAAGAGCCTGACAACTGGCAAGGAGACAAGGAAAGACAAAATCCAGACGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGAGAAAAAGGTGGTACTCATGATGGCAAGAGTTGGTTTGATGTCAACTGTGGTTGGTCTCACAGAAGAATATGTGAGATAATGTTATTCTGAAATttcatttttgtcccccccccccagttttatcattggaatgtgatacaaaacaggCTTTAGGACCGTGGACGTGTCCGAGCAGTCGGGTGGTCTGTTTGAAGTGTTTATCCGACCGGATACAAGAAAAAAAATACCTTATGTCcctcccacttctaaaaccaaagttgcgcccctgtgaTACAGTATCTGTGTGAAAAAAAAAGTATTGAATTTTGCTATGAACATAAAAGTATCTTTACGTTTCTTTTTGCTGACATTTATAATAAGAAGTGAGGATAAACTGTATTGGTAAATGTATTACAGTAGCTTACTGCTGATGTTAACAGACTGCTTGTTATCGACAATATGTTTATGCTTTATGTGTTTTATGCAATAATGTAAAACATGCCAAATCTACAACTGAGCCTAACAAAAAACATGTCAGATATTTTCAGTTCAgcattttctttattaaagaacaacTC
>XM_021571888.2
gagaagtgtCATTGCGAAACTGTTTTGCTGCTGTTTTCAACATCTTCATTCGCTCAGTTCCCATCACACAGAAGAAATTTCTATTTTGGATTGATGTAAATACGTGCCTGGtagcagtgttgaggatcagtgaccACCTCGCCCCACTGAAAGACAGACAATTGCAATAGCTAATTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTAAAGTTCAAAAAGCAACAAAGGACTGAAGGAAAAAATTGTGCAACAGCATCCACAGTGAATGATACCACACACTCTGAAATTTCCAGAACCAGGCGCAACCAGCCATCTATCGACCCTAATgcTGGTGACCCTGATTCTCAGgaggggtcaaaggtcaaacCAAGTGGATATGACCCTGTCAGAGTTGTTCTGGTGACTCTCTGTGTTCTTCTGATGGGTGCTGTCATTGGACTTGGGGTTCTCTTTTTGAAACATAATCAAGAATTGATTGTGCAGAGAACTTGCTGTAAGATCACAGagGATGAGCGTCCAATATGTGCTCATGATTGGATGTGTCACGGGAAAAACTGCTATTATTTTTCCAATGATAGTCTGACCTGGGTTGAGAGTCAGGATAAATGTGTCTCCATGGGAGGAAAGCTGGTCATCATAGACAGCCTTTATGAGCAGACAATCTTAGATAAGAAAGTTGGTGCTATAATGAGTGGTGGTGAAGACAAGTTCTGGATCGGACTGACAGACCAAAAAGAAGAGGGAAAGTGGTTATGGGTGGACGACACACCTCTAGATTCAAATAACAGCTTCTGGTTTGCTTCCCAAAATGGCAAGAAAGAGCCTGACAACTGGCAAGGAGACAAGGAAAGACAAAATCCAGACGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGAGAAAAAGGTGGTACTCATGATGGCAAGAGTTGGTTTGATGTCAACTGTGGTTGGTCTCACAGAAGAATATGTGAGATAATGTTATTCTGAAATttcatttttgtcccccccccccagttttatcattggaatgtgatacaaaacaggCTTTAGGACCGTGGACGTGTCCGAGCAGTCGGGTGGTCTGTTTGAAGTGTTTATCCGACCGGATACAAGAAAAAAAATACCTTATGTCcctcccacttctaaaaccaaagttgcgcccctgtgaTACAGTATCTGTGTGAAAAAAAAAGTATTGAATTTTGCTATGAACATAAAAGTATCTTTACGTTTCTTTTTGCTGACATTTATAATAAGAAGTGAGGATAAACTGTATTGGTAAATGTATTACAGTAGCTTACTGCTGATGTTAACAGACTGCTTGTTATCGACAATATGTTTATGCTTTATGTGTTTTATGCAATAATGTAAAACATGCCAAATCTACAACTGAGCCTAACAAAAAACATGTCAGATATTTTCAGTTCAgcattttctttattaaagaacaacTC
>TU1769079
GATTGATGTAAATACGTGCCTGGtagcagtgttgaggatcagtgaccACCTCGCCCCACTGAAAGACAGACAATTGCAATAGCTAATTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTAAAGTTCAAAAAGCAACAAAGGACTGAAGGAAAAAATTGTGCAACAGCATCCACAGTGAATGATACCACACACTCTGAAATTTCCAGAACCAGGCGCAACCAGCCATCTATCGACCCTAATgcTGGTGACCCTGATTCTCAGgaggggtcaaaggtcaaacCAAGTGGATATGACCCTGTCAGAGTTGTTCTGGTGACTCTCTGTGTTCTTCTGATGGGTGCTGTCATTGGACTTGGGGTTCTCTTTTTGAAACATAATCAAGAATTGATTGTGCAGAGAACTTGCTGTAAGATCACAGGTACTATGCGAGAATGTCCAAATAAATAGTGGCACAAGATTCAGTCATTCCAAAAAAGTGCTTTGTTACATAGGCCTATGTTTTATATCATAGAATATACTCCATTAAGGAATTGGAATTACTATAAGACATTCCATggtaaaaaagaaaagaaaatggaAGTCACTTCAAACCTAATTTTATTGCCTCGGTTTCagtctatttctgcttttttctTATCCCACTTAGGCTGAGGCTAAGTGTATGCATAGTAAATCAATGTGTTTTCATGTCAGTATGGATCTCATACAATCAgtaagataaaaaaataaaaaaatattattcatATAGTATGTTACAAATACTTCATTTTGATAAGGGACTATTGACAAAGACGTATATATCACCAGGTTATTtctgttccctccctccacagagGATGAGCGTCCAATATGTGCTCATGATTGGATGTGTCACGGGAAAAACTGCTATTATTTTTCCAATGATAGTCTGACCTGGGTTGAGAGTCAGGATAAATGTGTCTCCATGGGAGGAAAGCTGGTCATCATAGACAGCCTTTATGAGCAGGTAGTTATCATGACTATTGAATGGGAATTAAATTATACATTGCGTCTGTCCTTCCATATTATCTTTCATTAATTAAGGCTGTGGTCGGGCAATAGATTTTGTATCCACAAATTACAGATTGAGCCAATGGGTTTATAAGATTTGAAAGTGCTTTACATTTTATTATGAGATCTCAGTACCATGTCAGTCTAATGAGAAAAAAACAGCTATAAAGCACATGCAATTAAACATGCAATCTACAAAAATTAAAGTACACCATGTTTGACTGTATTTAAAAAGATAATTCAGCCAATtacataattttttattttttgcctTATAAGGCTAAACTGAAATGAGTCTATGGACAAGGAGAGACTGCAAAGCACGCTTTTGTTTTGTATACCTCGCTTTTAGTGGttacagcgttgggccagtaaccgaaaggttgctggatcgaatccctgagctgacaaggtaaacatctgtcattccgcccctgagcaagacagttaacccactgttagcCGGGCGGCGacgacgtggatgtcgattatggcagccccccgcacctcactgattcagaggggttgggttaaatgcggaagacacatttcagttgaatgcatccagttgtacaactgactagttatccccctttccctgttGTCACCAACCGCTAATTGTAGCATTTCATAACCAAAACCAATCAAATTAAAACACTTTTTAGTCATTGAGCTTTAGGTTCCACAAAAGCGTGGATTACTGTTCTTGGATGTACTCGACTAGTCCATAGACTGCTATCTATCAGTGTAAGGCaacatttgggtgaactatccattTAACCCATTGTAGCACTCTATATAATTTGTCAATCAATGTTCCTGGTGAAGACAATCTTAGATAAGAAAGTTGGTGCTATAATGAGTGGTGGTGAAGACAAGTTCTGGATCGGACTGACAGACCAAAAAGAAGAGGGAAAGTGGTTATGGGTGGACGACACACCTCTAGATTCAAATAACAGGTCAGAAGTTATCTTGAATagtaatacatttacaaaagcaTGATCATTCAGTATTGCTGAGTATTGTATGGTGTATTAGAGTATTGTGATGTGTTCTCATAATTGACAAAACACAAAAATACAGGTGAAATGATGATTCCCAATCAATGCAGTTAATATGAGGACGTGGATGGCTGAATGAATTATAATGTAATTCCTCTGTAGCTTCTGGTTTGCTTCCCAAAATGGCAAGAAAGAGCCTGACAACTGGCAAGGAGACAAGGAAAGACAAAATCCAGACGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGAGAAAAAGGTGGTACTCATGATGGCAAGAGTTGGTTTGATGTCAACTGTGGTTGGTCTCACAGAAGAATATGTGAGATAATGTTATTCTGAAATttcatttttgtcccccccccccagttttatcattggaatgtgatacaaaacaggCTTTAGGACCGTGGACGTGTCCGAGCAGTCGGGTGGTCTGTTTGAAGTGTTTATCCGACCGGATACAAGAAAAAAAATACCTTATGTCcctcccacttctaaaaccaaagttgcgcccctgtgaTACAGTATCTGTGTGAAAAAAAAAGTATTGAATTTTGCTATGAACATAAAAGTATCTTTACGTTTCTTTTTGCTGACATTTATAATAAGAAGTGAGGATAAACTGTATTGGTAAATGTATTACAGTAGCTTACTGCTGATGTTAACAGACTGCTTGTTATCGACAATATGTTTATGCTTTATGTGTTTTATGCAATAATGTAAAACATGCCAAATCTACAACTGAGCCTAACAAAAAACATGTCAGATATTTTCAGTTCAgcattttctttattaaagaacaacTCCACCC
>TU1769081
GATTGATGTAAATACGTGCCTGGtagcagtgttgaggatcagtgaccACCTCGCCCCACTGAAAGACAGACAATTGCAATAGCTAATTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTAAAGTTCAAAAAGCAACAAAGGACTGAAGGAAAAAATTGTGCAACAGCATCCACAGTGAATGATACCACACACTCTGAAATTTCCAGAACCAGGCGCAACCAGCCATCTATCGACCCTAATgcTGGTGACCCTGATTCTCAGgaggggtcaaaggtcaaacCAAGTGGATATGACCCTGTCAGAGTTGTTCTGGTGACTCTCTGTGTTCTTCTGATGGGTGCTGTCATTGGACTTGGGGTTCTCTGTAAGTACTATAGAGTAGACCCATAGTGGAGTCCAGAGTAGGAGCAGGAGTCCCCAAACTGGCTGTTCACATATGAGGCGGGATAGGATAGCTACAGGAAAGTTGGGTCAAACTCATTACTGTACATTTCAAATGTGTCTTTTTCACACTGATACAACTAGCCCACAAACCCAGTGCAGCGCTCTTCAAAATCTCAAACATTTGATTGAAAATAATCTTACAGCAGGTGAATTTTGGATCATATGACTCATGCTAAGATGAATACTAAACAGTACATTTCCATTGACATTTTCATCCCTATAAAAAGTGTATAGTGTATGGGCTTTACCCTCTCAGTTATAAGGAAATGATTGATGTCACGATGCAAAAATGTAACATCTGTTTTAaccagaagagagaaggggaagtcTGAGTACAAAATGTGACTCGGTTTTCTCTTTTTTCTCAACAGTTTTGAAACATAATCAAGAATTGATTGTGCAGAGAACTTGCTGTAAGATCACAGGTACTATGCGAGAATGTCCAAATAAATAGTGGCACAAGATTCAGTCATTCCAAAAAAGTGCTTTGTTACATAGGCCTATGTTTTATATCATAGAATATACTCCATTAAGGAATTGGAATTACTATAAGACATTCCATggtaaaaaagaaaagaaaatggaAGTCACTTCAAACCTAATTTTATTGCCTCGGTTTCagtctatttctgcttttttctTATCCCACTTAGGCTGAGGCTAAGTGTATGCATAGTAAATCAATGTGTTTTCATGTCAGTATGGATCTCATACAATCAgtaagataaaaaaataaaaaaatattattcatATAGTATGTTACAAATACTTCATTTTGATAAGGGACTATTGACAAAGACGTATATATCACCAGGTTATTtctgttccctccctccacagagGATGAGCGTCCAATATGTGCTCATGATTGGATGTGTCACGGGAAAAACTGCTATTATTTTTCCAATGATAGTCTGACCTGGGTTGAGAGTCAGGATAAATGTGTCTCCATGGGAGGAAAGCTGGTCATCATAGACAGCCTTTATGAGCAGGTAGTTATCATGACTATTGAATGGGAATTAAATTATACATTGCGTCTGTCCTTCCATATTATCTTTCATTAATTAAGGCTGTGGTCGGGCAATAGATTTTGTATCCACAAATTACAGATTGAGCCAATGGGTTTATAAGATTTGAAAGTGCTTTACATTTTATTATGAGATCTCAGTACCATGTCAGTCTAATGAGAAAAAAACAGCTATAAAGCACATGCAATTAAACATGCAATCTACAAAAATTAAAGTACACCATGTTTGACTGTATTTAAAAAGATAATTCAGCCAATtacataattttttattttttgcctTATAAGGCTAAACTGAAATGAGTCTATGGACAAGGAGAGACTGCAAAGCACGCTTTTGTTTTGTATACCTCGCTTTTAGTGGttacagcgttgggccagtaaccgaaaggttgctggatcgaatccctgagctgacaaggtaaacatctgtcattccgcccctgagcaagacagttaacccactgttagcCGGGCGGCGacgacgtggatgtcgattatggcagccccccgcacctcactgattcagaggggttgggttaaatgcggaagacacatttcagttgaatgcatccagttgtacaactgactagttatccccctttccctgttGTCACCAACCGCTAATTGTAGCATTTCATAACCAAAACCAATCAAATTAAAACACTTTTTAGTCATTGAGCTTTAGGTTCCACAAAAGCGTGGATTACTGTTCTTGGATGTACTCGACTAGTCCATAGACTGCTATCTATCAGTGTAAGGCaacatttgggtgaactatccattTAACCCATTGTAGCACTCTATATAATTTGTCAATCAATGTTCCTGGTGAAGACAATCTTAGATAAGAAAGTTGGTGCTATAATGAGTGGTGGTGAAGACAAGTTCTGGATCGGACTGACAGACCAAAAAGAAGAGGGAAAGTGGTTATGGGTGGACGACACACCTCTAGATTCAAATAACAGCTTCTGGTTTGCTTCCCAAAATGGCAAGAAAGAGCCTGACAACTGGCAAGGAGACAAGGAAAGACAAAATCCAGACGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGAGAAAAAGGTGGTACTCATGATGGCAAGAGTTGGTTTGATGTCAACTGTGGTTGGTCTCACAGAAGAATATGTGAGATAATGTTATTCTGAAATttcatttttgtcccccccccccagttttatcattggaatgtgatacaaaacaggCTTTAGGACCGTGGACGTGTCCGAGCAGTCGGGTGGTCTGTTTGAAGTGTTTATCCGACCGGATACAAGAAAAAAAATACCTTATGTCcctcccacttctaaaaccaaagttgcgcccctgtgaTACAGTATCTGTGTGAAAAAAAAAGTATTGAATTTTGCTATGAACATAAAAGTATCTTTACGTTTCTTTTTGCTGACATTTATAATAAGAAGTGAGGATAAACTGTATTGGTAAATGTATTACAGTAGCTTACTGCTGATGTTAACAGACTGCTTGTTATCGACAATATGTTTATGCTTTATGTGTTTTATGCAATAATGTAAAACATGCCAAATCTACAACTGAGCCTAACAAAAAACATGTCAGATATTTTCAGTTCAgcattttctttattaaagaacaacTCCACCC
>TU1769086
GATTGATGTAAATACGTGCCTGGtagcagtgttgaggatcagtgaccACCTCGCCCCACTGAAAGACAGACAATTGCAATAGCTAATTATGTCTGAAGGAATAGTCTACGCTGATGTAAAGTTCAAAAAGCAACAAAGGACTGAAGGAAAAAATTGTGCAACAGCATCCACAGTGAATGATACCACACACTCTGAAATTTCCAGAACCAGGCGCAACCAGCCATCTATCGACCCTAATgcTGGTGACCCTGATTCTCAGgaggggtcaaaggtcaaacCAAGTGGATATGACCCTGTCAGAGTTGTTCTGGTGACTCTCTGTGTTCTTCTGATGGGTGCTGTCATTGGACTTGGGGTTCTCTTTTTGAAACATAATCAAGAATTGATTGTGCAGAGAACTTGCTGTAAGATCACAGGTACTATGCGAGAATGTCCAAATAAATAGTGGCACAAGATTCAGTCATTCCAAAAAAGTGCTTTGTTACATAGGCCTATGTTTTATATCATAGAATATACTCCATTAAGGAATTGGAATTACTATAAGACATTCCATggtaaaaaagaaaagaaaatggaAGTCACTTCAAACCTAATTTTATTGCCTCGGTTTCagtctatttctgcttttttctTATCCCACTTAGGCTGAGGCTAAGTGTATGCATAGTAAATCAATGTGTTTTCATGTCAGTATGGATCTCATACAATCAgtaagataaaaaaataaaaaaatattattcatATAGTATGTTACAAATACTTCATTTTGATAAGGGACTATTGACAAAGACGTATATATCACCAGGTTATTtctgttccctccctccacagagGATGAGCGTCCAATATGTGCTCATGATTGGATGTGTCACGGGAAAAACTGCTATTATTTTTCCAATGATAGTCTGACCTGGGTTGAGAGTCAGGATAAATGTGTCTCCATGGGAGGAAAGCTGGTCATCATAGACAGCCTTTATGAGCAGACAATCTTAGATAAGAAAGTTGGTGCTATAATGAGTGGTGGTGAAGACAAGTTCTGGATCGGACTGACAGACCAAAAAGAAGAGGGAAAGTGGTTATGGGTGGACGACACACCTCTAGATTCAAATAACAGGTCAGAAGTTATCTTGAATagtaatacatttacaaaagcaTGATCATTCAGTATTGCTGAGTATTGTATGGTGTATTAGAGTATTGTGATGTGTTCTCATAATTGACAAAACACAAAAATACAGGTGAAATGATGATTCCCAATCAATGCAGTTAATATGAGGACGTGGATGGCTGAATGAATTATAATGTAATTCCTCTGTAGCTTCTGGTTTGCTTCCCAAAATGGCAAGAAAGAGCCTGACAACTGGCAAGGAGACAAGGAAAGACAAAATCCAGACGGTGAAGACTGTGCTAGAATGGGAGAAAAAGGTGGTACTCATGATGGCAAGAGTTGGTTTGATGTCAACTGTGGTTGGTCTCACAGAAGAATATGTGAGATAATGTTATTCTGAAATttcatttttgtcccccccccccagttttatcattggaatgtgatacaaaacaggCTTTAGGACCGTGGACGTGTCCGAGCAGTCGGGTGGTCTGTTTGAAGTGTTTATCCGACCGGATACAAGAAAAAAAATACCTTATGTCcctcccacttctaaaaccaaagttgcgcccctgtgaTACAGTATCTGTGTGAAAAAAAAAGTATTGAATTTTGCTATGAACATAAAAGTATCTTTACGTTTCTTTTTGCTGACATTTATAATAAGAAGTGAGGATAAACTGTATTGGTAAATGTATTACAGTAGCTTACTGCTGATGTTAACAGACTGCTTGTTATCGACAATATGTTTATGCTTTATGTGTTTTATGCAATAATGTAAAACATGCCAAATCTACAACTGAGCCTAACAAAAAACATGTCAGATATTTTCAGTTCAgcattttctttattaaagaacaacTCCACCC

Function


NR:

description
C-type lectin domain family 4 member D-like isoform X6

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036952672.1 False 1529 mRNA 0.42 9 38121576 38132547
XM_036952674.1 False 1467 mRNA 0.42 8 38121576 38132548
XM_021571887.2 False 1447 mRNA 0.42 8 38121576 38132552
XM_036952673.1 False 1528 mRNA 0.42 9 38121576 38132552
XM_021571884.2 False 1434 mRNA 0.43 9 38121576 38152313
XM_021571885.2 False 1433 mRNA 0.42 9 38121576 38152318
XM_021571889.2 False 1437 mRNA 0.41 7 38147595 38152319
XM_021571888.2 False 1444 mRNA 0.41 7 38147595 38152320
TU1769079 False 2852 lncRNA 0.38 4 38147590 38152232
TU1769081 False 3099 TUCP 0.39 4 38147590 38152232
TU1769086 True 1980 TUCP 0.38 5 38147590 38152232

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110496145 LOC106588474 coding downstream 129207 37978117 ~ 37992369 (-)
ppt1 LOC106588481 coding downstream 190831 37922153 ~ 37930745 (-)
LOC110496137 LOC106570035 coding downstream 266844 37844036 ~ 37854732 (-)
LOC110496134 LOC106511154 coding downstream 324632 37758788 ~ 37796944 (-)
LOC118941234 NA coding downstream 340129 37781369 ~ 37781447 (-)
trnaa-ugc-137 NA coding upstream 143563 38295883 ~ 38295956 (-)
LOC118936476 LOC106588460 coding upstream 336550 38488870 ~ 38491346 (-)
LOC110496164 LOC106588460 coding upstream 349799 38502119 ~ 38505762 (-)
LOC110496165 LOC106588460 coding upstream 363695 38516015 ~ 38518074 (-)
LOC118940976 LOC106588460 coding upstream 365583 38517903 ~ 38519789 (-)
G1546013 NA non-coding downstream 14147 38098706 ~ 38107429 (-)
G1546011 NA non-coding downstream 25245 38095976 ~ 38096331 (-)
G1545988 NA non-coding downstream 54025 38065502 ~ 38067551 (-)
G1545989 NA non-coding downstream 56445 38064584 ~ 38065131 (-)
G1545986 NA non-coding downstream 59337 38061927 ~ 38062239 (-)
G1545996 LOC106570014 non-coding upstream 4845 38157165 ~ 38159050 (-)
G1546061 LOC106588464 non-coding upstream 36653 38188973 ~ 38192777 (-)
G1546072 NA non-coding upstream 47826 38200146 ~ 38203696 (-)
G1546073 NA non-coding upstream 51862 38204182 ~ 38204511 (-)
G1546186 NA non-coding upstream 196303 38348623 ~ 38349085 (-)
G1544806 NA other downstream 819402 37301508 ~ 37302174 (-)
G1543346 LOC106588513 other downstream 2108890 36010987 ~ 36012686 (-)
G1543128 LOC106588245 other downstream 2617419 35452618 ~ 35504157 (-)
G1546053 NA other upstream 12930 38165250 ~ 38214049 (-)
LOC110496167 LOC106588455 other upstream 407329 38557052 ~ 38563365 (-)
LOC110496175 LOC104924380 other upstream 522121 38674378 ~ 38676029 (-)
G1546385 LOC106588448 other upstream 615777 38768097 ~ 38773684 (-)
G1546396 LOC106588446 other upstream 623964 38776284 ~ 38787801 (-)
LOC118941154 NA coding downstream 6228 38140729 ~ 38141362 (-)
G1546047 NA non-coding downstream 1878 38145512 ~ 38145712 (-)
LOC118941140 NA other downstream 2650608 35492995 ~ 35499681 (-)

Expression



Co-expression Network