LOC110496322 (LOC106588302)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110496322
gene name LOC106588302
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 42872572 ~ 43014066 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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TU1774282 False 356 TUCP 0.49 2 42889628 42893465
TU1774303 False 512 TUCP 0.48 5 42889628 42960139
TU1774307 False 356 TUCP 0.48 3 42889628 42893465
TU1774309 False 386 TUCP 0.48 3 42889628 42925509
TU1774312 False 386 TUCP 0.48 4 42889628 42925509
TU1774287 False 396 TUCP 0.48 3 42892906 42925509
TU1774278 False 1114 lncRNA 0.42 5 42895031 42992078
TU1774295 False 767 lncRNA 0.56 4 42895031 42976541
TU1774297 False 1125 lncRNA 0.41 5 42895031 42992078
TU1774284 False 382 TUCP 0.48 2 42899629 42900202
TU1774288 False 392 TUCP 0.47 2 42899629 42952382
TU1774305 False 374 TUCP 0.48 2 42916080 42925509
TU1774268 False 559 lncRNA 0.54 3 42918249 42976541
TU1774269 False 559 lncRNA 0.54 2 42918249 42976541
TU1774271 False 559 lncRNA 0.54 3 42918249 42976541
TU1774276 False 1112 lncRNA 0.42 3 42918249 42992078
TU1774279 False 559 lncRNA 0.53 4 42918249 42976541
TU1774292 False 817 lncRNA 0.49 3 42918249 42962808
TU1774286 False 396 TUCP 0.48 2 42924916 42925509
TU1774308 False 403 TUCP 0.49 3 42924916 42960139
TU1774304 False 713 lncRNA 0.50 2 42927349 42929091
TU1774313 False 620 lncRNA 0.50 2 42927349 42976541
TU1774267 False 558 lncRNA 0.54 3 42953765 42976541
TU1774274 False 884 lncRNA 0.47 4 42953765 43014066
TU1774277 False 404 TUCP 0.49 2 42959538 42960139
TU1774275 True 574 lncRNA 0.52 2 42961974 42976541

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110496823 LOC106588258 coding upstream 73906 42869086 ~ 42877925 (+)
LOC110496316 LOC106588308 coding upstream 98344 42824721 ~ 42853487 (+)
LOC110496314 LOC106588311 coding upstream 204486 42701324 ~ 42747355 (+)
LOC110496312 LOC106588312 coding upstream 266818 42629631 ~ 42685013 (+)
LOC110496329 LOC106588300 coding downstream 104117 43058037 ~ 43085386 (+)
LOC110496331 NA coding downstream 304658 43258578 ~ 43283536 (+)
LOC110496337 LOC106569856 coding downstream 1027152 43981072 ~ 43985638 (+)
LOC110496338 LOC106588533 coding downstream 1042364 43996284 ~ 44007578 (+)
akap9 NA coding downstream 1066724 44020644 ~ 44158791 (+)
G1550619 NA non-coding upstream 134702 42816886 ~ 42817129 (+)
G1550594 NA non-coding upstream 170565 42781059 ~ 42781266 (+)
G1550593 NA non-coding upstream 171020 42780579 ~ 42780811 (+)
G1550411 NA non-coding upstream 326412 42625042 ~ 42625419 (+)
G1550637 NA non-coding downstream 38201 42992121 ~ 42997284 (+)
G1550687 NA non-coding downstream 48312 43002232 ~ 43004601 (+)
G1550692 NA non-coding downstream 65943 43019863 ~ 43020624 (+)
G1550636 LOC106588302 non-coding downstream 70345 43024265 ~ 43025705 (+)
G1550707 NA non-coding downstream 86951 43040871 ~ 43041170 (+)
G1550614 NA other upstream 143026 42808458 ~ 42808805 (+)
G1549676 NA other upstream 606077 42344986 ~ 42345754 (+)
G1549511 NA other upstream 910919 42037276 ~ 42040912 (+)
LOC110496935 LOC106588280 other upstream 947335 42002708 ~ 42004496 (+)
LOC110496287 LOC106588335 other upstream 1035756 41903543 ~ 41922276 (+)
G1551388 NA other downstream 636616 43590536 ~ 43594314 (+)
G1551855 LOC106588565 other downstream 1231973 44185893 ~ 44187344 (+)
G1552184 LOC106588560 other downstream 1542992 44496912 ~ 44497132 (+)
G1552195 NA other downstream 1551213 44505133 ~ 44505494 (+)
G1553260 NA other downstream 2505652 45459572 ~ 45459883 (+)
LOC110496305 pex11b coding upstream 366002 42501407 ~ 42506570 (+)
LOC110496306 rit1 coding upstream 371269 42491250 ~ 42501303 (+)
G1550708 NA non-coding downstream 27604 43041670 ~ 43041901 (+)
G1550712 NA non-coding downstream 33422 43047488 ~ 43047754 (+)

Expression

LOC110496322(LOC106588302) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 150.
End of interactive chart.

LOC110496322(LOC106588302) Expression in each Bioproject

Bar chart with 20 bars.
LOC110496322(LOC106588302) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 400.
End of interactive chart.

Co-expression Network