LOC118940981


Basic Information

Item Value
gene id LOC118940981
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 43577657 ~ 43584921 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036951053.1
ACAACAAGCACAACTGAGGCTCCTATAGACATCACTACTGTAGCTCCTATGCCCCCCACAATTGCAACTTCAACTACAACTGTAGCATCacttacaacaacaactgcagatgcttccaccaccacaagtgcagcacctactacgtcaatcacaactgcaggtcctactaaCATTTTAACTCCAACGACAAGCACAACTGAGGCTCCTATAGACatcactactgtagctcctttgaaccccacaattgcaacttcttcaacaactgtagctccaacgATCACTACAACTGCAGaagctcctacaacaacaactgtagctgcttcTACATTTACTACTGCATcccctactgcaaccacaacagaagctccttctacaacaactgtagcaccAATGACTTTAGGAACAACAGTCCCAACGACAACTGCAGCTAATTCCTCAACTGTAGCTCCTTCAATGCCAAtcccaactgcagctcctacaacaacaactCTTGCTCAATCGACCTCTACAACTTCAGCACCCACTACTTTATTcacaactgcaggtcctactaccaTTTTACCTCcttcgacaaccacaacaacatccaCTACAACAACTGTTGCTCCTTCAATGTCAATctcaactgcaggtcctactaccaATTTAACTCCAACGACATCCACAACTGAAGCTCTTACAGAAatcacaactgtagctcctatgcCCCCCACAATTGCAACTTCAACTGCAGCATcacctacaacaacaactgcagatGCTTCCACAACCACAGGTGCAGCACTTACTACATCAATctcaactgcaggtcctactaccaTTTTGACTACTAAGACAATCACAACTGAATCTCCTACAGAAATCACAACTGTAGCTCTTATGACCCCCACAATTGCAGCTTCTACTTCAACAACTGTTGCTCCCACGACAACAACTGCAGCAGCTCCTataacaacaactgtagctgcttccATAAACGCAACAGCAGAACCTACTACGTCAATcacaactgcaggtcctactaaCATTTTAACTCCAACGACAAGCACAACTGAGGCTCCTATAGACATCACTACTGTAGCTCCTATGCCCCCCACAATTGCAACTTCAACTACAACTGTAGCATcacctacaacaacaactgcagatgcttccaccaccacaaGTGCAGCACCTACTACATCAATCccaactgcaggtcctactaccaTTTTGACTACTAAGGCAATCACAACTGAATCTCCTATAGACatcactactgtagctcctttgaaccccacaattgcaacttcttcttcaacaactgtagctccaacgATCACTACAACTGCAGaagctcctacaacaacaactgtagctgcttcTACATTTACTACTGCATcccctactgcaaccacaacagaagctccttctacaacaactgtagcaccAATGACTTTAGGAACAACAGTCCCAACGACAACTGCAGCTAATTCCTCAACTGTATCTCCTTCAATGCCAAtcccaactgcagctcctacaacaacaactCTTGCTCATTCGACCTCTACAACTTCAGCACCCACTACTTTATTCACAACTGCAGGTGCTACTACCATTTTACCTCcttcgacaaccacaacaacatccaCTACAACAACTGTTGCTCCTTCAATGTCAATctcaactgcaggtcctactaccaATTTAACTccaacgacaaccacaactgaagctctTACAGAAatcacaactgtagctcctatgcCCCCCACAATTGCAACTTCAACTGCAGCATcacctacaacaacaactgcagatGCTTCCACAACCACAGGTGCAGCACTTACTACATCAATctcaactgcaggtcctactaccaTTTTGACTACTAAGACAATCACAACTGAATCTCCTACAGAAATCACAACTGTAGCTCTTATGACCCCCACAATTGCAGCTTCTACTTCAACAACTGTTGCTCCCACGACAACAACTGCAGCAGCTCCTataacaacaactgtagctgcttccATAAACGCAACAGCAGCACCTACTACGTCAATcacaactgcaggtcctactaaCATTTTAACTCCAACGACAAGCACAACTGAGGCTCCTATAGACATCACTACTGTAGCTCCTATGCCCCCCACAATTGCAACTTCAACTACAACTGTAGCATcacctacaacaacaactgcagatgcttccaccaccacaaGTGCAGCACCTACTACATCAATCccaactgcaggtcctactaccaTTTTGACTACTAAGACAATCACAACTGAATCTCCTATAGACatcactactgtagctcctttgaACCCCACAATTGCAGCTTCTACTTCAACAACTGTTGCTCCCACGACAACAACTGCAGCAGCTCCTATAACAGCAACTGTAGCTGCTTCCATAAACGCAACAGCAGCATCTACTACGTCAATCACAACTGCAGGCCCTACTAACATTTTAACTCCAACGACAAGCACAACTGAGGCTCCTATAGACatcactactgtagctcctttgaaccccacaattgcaacttcttcttcaacaactgtagctccaacgATCACTACAACTGCAGaagctcctacaacaacaactgtagctgcttcTACATTTACTACTGCATcccctactgcaaccacaacagaagctccttctacaacaactgtagcaccAATGACTTTAGGAACAACAGTCCCAACGACAACTGCAGCTAATTCCTCAACTGTAGCTCCTTCAATGCCAAtcccaactgcagctcctacaacaacaactCTTGCTCATTCGACCTCTACAACTTCAGCACCCACTACTTTATTcacaactgcaggtcctactaccaTTTTACCTCcttcgacaaccacaacaacatccaCTACAACAACTGTTGCTCCTTCAATGTCAATctcaactgcaggtcctactaccaATTTAACTccaacgacaaccacaactgaagctctTACAGAAatcacaactgtagctcctatgcCCCCCACAATTGCAACTTCAACTGCAGCATcacctacaacaacaactgcagatGCTTCCACAACCACAGGTGCAGCACTTACTACATCAATctcaactgcaggtcctactaccaTTTTGACTACTAAGACAATCACAACTGAATCTCCTACAGAAATCACAACTGTAGCTCTTATGACCCCCACAATTGCAGCTTCTACTTCAACAACTGTTGCTCCCACGACAACAACTGCAGCAGCTCCTataacaacaactgtagctgcttccATAAACGCAACAGCAGCACCTACTACGTCAATcacaactgcaggtcctactaaCATTTTAACTCCAACGACAAGCACAACTGAGGCTCCTATAGACATCACTACTGTAGCTCCTATGCCCCCCACAATTGCAACTTCAACTACAACTGTAGCATcacctacaacaacaactgcagatgcttccaccaccacaaGTGCAGCACCTACTACATCAATCccaactgcaggtcctactaccaTTTTGACTACTAAGGCAATCACAACTGAATCTCCTATAGACATCACTACTGTAGCTCATTTGAACCCCACAATTGCAGCTTCTACTTCAACAACTGTTGCTCCCACGACAACAACTGCAGCAGCTCCTataacaacaactgtagctgcttccATAAACGCAACAGCAGCACCTACTACGTCAATcacaactgcaggtcctactaaCATTTTAACTCCAACTACAAGCACAACTGAGGCTCCTATAGACatcactactgtagctcctttgaaccccacaattgcaacttcttcttcaacaactgtagctccaacgATCACTACAACTGCAGaagctcctacaacaacaactgtagctgcttcTACATTTACTACTGCATcccctactgcaaccacaacagaagctccttctacaacaactgtagcaccAATGACTTTAGGAACAACAGTCCCAACGACAACTGCAGCTAATTCCTCAACTGTAGCTCCTTCAATGCCAAtcccaactgcagctcctacaacaacaactCTTGCTCATTCGACCTCTACAACTTCAGCACCCACTACTTTATTcacaactgcaggtcctactaccaTTTTACCTCcttcgacaaccacaacaacatccaCCACAACAACTGTTGCTCCTTCAATGTCAATctcaactgcaggtcctactaccaATTTAACTccaacgacaaccacaactgaagctctTACAGACatcacaactgtagctcctatgcCCCCCACAATTGCAACTTCAACTGCAGCATcacctacaacaacaactgcagatGCTTCCACAATCACAGGTGCAGCACTTACTACATCAATctcaactgcaggtcctactaccaTTTTGACTCCTAAGACAATCACAACTGAAGCTCCTACAGAAATCACAACTGTAGATCTTATACCCCCCACAATTGCAGCTTCTACTTCAACAACTGTTGCTCCCACGACATCAACTGCAGCAGCTCCTataacaacaactgtagctgcttccATAAACGCAACAGCAGCATCTACTACGTCAATcacaactgcaggtcctactaaCATTTTAACTCCAACGACAAGCACAACTGAGGCTCCTATAGACatcactactgtagctcctttgaaccccacaattgcaacttcttcttcaacaactgtagctccaacgATCACTACAACTGCAGAAGCTTCTacaacaacaactgtagctggTTCTACATTTACTACTGCATcccctactgcaaccacaacagaagctccttctacaacaactgtagcaccAATGACTTTAGGAACAACAGTCCCAACGGCAGCTAATTCCTCAACTGTAGCTCCTTCAATGCCAAtcccaactgcagctcctacaacaacaactCTTGCTCCTACGAACTCTACAACTTCAGCACACACTACTTTATTcacaactgcaggtcctactaccaTTTTACCTCcttcgacaaccacaacaacatccaCTACAACAACTGTTGCTCCTTC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Function

NR:

description
mucin-19-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036951053.1 True 6417 mRNA 0.45 4 43577657 43584921

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118940980 NA coding downstream 754 43571589 ~ 43576903 (-)
LOC118940979 NA coding downstream 6099 43567310 ~ 43571558 (-)
LOC118940978 NA coding downstream 11016 43561787 ~ 43566641 (-)
LOC110496335 LOC106588256 coding downstream 17199 43554035 ~ 43560458 (-)
LOC110496332 LOC106588296 coding downstream 38554 43518422 ~ 43539103 (-)
LOC118940982 NA coding upstream 14 43584935 ~ 43595178 (-)
LOC118941171 NA coding upstream 10615 43595536 ~ 43596702 (-)
LOC118940983 NA coding upstream 13619 43598540 ~ 43603485 (-)
LOC118940984 NA coding upstream 19403 43604324 ~ 43607758 (-)
LOC118940985 NA coding upstream 23284 43608205 ~ 43610335 (-)
G1551087 LOC106562846 non-coding downstream 431313 43145762 ~ 43146344 (-)
G1551071 NA non-coding downstream 456716 43120322 ~ 43120941 (-)
G1550866 NA non-coding downstream 484362 43093093 ~ 43093295 (-)
G1550861 NA non-coding downstream 491305 43085784 ~ 43086352 (-)
G1550800 NA non-coding downstream 623717 42943061 ~ 42953940 (-)
G1551599 NA non-coding upstream 12518 43597439 ~ 43598917 (-)
LOC118940987 NA non-coding upstream 45360 43624763 ~ 43668196 (-)
G1551623 NA non-coding upstream 89719 43674640 ~ 43706492 (-)
G1551725 NA non-coding upstream 326112 43911033 ~ 43911239 (-)
G1551892 NA non-coding upstream 401608 43986529 ~ 43986759 (-)
LOC118936491 LOC106588302 other downstream 562538 42895031 ~ 43015119 (-)
G1550202 NA other downstream 1218029 42359148 ~ 42359628 (-)
G1550177 LOC106569881 other downstream 1261578 42315286 ~ 42316079 (-)
LOC110496277 LOC106588347 other downstream 1906143 41663436 ~ 41671516 (-)
LOC118941164 LOC106588367 other downstream 2669032 40902519 ~ 40908744 (-)
G1552768 LOC106588550 other upstream 1235842 44820763 ~ 44828808 (-)
G1552866 LOC106588536 other upstream 1462759 45047680 ~ 45087786 (-)
G1552875 LOC106588536 other upstream 1480213 45065134 ~ 45073340 (-)
G1553544 NA other upstream 2082440 45667361 ~ 45667740 (-)

Expression


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