LOC110496414 (LOC106570277)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110496414
gene name LOC106570277
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 49123749 ~ 49131358 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
nuclear inhibitor of protein phosphatase 1-like isoform X3

GO: NA

KEGG:

id description
K13216 PPP1R8, NIPP1; nuclear inhibitor of protein phosphatase 1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G1557360 NA non-coding downstream 93733 49029769 ~ 49030016 (-)
G1557202 NA non-coding downstream 388961 48734557 ~ 48734788 (-)
G1557188 NA non-coding downstream 407982 48715563 ~ 48715767 (-)
G1557993 NA non-coding upstream 131299 49262657 ~ 49319527 (-)
G1558076 NA non-coding upstream 345994 49477352 ~ 49477569 (-)
G1558118 LOC106582599 non-coding upstream 412955 49544313 ~ 49544584 (-)
G1558134 NA non-coding upstream 449616 49580974 ~ 49581482 (-)
G1556577 NA other downstream 766902 48356613 ~ 48356847 (-)
LOC110496401 LOC106588640 other downstream 1140140 47982726 ~ 47986560 (-)
LOC110496837 LOC106588626 other downstream 1178175 47890580 ~ 47945574 (-)
G1555543 NA other downstream 1577178 47543208 ~ 47546614 (-)
G1555168 NA other downstream 2210834 46911977 ~ 46912915 (-)
G1558535 NA other upstream 836538 49967896 ~ 49968608 (-)
LOC110496434 LOC106588680 other upstream 891733 50023087 ~ 50034167 (-)
LOC110496438 LOC106588686 other upstream 1224911 50256021 ~ 50359132 (-)
G1558916 NA other upstream 1305639 50436997 ~ 50437459 (-)
G1559205 NA other upstream 1491733 50623091 ~ 50623983 (-)

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