LOC118940998


Basic Information

Item Value
gene id LOC118940998
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 54254893 ~ 54258383 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036951072.1
ATGAAGGACTCCCCCTGCTCCTTtttcctctgctccctcctcctccctcccctgtcccctcctccctggtCCCTACCTTTCCTGCTCCCCACTCCCCGGTCCCAATCTCCCCTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCGCTGCTCCCTCCTCCCCGCCCCCCTACCTCCCGTGCTCTCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCTTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCTCTCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCAGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGTGCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTATCTCCCGTGCTACCTACCTCCACTGCTCCCTCTTCCCCGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCGCTGCTCCCTCCTCCCCGCCCCCCTACCTCCCGTGCTCTCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCTTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCTCTCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCAGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGTGCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTATCTCCCGTGCTACCTACCTCCACTGCTCCCTCTTCCCCGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCGCCCTACCTCCCGCGCTCCCTATCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCTGTGCTCCCTACCTCCAATGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCGCCActgctccctcctccccactccctaTCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTCCTTCCCGCTCCCTACCTCTACTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTATCTCCCGTGCTCCCACCTCCCCGCTCCCTATCTCCCGTGCTCCCTACCTTCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCTTCCTCCCCGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCActgctccctcctccccactccctaTCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTCCTTCCCGCTCCCTACCTCTACTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTATCTCCCGTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTATCTCCCGTGCTCCCTACCTTCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCTTCCTCCCCGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTACCTCACGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCGCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCGCCCCATCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCATCCTCCCCGCTCTCTACCTCCCGTGCTACCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCTCTCTACCTCCCGTGCTTCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCAGCTCCCTACCTCCCATGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCGCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCTCGCTCCCTACCTCCTGTGCTACCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCACGGCTCCCTCCTCCCAGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCGCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCTCGCTCCCTACCTCCTGTGCTACCTACCTCCACTGCTCCCTCCGCCCCGCTCCCTACCTCCTGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCGCCCATCTCCCACGCTCCCTATCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCTGTGCTCCCTACCTCCAATGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTATCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCGTGGTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCAGCGCCCTACCTCCACTGCTCCCtacctcctctgctccctcctccccgCTCCCTACCTCCCGTGCTACCTACCTCCACTGCTCCCTCCGCCCCGCTCCCTACCTCCTGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTCCTCCCCGCGCCCTACCTCCAATGCTCCCTCCTCCCCGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCActgctccctcctccccatctctcgtGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCCATGCTCCCTATTTCCCATGCTCCCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTACTCCCCACCTCCATTGCTCCCTCCTCCCTTGCTCCCTACCTCCCGTGCTCTCTACCTCCCGTGCTCTCTACCTCCCGTGCTCCCTACCTCCACTGCTCCCTACCTCCactgctccctcctttcctcaAAACAGCTCTCTCTCTGAAGTTCAGTTCTCTAACCTAA

Function

NR:

description
proline-rich protein 36-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036951072.1 True 2940 mRNA 0.67 2 54254893 54258383

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
gmpr gmpr coding upstream 218179 54022282 ~ 54036714 (+)
LOC110496857 LOC106588809 coding upstream 246855 53983637 ~ 54008038 (+)
dync1li1 LOC106588808 coding upstream 326712 53916292 ~ 53928304 (+)
LOC110519664 LOC106588805 coding upstream 372401 53812083 ~ 53882492 (+)
LOC110514975 LOC106588804 coding upstream 524477 53713836 ~ 53730416 (+)
LOC110496546 LOC106588814 coding downstream 64434 54322817 ~ 54409921 (+)
LOC110496545 LOC106588816 coding downstream 154387 54412770 ~ 54510923 (+)
LOC110496548 LOC106588817 coding downstream 295995 54554378 ~ 54576444 (+)
LOC110496549 LOC106588818 coding downstream 373002 54631385 ~ 54635257 (+)
LOC110496550 LOC106588820 coding downstream 399023 54657406 ~ 54687881 (+)
G1562066 NA non-coding upstream 31013 54222678 ~ 54223880 (+)
G1562039 NA non-coding upstream 68036 54185916 ~ 54186857 (+)
G1561990 NA non-coding upstream 89606 54122351 ~ 54165287 (+)
G1561989 NA non-coding upstream 110295 54121731 ~ 54144598 (+)
G1561987 NA non-coding upstream 135963 54118471 ~ 54118930 (+)
G1562086 NA non-coding downstream 2490 54260873 ~ 54261097 (+)
G1562121 LOC106588813 non-coding downstream 55846 54314229 ~ 54315340 (+)
G1562140 NA non-coding downstream 80854 54339237 ~ 54339805 (+)
G1562195 NA non-coding downstream 267661 54526044 ~ 54528153 (+)
G1562197 NA non-coding downstream 271245 54529628 ~ 54552380 (+)
G1561856 NA other upstream 377963 53872173 ~ 53876930 (+)
G1561845 NA other upstream 414022 53817164 ~ 53840871 (+)
G1561544 LOC106588750 other upstream 966428 53277790 ~ 53288465 (+)
snrpd1 snrpd1 other upstream 1075956 53175661 ~ 53178938 (+)
G1563547 NA other downstream 880265 55138648 ~ 55139231 (+)
G1564470 NA other downstream 1649867 55908085 ~ 55908934 (+)
LOC110496862 LOC106588838 other downstream 1770555 56028870 ~ 56504444 (+)
G1564638 LOC106607612 other downstream 1792205 56050588 ~ 56051793 (+)

Expression


Co-expression Network