LOC118941204


Basic Information

Item Value
gene id LOC118941204
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 66113617 ~ 66117779 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036953556.1
cctcctccacctccacctcctcctcctcctcctccctctcctcctcctcccgctccacctcctccccctcctcctcctccccctccacctcctccacctccacctcctcctccccctcctcctcctccacctcctcctcctcctccctctccacctcctcctccaccttctccacctcctccccctcctcctccctctcctcctccacctcctccacctcctccccctccccctcctccacctccccctcctccccccccccctcctcctcctcctcctcctcctcctcctcctcctccacctcctccccctcctccccctccccctcctcctcctccacctcctccccctcctcctccccctccccctcctcctcctcctcctccacctccttcccctccccctcctcctccacctcctccccctcctcctccacctccacctcctccccctcctcctccacctcctccccctccccctcctccacctccacctccaccttctccacctcctccccctcctccacctccacctcctccccctcctcctccctctcctcctccccctcctcctcctccacctcctccccctcctccacctcctcctccccctcctccccctccccctccacctcctccccctcctcctcctcctccccccccccctcctcctcctcctcctcctcctcctccacctcctccccctcctccccctccccctcctcctcctccacctcctccccctcctcctccccctccccctcctccccctcctcctcctcctcctccacctccttcccctccccctcctcctccacctcctccccctcctcctccacctccacctcctccccctcctcctccacctcctccccctccccctcctccacctccacctcctccccctcctcctcaccctcctccccctcctcctcctccacctccttcccctccccctcctcctccacctcctccccctcctcctcctcctcctccccctcctcctcctcctcctcctcctcctccccctccccctcctccccctcctcctcctcctcctccacctcctccccctcctccacctcctcctccccctcctcctcctcctcctccccctcctcctcctcctccctctccacctcctccccctccccctcctccccctcctccacctcctcctccccctccccctcctcctcctcctccacctcctccccctcctcctccccctccccctcctcccccttctcctcctccccctccccctcctcctcctcctcctccacctcctccccctcctcctccacctccttcccctcctcctcctccacctccacctcctccccctcctcctccacctcctccccctccccctcctcctcctcctcctccacctccacctcctccccctcctcctccccctcctcctccacctcctccccctcctcctcctcctcctccacctcctcctcctccctctccacctcctccccctccc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036953556.1 True 1497 mRNA 0.72 4 66113617 66117779

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118941206 NA coding downstream 19068 66080454 ~ 66094549 (-)
LOC110496714 LOC106589042 coding downstream 45521 66051635 ~ 66068096 (-)
epb41a LOC106589039 coding downstream 74146 65894984 ~ 66039471 (-)
xkr8.3 xkr8 coding downstream 332595 65770915 ~ 65781022 (-)
LOC110496706 LOC106589031 coding downstream 345629 65755121 ~ 65767988 (-)
LOC110496715 LOC106589043 coding upstream 19669 66136708 ~ 66167671 (-)
LOC110496892 LOC106589045 coding upstream 52917 66170696 ~ 66179591 (-)
LOC110496716 LOC106589044 coding upstream 62798 66180396 ~ 66215207 (-)
ppp1r11 ppp1r11 coding upstream 122745 66238098 ~ 66242725 (-)
ddx39b uap56 coding upstream 176334 66294113 ~ 66313899 (-)
G1575480 NA non-coding downstream 36222 66077196 ~ 66077395 (-)
G1575478 NA non-coding downstream 37579 66075830 ~ 66076038 (-)
G1575472 NA non-coding downstream 64866 66046470 ~ 66048751 (-)
G1575456 NA non-coding downstream 102615 66010787 ~ 66011002 (-)
G1575454 NA non-coding downstream 103716 66009662 ~ 66009901 (-)
G1575510 NA non-coding upstream 16102 66133881 ~ 66134171 (-)
G1575413 NA non-coding upstream 17044 66134823 ~ 66135289 (-)
G1575514 NA non-coding upstream 34594 66152373 ~ 66152767 (-)
G1575475 NA other downstream 57378 66055682 ~ 66056239 (-)
G1575457 NA other downstream 59882 66014469 ~ 66053735 (-)
G1575282 NA other downstream 314942 65797630 ~ 65798675 (-)
G1575088 NA other downstream 802566 65310043 ~ 65311051 (-)
G1573887 NA other downstream 1142450 64970291 ~ 64971167 (-)
G1575541 NA other upstream 183636 66301415 ~ 66305176 (-)
LOC110496725 LOC106589055 other upstream 685645 66802870 ~ 66810492 (-)
G1575774 NA other upstream 708803 66826582 ~ 66826877 (-)
LOC118941007 NA other upstream 752112 66857937 ~ 66870926 (-)

Expression


Co-expression Network