G1513461


Basic Information

Item Value
gene id G1513461
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 7037143 ~ 7037849 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1731803
tgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccatccctttatgtactgtttatgatggactactgGTATAGCCttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttcccgttatgtactgtttatgat
>TU1731804
tgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccatcctttatgtactgtgtatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtgtatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccctttatgtactgtttatgatggactactggtatagccttccCTTTATGTACTGTGTATGAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1731803 False 379 lncRNA 0.39 2 7037143 7037849
TU1731804 True 419 lncRNA 0.39 2 7037143 7037726

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118941079 LOC106572464 coding upstream 78339 6947312 ~ 6958804 (+)
LOC110496992 LOC106574897 coding upstream 129674 6863131 ~ 6907469 (+)
LOC110495417 LOC106575977 coding upstream 186596 6843359 ~ 6850547 (+)
LOC110495421 LOC106593174 coding upstream 199877 6815486 ~ 6837266 (+)
syap1 syap1 coding upstream 221736 6807279 ~ 6815407 (+)
LOC110500299 ace2 coding downstream 282644 7320493 ~ 7339446 (+)
LOC110496985 LOC106563837 coding downstream 344126 7381975 ~ 7406885 (+)
LOC110495413 pir coding downstream 369077 7406926 ~ 7430025 (+)
LOC110495412 vegfd coding downstream 393973 7431822 ~ 7448743 (+)
LOC110495411 LOC106574896 coding downstream 476719 7514568 ~ 7532080 (+)
G1513441 NA non-coding upstream 28594 7007310 ~ 7008549 (+)
G1513413 NA non-coding upstream 95225 6939795 ~ 6941918 (+)
G1513409 LOC106594775 non-coding upstream 109974 6926840 ~ 6927169 (+)
G1513408 NA non-coding upstream 113187 6922300 ~ 6923956 (+)
G1513407 NA non-coding upstream 116883 6920037 ~ 6920260 (+)
G1513462 NA non-coding downstream 2691 7040540 ~ 7040999 (+)
LOC110513752 LOC106575969 non-coding downstream 48052 7032578 ~ 7102239 (+)
G1513480 NA non-coding downstream 57242 7095091 ~ 7096349 (+)
G1513482 NA non-coding downstream 61371 7099220 ~ 7100313 (+)
G1513457 LOC106575808 non-coding downstream 65599 7103448 ~ 7105917 (+)
G1513452 NA other upstream 10333 7026208 ~ 7026810 (+)
LOC110516612 LOC106574917 other upstream 327095 6705632 ~ 6710286 (+)
LOC110514219 LOC106594890 other upstream 466664 6493403 ~ 6573608 (+)
LOC110496964 LOC106594657 other upstream 577574 6404433 ~ 6459931 (+)
LOC110495361 LOC106575795 other upstream 634229 6398763 ~ 6403517 (+)
G1513874 NA other downstream 388734 7426583 ~ 7426971 (+)
G1513922 NA other downstream 582447 7620296 ~ 7621941 (+)
LOC110511355 LOC106592813 other downstream 720899 7758036 ~ 7801058 (+)
G1514045 LOC106574979 other downstream 976011 8013860 ~ 8015030 (+)
G1514180 NA other downstream 1309378 8347227 ~ 8412799 (+)

Expression


Co-expression Network