G1522437 (LOC106575479)


Basic Information

Item Value
gene id G1522437
gene name LOC106575479
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 17839669 ~ 17844014 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1743076
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>TU1743077
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>TU1743079
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1743076 False 3674 TUCP 0.44 2 17839669 17844014
TU1743077 False 4250 TUCP 0.43 2 17839669 17844014
TU1743079 True 3706 TUCP 0.44 2 17839669 17844014

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110528768 LOC106591671 coding upstream 652 17831450 ~ 17839017 (+)
LOC110519433 NA coding upstream 122750 17715037 ~ 17716919 (+)
LOC118936563 LOC106591654 coding upstream 124633 17705378 ~ 17715036 (+)
LOC110527382 LOC106575451 coding upstream 198879 17638633 ~ 17640790 (+)
LOC110527377 LOC100136320 coding upstream 203085 17631679 ~ 17636584 (+)
LOC110527394 LOC106591034 coding downstream 198719 18042733 ~ 18053825 (+)
LOC110528909 LOC106595470 coding downstream 213688 18057702 ~ 18075184 (+)
LOC110495693 LOC105019803 coding downstream 232186 18076200 ~ 18093990 (+)
atr atr coding downstream 253549 18097563 ~ 18129363 (+)
LOC110495694 LOC106575448 coding downstream 287092 18129571 ~ 18136939 (+)
G1522434 NA non-coding upstream 18063 17821093 ~ 17821606 (+)
G1522433 NA non-coding upstream 19676 17819787 ~ 17819993 (+)
G1522430 NA non-coding upstream 24149 17815300 ~ 17815520 (+)
G1522428 LOC106591757 non-coding upstream 25070 17813636 ~ 17814599 (+)
G1522449 slc7a14 non-coding downstream 247 17844261 ~ 17844493 (+)
G1522450 LOC106591672 non-coding downstream 540 17844554 ~ 17845026 (+)
G1522440 NA non-coding downstream 1164 17845178 ~ 17845491 (+)
G1522441 NA non-coding downstream 1861 17845875 ~ 17846110 (+)
G1522451 NA non-coding downstream 3330 17847344 ~ 17847644 (+)
G1522415 LOC106575491 other upstream 72975 17766219 ~ 17766694 (+)
LOC110527374 LOC106592210 other upstream 212025 17623786 ~ 17631132 (+)
LOC110495674 LOC106575504 other upstream 1371246 16454118 ~ 16468453 (+)
G1520748 NA other upstream 1900851 15938230 ~ 15938818 (+)
G1520742 NA other upstream 1916770 15919157 ~ 15922899 (+)
G1522438 NA other downstream 12127 17856141 ~ 17860614 (+)
G1522684 NA other downstream 535073 18379087 ~ 18380258 (+)
LOC110495728 LOC106574584 other downstream 750320 18594324 ~ 18595682 (+)
LOC118936474 LOC106574488 other downstream 871848 18702289 ~ 18722091 (+)
LOC110495746 LOC106574508 other downstream 1115430 18959384 ~ 18978475 (+)

Expression


Co-expression Network