G1554091


Basic Information

Item Value
gene id G1554091
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 46101248 ~ 46108102 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1778112
caggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagtttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagttagggttagtgctgaaccaggatatggacatgaagttagggttaggcttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttagggctgaaccaggatgtggacatgaagctaggttaggtttgaaccagcatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaagatgtagACAttaatctagggttagggttagggctgaaccaggatatggacatgaagctagggttagtttgaaccagtatgtggacatgaagcttgggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttTGGGTTAAACCGGGacatggacatgaagctagtgatgaggttagggttaaaccgggatttggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccgggatgtggatatgaagctagggatgaggttagggttaaaccgggacgtggacatgaagctagggatgaggttagggttaaaccgggatttggacatgaagcttgtgtggaggttagggttaaaccgggatgtgaacatgaagctagggttagggtcgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgaggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagtttgaaccaggatgtggacatgacgctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagtttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagttagggttagtgctgaaccaggatatggacatgaagttagggttaggcttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttagggctgaaccaggatgtggacatgaagctaggttaggtttgaaccagcatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaagatgtagACAttaatctagggttagggttagggctgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagtttgaaccagtatgtggacatgaagcttgggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccaggatgtggacatgaagctagggttagtttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaactaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaagatgtagacatgaagctaaggttagggttagggctgaaccaggatgtagacatgaagctagggttaaggttgaaccaggatgtgaacatgaagctacggttagggttagggctgaaccagtatgtagacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggctgaatccggatgtggacataaagctagggttatattgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccgggatgtggacatgaagctaggtttagtttgaaccaggatgtgggcatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggtcatgaagctagggttagagttgaaccaggatgtggacatgaagctgggtttagtttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttagtgttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttagtttgaaccagtatgtggacatgaagcttgggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccaggatgtggacatgaagctagggttagtttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaactaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaagatgtagacatgaagctaaggttagggttagggctgaaccaggatgtagacatgaagctagggttaaggttgaaccaggatgtgaacatgaagctacggttagggttagggctgaaccagtatgtagacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggctgaatccggatgtggacataaagctagggttatattgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccgggatgtggacatgaagctaggtttagtttgaaccaggatgtgggcatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggtcatgaagctagggttagagttgaaccaggatgtggacatgaagctgggtttagtttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttagggttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttgaggttagtgttaaaccgggatgtggacatgaagctagggttagtttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaggatgtggacatgaagctagggttagggttgaaccaagatgtagacatgaagctaaggttagggttagggctgaaccaggatgtagacatgaagctagggttaaggttgaaccagg

Function

NR:

description
PREDICTED: probable ATP-dependent RNA helicase ddx42

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1778112 True 3185 TUCP 0.48 2 46101248 46108102

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110496378 LOC106588595 coding downstream 26771 46061044 ~ 46074477 (-)
LOC110496377 LOC106588592 coding downstream 44297 46039651 ~ 46056951 (-)
LOC110496375 LOC106588593 coding downstream 72450 45911856 ~ 46028798 (-)
LOC110496374 LOC106570224 coding downstream 210980 45856733 ~ 45890268 (-)
LOC110496365 LOC106588581 coding downstream 539081 45475935 ~ 45562167 (-)
LOC110496382 LOC106588622 coding upstream 469356 46577458 ~ 46640870 (-)
LOC110496383 LOC106588620 coding upstream 564412 46672514 ~ 46756077 (-)
LOC110496384 LOC106588605 coding upstream 670993 46779095 ~ 46822848 (-)
trappc9 trappc9 coding upstream 749359 46857461 ~ 47141015 (-)
LOC110496386 LOC106588618 coding upstream 1040190 47148292 ~ 47153777 (-)
G1554041 NA non-coding downstream 179494 45921443 ~ 45921754 (-)
G1554026 NA non-coding downstream 197710 45903333 ~ 45903538 (-)
G1553990 NA non-coding downstream 249508 45851427 ~ 45851740 (-)
G1553988 NA non-coding downstream 250918 45849984 ~ 45850330 (-)
G1553721 NA non-coding downstream 267297 45833711 ~ 45833951 (-)
G1554172 NA non-coding upstream 109918 46218020 ~ 46218324 (-)
G1554213 NA non-coding upstream 115830 46223932 ~ 46286906 (-)
G1554248 NA non-coding upstream 178865 46286967 ~ 46288146 (-)
G1554252 NA non-coding upstream 185284 46293386 ~ 46293594 (-)
G1554262 NA non-coding upstream 191660 46299762 ~ 46299971 (-)
G1553693 LOC106588587 other downstream 298200 45788099 ~ 45803048 (-)
G1553544 NA other downstream 433508 45667361 ~ 45667740 (-)
G1552866 LOC106588536 other downstream 1013462 45047680 ~ 45087786 (-)
G1552875 LOC106588536 other downstream 1027908 45065134 ~ 45073340 (-)
G1552768 LOC106588550 other downstream 1272440 44820763 ~ 44828808 (-)
G1555168 NA other upstream 803875 46911977 ~ 46912915 (-)
G1555543 NA other upstream 1435458 47543208 ~ 47546614 (-)
LOC110496837 LOC106588626 other upstream 1796737 47890580 ~ 47945574 (-)
LOC110496401 LOC106588640 other upstream 1874781 47982726 ~ 47986560 (-)
G1556577 NA other upstream 2248511 48356613 ~ 48356847 (-)

Expression


Co-expression Network