G1557993



Basic Information


Item Value
gene id G1557993
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 49262657 ~ 49319527 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU1782445
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>TU1782444
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>TU1782446
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>TU1782448
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>TU1782449
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>TU1782450
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Function


NR:

description
nuclear receptor subfamily 1 group D member 2-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU1782447 False 2349 lncRNA 0.42 2 49316277 49319177
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TU1782449 False 2604 lncRNA 0.42 2 49316277 49319177
TU1782450 True 2321 lncRNA 0.42 4 49316277 49319177

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110496422 LOC106588665 coding downstream 58769 49201226 ~ 49203888 (-)
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LOC110496415 LOC106588660 coding downstream 116510 49134674 ~ 49146147 (-)
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G1556577 NA other downstream 905810 48356613 ~ 48356847 (-)
LOC110496401 LOC106588640 other downstream 1279048 47982726 ~ 47986560 (-)
LOC110496837 LOC106588626 other downstream 1317083 47890580 ~ 47945574 (-)
G1555543 NA other downstream 1716086 47543208 ~ 47546614 (-)
G1555168 NA other downstream 2349742 46911977 ~ 46912915 (-)
G1558535 NA other upstream 648369 49967896 ~ 49968608 (-)
LOC110496438 LOC106588686 other upstream 1036742 50256021 ~ 50359132 (-)
G1558916 NA other upstream 1117470 50436997 ~ 50437459 (-)
G1559205 NA other upstream 1303564 50623091 ~ 50623983 (-)

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