G1565122 (LOC106613431)


Basic Information

Item Value
gene id G1565122
gene name LOC106613431
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 56481468 ~ 56488289 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1790620
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttcagcatgCTTTTCATAACAGTGTATTTAAATGTTTATATGTGTGTTTTGTGCAGTATGAATAATACAGTGTTATTGGACATCTTTACATCTCATtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgcgtatgtgtgttactgtgactgtgtgttactgtgactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttcctgtgactgtgtgttactgtgactgtgactctgtgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtatgtgtgttagtatgaccgtgtgtatgtgtgttactatgtctgtgtgtgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgttactgtgactgtgtgttactttgactgtgtgtgttagtatgactgtgtgtgtgttactgtgactgtgaGTATCTGTGTacatgtgactgtgtgtgtgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtgtgttactgtgactgtgtgttactgtgactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtaactgtgagtgtgtttgttactgtgaatgtgtgtgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttagtatGACGTtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtaactgtgtgtgtgtgtgttactgtgactgtgtgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttagtatGACGGtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtgtgtgttactgtaactgtgtttgtgttacagtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtgtgtgtgtgttactgtaactgtgtgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttactgtgactgtgtgtgtgcgtgtgtgttactgtaactgtgtttgtgttactgtgactgtgtgtatgtgtgttagtttgactgtgtgtgtgtatgggtgtgtgttagtttgactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgcttgtgtgactgtgtgtatgtgtgttagtgtgaatgtgtgtatgtgtgcttgtgtgactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaaaactgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgttagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgaatgtgtgtgtgttagtaagaccgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtatgtatgtgtgtgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgcatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtctgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaaggctgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtacgtgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgctagtaagattgtgtgtatgcgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgcatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgttagtaagactgcgtgtatttgtgtgttaataagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgcgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtttgtgtgttagtatgactgtgtgtgtgtgtgtgtgttagtaagactgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtctgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttaataagactgtttgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatttgtgtgttaataagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgcgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtttgtgtgttagtaagactgtgtgtgtgtgtgtgtgttagtaagactgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtctgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtaagattgtgtttatgtgtgtgtgttagtatgactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgttaataagactgtttgtatgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgcgtgtgtgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtttgtgttagtaagattgtgtgtatgtgtgtgtgttagtaagactgtgtgtatgtgtgtgtgtgttagtatgactgtatataaactcagcaaaaaaataaacgtccctttttcgggaccctttctttcaaagataattcataaaaataacttcacagatcttcattgtaaagggtttaaacactgtttcccatgcttgttcaatgaaccataaacaattaatgaacatacacctgtggaacggtcgctaagacactaacagcttgcagacggtaggcaattaaggtcacagttatgaaaacttaggacactaaagaggcctttcaacAGACTCAGAAAAACACCAAAAAAAAGATGCCCACTGTCCCtgttcatctgcgtgaacgtgccttaggcatgctgcaaggaggcatgaggactgcatatgtggccagggcaacaaattgcaatgtctgtactttgagatgcctaagacagtcctacagggagacaggacggacagctgatcgtcctcgcagtggcagtccatgtgtaacaacacctgcacaggatcggtacattggaacatcacacctgcggaactGGTACAGGATGGcgacaacaactgcccgagttacaccaggaatgcacactccctccatcagtgctcagactgtccgcaataggctgagagaggctggactgagggcttgtaggcctgctgtaaggcaggttctcaccagacatcaccggcaacaacgtcacctatgggcacaaacccatcgtcgctggaccagacaggactggcaaaaagtgctcttcactgacgagtcacggttttgtctcaccaggggtgatggtcggattcacatttattgtcgaaggaatgagcgttaaaccgaggcctgtactctggagtgggatagatttggaggtggagggtctgtcatggtctggagaggtgtgtcacagcatcatcggactgagcttgctgtcattgcaggcaatctcaacgctgtgcgttacagggaagacatcctcctccctcatgtggtacccttcctgcaggctcatcctgacatgaccctccagcatgacaatgccaccaaccatactgctcattctgtgtgtgatttcctgcaaggcaggaatgtcagtgttctgccatggccagcgaagagcctggatcttaat

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1790620 True 5208 TUCP 0.42 3 56481468 56488289

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118941190 LOC106588825 coding downstream 1627624 54842434 ~ 54853844 (-)
LOC110496552 gmnn coding downstream 1641546 54827717 ~ 54839922 (-)
LOC110496860 LOC106588819 coding downstream 1828536 54636849 ~ 54652932 (-)
tpd52 tpd52 coding downstream 1929151 54525693 ~ 54552317 (-)
LOC118941189 mrpl53 coding downstream 2163844 54316124 ~ 54317624 (-)
LOC110496559 LOC106570512 coding upstream 216563 56704852 ~ 56726308 (-)
LOC110496560 LOC106588840 coding upstream 240052 56728341 ~ 56737381 (-)
LOC110496863 NA coding upstream 570248 57058537 ~ 57061029 (-)
LOC110496566 hoxa2ab coding upstream 579551 57067840 ~ 57070602 (-)
LOC110496565 hoxa3ab coding upstream 585173 57073462 ~ 57109628 (-)
G1565163 NA non-coding downstream 16306 56464851 ~ 56465162 (-)
G1565148 NA non-coding downstream 17893 56462935 ~ 56463575 (-)
G1565125 NA non-coding downstream 72804 56406486 ~ 56408664 (-)
G1565097 NA non-coding downstream 117657 56363502 ~ 56363811 (-)
G1565070 NA non-coding downstream 151585 56329616 ~ 56329883 (-)
G1565171 NA non-coding upstream 4368 56492657 ~ 56496239 (-)
G1565146 NA non-coding upstream 14007 56502296 ~ 56504360 (-)
G1565178 NA non-coding upstream 21937 56510226 ~ 56510436 (-)
G1565322 NA non-coding upstream 74926 56563215 ~ 56563496 (-)
G1565323 NA non-coding upstream 78807 56567096 ~ 56567331 (-)
G1563253 NA other downstream 1815825 54660626 ~ 54665643 (-)
mrpl3 mrpl3 other downstream 2586519 53887137 ~ 53895002 (-)
G1562828 NA other downstream 2605876 53874410 ~ 53875592 (-)
G1562816 LOC100136012 other downstream 2728785 53752406 ~ 53752683 (-)
G1566899 NA other upstream 1539222 58027511 ~ 58027790 (-)
G1566923 NA other upstream 1587334 58074209 ~ 58078146 (-)
G1566972 NA other upstream 1679095 58167384 ~ 58167697 (-)
G1567080 NA other upstream 1922210 58410499 ~ 58411129 (-)

Expression


Co-expression Network