G1567880


Basic Information

Item Value
gene id G1567880
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 58885908 ~ 58892166 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1793878
gtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatttaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaatgtagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtccaatacaacatcatcatgtaacatagtgaaaGTCCTATACAACAttatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtccaatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatgcaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacaacatataacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatataacatagtgagagtcctatacaacatcatataacatagtgagagtcctatacaacataatgtaacatagtgagagtcctatacaacataatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatataacacagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcatatacaacatcatgtaacatagtgagagtccaatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacgacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgatGTAACATGGTGAGAGTCCTATActacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcataTAACATATcaagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctattcaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatcgTGAGAGTCCTATActacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatttaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacacagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatattgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatataacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgtgagtcctatacaacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgcaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatataacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcaccatgtaacatagtgagagtcctatacaacatcatcatataacatagtgagagtcctatacaacatcat

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1793878 True 2367 lncRNA 0.35 2 58885908 58892166

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110496616 lrrc14b coding downstream 9017 58873695 ~ 58876891 (-)
ptdss1b LOC106588913 coding downstream 22166 58854281 ~ 58863742 (-)
LOC110496613 LOC106588909 coding downstream 33367 58824211 ~ 58852541 (-)
rbm24a LOC106588906 coding downstream 77336 58793299 ~ 58808572 (-)
LOC110496609 cap2 coding downstream 96894 58739765 ~ 58789014 (-)
LOC110496620 LOC106588918 coding upstream 22995 58915161 ~ 58918050 (-)
si:ch211-57n23.1 LOC106588919 coding upstream 29862 58922028 ~ 58926488 (-)
ago2 LOC106570475 coding upstream 42102 58934268 ~ 58952492 (-)
dlx6a dlx6 coding upstream 70778 58962944 ~ 58966131 (-)
LOC110496627 LOC106588646 coding upstream 168177 59060343 ~ 59060911 (-)
G1567871 LOC106588914 non-coding downstream 13553 58870937 ~ 58873691 (-)
G1567865 NA non-coding downstream 63403 58822179 ~ 58822505 (-)
G1567380 NA non-coding downstream 191086 58693972 ~ 58694822 (-)
G1567368 NA non-coding downstream 223021 58662613 ~ 58662887 (-)
G1567886 NA non-coding upstream 19323 58911489 ~ 58911850 (-)
G1567889 NA non-coding upstream 35698 58927864 ~ 58932641 (-)
G1567913 NA non-coding upstream 86094 58978260 ~ 58978474 (-)
G1567944 shfm1 non-coding upstream 132856 59025022 ~ 59035338 (-)
G1567979 NA non-coding upstream 197843 59090009 ~ 59090699 (-)
G1567875 NA other downstream 15901 58869363 ~ 58870007 (-)
G1567080 NA other downstream 474779 58410499 ~ 58411129 (-)
G1566972 NA other downstream 718211 58167384 ~ 58167697 (-)
G1566923 NA other downstream 807762 58074209 ~ 58078146 (-)
G1567931 NA other upstream 112679 59004845 ~ 59074648 (-)
G1568017 NA other upstream 262862 59155028 ~ 59157044 (-)
LOC110496637 gng11 other upstream 837013 59712624 ~ 59738593 (-)
G1569198 NA other upstream 1349765 60241931 ~ 60251369 (-)
G1569258 NA other upstream 1456610 60348776 ~ 60350759 (-)

Expression


Co-expression Network