G1567522


Basic Information

Item Value
gene id G1567522
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 58890403 ~ 58902491 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1793406
ctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactacgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactacattacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttaaatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgtagTATAGGACTCTCACCATGTTACatcatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgtcgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtattggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgataaTGTTGTATAGGACtttcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactacattacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttaaatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactgtgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttatatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactcactatgttacatgatgatgttgcataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactttcactatgttacatgatgatgttgtattggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactacattacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttatatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtataggactctcactatgttatatgttgttgtataggactctcactatgtttcatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgcataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgttgtataggactctcactatgttacatgatgatgttgtatagga

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1793406 True 2318 lncRNA 0.35 2 58890403 58902491

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110496618 LOC106588914 coding upstream 16711 58864013 ~ 58873692 (+)
nanos2 LOC106588910 coding upstream 66474 58823202 ~ 58823929 (+)
LOC110496610 aunip coding upstream 150836 58737349 ~ 58739567 (+)
LOC118941194 NA coding upstream 504439 58379624 ~ 58386065 (+)
LOC118941196 NA coding upstream 505752 58384103 ~ 58384651 (+)
LOC110496619 catsper4 coding downstream 4014 58906505 ~ 58915399 (+)
chrc1 chrc1 coding downstream 15828 58918319 ~ 58922019 (+)
trnaa-ugc-140 NA coding downstream 42770 58945261 ~ 58945334 (+)
dlx5a dlx5 coding downstream 54646 58957121 ~ 58959671 (+)
sem1 shfm1 coding downstream 122428 59024919 ~ 59035388 (+)
G1567516 NA non-coding upstream 12943 58877027 ~ 58877460 (+)
G1567515 NA non-coding upstream 20393 58869481 ~ 58870010 (+)
G1567475 NA non-coding upstream 68847 58821236 ~ 58821556 (+)
G1567397 NA non-coding upstream 148558 58739746 ~ 58741845 (+)
G1567394 NA non-coding upstream 158080 58731680 ~ 58732323 (+)
G1567505 LOC106588919 non-coding downstream 21810 58924301 ~ 58925552 (+)
G1567503 NA non-coding downstream 27082 58929573 ~ 58930215 (+)
G1567543 NA non-coding downstream 58751 58961242 ~ 58976415 (+)
G1567555 NA non-coding downstream 85557 58988048 ~ 58988650 (+)
G1567653 NA non-coding downstream 286962 59189453 ~ 59189762 (+)
G1566445 LOC106588893 other upstream 513397 58364256 ~ 58377006 (+)
G1566224 tbc1d5 other upstream 943640 57941097 ~ 57946763 (+)
LOC110496592 LOC106588883 other upstream 969757 57893854 ~ 57935297 (+)
LOC110496591 LOC106588881 other upstream 1027357 57851179 ~ 57870361 (+)
G1567716 asb4 other downstream 407493 59309984 ~ 59312723 (+)
G1567804 col1a2 other downstream 598682 59501173 ~ 59585317 (+)
LOC110496636 bet1 other downstream 742222 59644659 ~ 59647881 (+)

Expression


Co-expression Network