G1567889


Basic Information

Item Value
gene id G1567889
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 58927864 ~ 58932641 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1793891
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>TU1793892
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>TU1793893
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Function

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1793891 False 4778 lncRNA 0.37 1 58927864 58932641
TU1793892 False 4719 lncRNA 0.37 1 58927864 58932582
TU1793893 True 3386 lncRNA 0.37 1 58929197 58932582

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-57n23.1 LOC106588919 coding downstream 1376 58922028 ~ 58926488 (-)
LOC110496620 LOC106588918 coding downstream 9814 58915161 ~ 58918050 (-)
LOC110496617 LOC106588916 coding downstream 21693 58877846 ~ 58906171 (-)
LOC110496616 lrrc14b coding downstream 50973 58873695 ~ 58876891 (-)
ptdss1b LOC106588913 coding downstream 64122 58854281 ~ 58863742 (-)
ago2 LOC106570475 coding upstream 1627 58934268 ~ 58952492 (-)
dlx6a dlx6 coding upstream 30303 58962944 ~ 58966131 (-)
LOC110496627 LOC106588646 coding upstream 127702 59060343 ~ 59060911 (-)
LOC118940999 NA coding upstream 230933 59163574 ~ 59281264 (-)
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G1567886 NA non-coding downstream 16014 58911489 ~ 58911850 (-)
G1567880 NA non-coding downstream 35698 58885908 ~ 58892166 (-)
G1567871 LOC106588914 non-coding downstream 55509 58870937 ~ 58873691 (-)
G1567865 NA non-coding downstream 105359 58822179 ~ 58822505 (-)
LOC110496609 cap2 non-coding downstream 185022 58739765 ~ 58789014 (-)
G1567913 NA non-coding upstream 45619 58978260 ~ 58978474 (-)
G1567944 shfm1 non-coding upstream 92381 59025022 ~ 59035338 (-)
G1567979 NA non-coding upstream 157368 59090009 ~ 59090699 (-)
G1568021 NA non-coding upstream 235306 59167947 ~ 59168189 (-)
G1568027 NA non-coding upstream 247457 59180098 ~ 59180748 (-)
G1567875 NA other downstream 57857 58869363 ~ 58870007 (-)
G1567080 NA other downstream 516735 58410499 ~ 58411129 (-)
G1566972 NA other downstream 760167 58167384 ~ 58167697 (-)
G1566923 NA other downstream 849718 58074209 ~ 58078146 (-)
G1567931 NA other upstream 72204 59004845 ~ 59074648 (-)
G1568017 NA other upstream 222387 59155028 ~ 59157044 (-)
LOC110496637 gng11 other upstream 796538 59712624 ~ 59738593 (-)
G1569198 NA other upstream 1309290 60241931 ~ 60251369 (-)
G1569258 NA other upstream 1416135 60348776 ~ 60350759 (-)

Expression


Co-expression Network