G1575169


Basic Information

Item Value
gene id G1575169
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 65713768 ~ 65716640 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1802221
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>TU1802222
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>TU1802223
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>TU1802225
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Function

NR:

description
serine/threonine-protein kinase Sgk1-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1802221 False 2625 lncRNA 0.40 3 65713768 65716640
TU1802222 False 2562 lncRNA 0.40 3 65713768 65716640
TU1802223 False 2472 lncRNA 0.40 4 65713768 65716640
TU1802225 True 2812 lncRNA 0.40 3 65713768 65716640

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110496703 NA coding downstream 93568 65610940 ~ 65620200 (-)
LOC110496890 LOC106570358 coding downstream 111867 65514942 ~ 65601901 (-)
LOC110496698 LOC106570363 coding downstream 592712 65056656 ~ 65121056 (-)
LOC110496694 LOC106589019 coding downstream 725772 64973831 ~ 64987996 (-)
LOC110496691 LOC106589015 coding downstream 880445 64828329 ~ 64833323 (-)
LOC110496706 LOC106589031 coding upstream 38481 65755121 ~ 65767988 (-)
xkr8.3 xkr8 coding upstream 54275 65770915 ~ 65781022 (-)
epb41a LOC106589039 coding upstream 178344 65894984 ~ 66039471 (-)
LOC110496714 LOC106589042 coding upstream 334995 66051635 ~ 66068096 (-)
LOC118941206 NA coding upstream 363814 66080454 ~ 66094549 (-)
G1575289 LOC106589037 non-coding downstream 4173 65703376 ~ 65709595 (-)
G1575278 NA non-coding downstream 23917 65680748 ~ 65689851 (-)
G1575232 NA non-coding downstream 110682 65602841 ~ 65603086 (-)
G1575168 NA non-coding downstream 209075 65461921 ~ 65504693 (-)
G1575188 NA non-coding downstream 221766 65490907 ~ 65492002 (-)
G1575314 NA non-coding upstream 17051 65733691 ~ 65763466 (-)
G1575318 NA non-coding upstream 24053 65740693 ~ 65742149 (-)
G1575320 NA non-coding upstream 27394 65744034 ~ 65744396 (-)
G1575332 NA non-coding upstream 51718 65768358 ~ 65768692 (-)
G1575333 NA non-coding upstream 52411 65769051 ~ 65769287 (-)
G1575088 NA other downstream 402717 65310043 ~ 65311051 (-)
G1573887 NA other downstream 742601 64970291 ~ 64971167 (-)
LOC110496680 LOC106589004 other downstream 1468954 64017203 ~ 64244837 (-)
G1573054 NA other downstream 1698803 64013779 ~ 64014965 (-)
G1572487 NA other downstream 2222599 63435798 ~ 63491169 (-)
G1575282 NA other upstream 80990 65797630 ~ 65798675 (-)
G1575457 NA other upstream 297829 66014469 ~ 66053735 (-)
G1575475 NA other upstream 339042 66055682 ~ 66056239 (-)
ppp1r11 ppp1r11 other upstream 521458 66238098 ~ 66242725 (-)
G1575541 NA other upstream 584775 66301415 ~ 66305176 (-)

Expression


Co-expression Network