LOC110498562


Basic Information

Item Value
gene id LOC110498562
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 19525106 ~ 19535210 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036955485.1
GCCATCTTCCCAGAAGTTGTTCATCTTCAGTTCACAGAAAGCGAGGAGGATACGTTCTTTGTACATCATTTCTCATTTCATTAAGCTACAATCTGCAGGTCCTAGCTGACAACGTCTCGGATATAGGACGATTTATTCTCAGGGACGTGACGGATATGGAACCTCTGACGATTCTCCTTCTGCTAGCAGGACTAGTAGGGAAGACATCAGCAACGACCACAAGTGTTTGGGACAAAACAACAATtgCTGTTTCTACATCAACCTCAGATGCGGCTAAAACAACTACAGCCGTCTCCACAGCTCCCACAACAGCCCCAGCTACTTCCAAAACAACCACATCAGCTCTCACAACGACCATAACTGTTGCTCCATCTATAACAGATGCGACAAAATCAACTACAGACAtcctcacaacaaccacagatgctCTTACAACAACTACAGCCATCCCCACAACAACCATagcagctcccacaacaaccacagcagctcTCACAACAACCACGGCTGCTGCAACATCAACAACCAGCCCCACAACATCCACGGCTGTTGCAACATCAACAACCatccccacaacaaccacagatgctCTTACAACAACGACAGCCATCCCCACAACAACcccagcttctcccacaacaacacCAGCAGCTCCcataacaaccacagcttcttCCCCAACatccacagctgctcccacaacaaccacaactgcttCCACAACGACCAGAGCTGATTCCATAACAACCACAGCATCACCAATGACAACTACAGCTGCAGGTACAACAACTACAGCTGCACCCACAACAACCACTGTAGctcacacaacaaccacagctgcagtTACCACAACCTCAGCTGCTACGACAACAATAGCagatcccacaacaaccacatctgctcccacaacaaccccagctgctcccacaacaacagcagcaccAACGTCAACTACAGCTGAatctacaacaacaacagctgcacccacaacaaccactgcagctcacacaacaaccacaactgctcccacaacaactacagctgcacccacaacaacagcagcaccAACGTCAACTACAGCTGGatctacaacaacaacagctgcacccacaacaaccactgcagctcacACAACAACCCCAGCTGTTCCCACAACAACAATAGCAGATCCCACAACAACCAtaactgctcccacaacaaccataaCTGCTCCGACAACAAccccagctgctcccacaacaacagcagcaccAACGACAACTACAGCTGCggctacaacaacaacagctgcacccacaacaaccactgcagctcacacaacaaccacagctgaagTTATCACAaacacagctgctgctacgaCAACAATAGCAGATCCCACAACAACCATAGCTTCTTCCCCAACAACCGTAGCTGCTCCCACATCAACTACAGCTGCACACACAACAACCACTGTAGCTCACACAACATCCACAGCTGCAGTtaccacaaccacagctgctacGACAACAATAGCAGATCCCACAACAATCAcaactgctcccacaacaacagcagcaccAACGACAACTACAGATGTggctacaacaactacagctgcacccacaacaaccactgtagctcacacaacaaccacagctgcagctACGTCAACAATAGCagatcccacaacaaccacaactgctcccacaacaaccccagctgctcccacaacaacagcagcaccAACGTCAACTACAGCTGAatctacaacaacaacagctgcacccacaacaaccactgcagctcacacaacaaccacaactgctcccacaacaaccccaGCTGTTCCCACAACAACAATAGCagatcccacaacaaccacaactgctcccacaacaaccccagctgctcccacaacaacagcagcaccAATGTCAACTACAGCTGAatctacaacaacaacagctgcacccacaacaaccactgcagctcacacaacaaccacagctgcagttctcacaaccacagctgctgctacGTCAACAATAGCAGATCCCACAAAAACCAcaactgctcccacaacaaccccaGCTGCACCCACAACAACAATAGCagatcccacaacaaccacaactgctcccacaacaaccccagctgctcccacaacaacagcagcaccAACGTCAACTACAGCTGAatctacaacaacaacagctgcacccacaacaaccactgcagctcacacaacaaccacaactgctcccacaacaaccccaGCTGTTCCCACAACAACAATAGCagatcccacaacaaccacaactgctcccacaacaaccccagctgctcccacaacaacagcagcaccAACGTCAACTATAGCTGAatctacaacaacaacagctctgctcccacaacaacagcagcaccAACGACAACTACAGCTGCGGCTACAACAGCAACAGCTGCACCCACAACAACCACTGCTGCAgtctcacaacaaccacagccatCCCCACAACAACCACGGCTGCTGCAACATCAACAACCATCGCCACAACATCCACGACTGCTGCAACATCAAAAATCATCCCCATAACAACCACAGATTCTCTTACAACAACCACAGCCATCCTCACAACAGCTACAGCCATCCCCACAACAACCCAAGCAACTCCCACAACAACCAGAGCagctctcacaacaaccacagcatctCTCACAACATCCACGGCTGCTGCAACATCAACAACCgtccccacaacaaccacagatgcagctctcacaacaaccacagccatCCCCACAACAACCACGGCTGCTGCAACATCAACAACCATCCCCACAACATCCACGGCTGCTGCAACATCAACAACCATCCCCACAACAACCCCatcttctcccacaacaaccacagcagctcccataacaaccacagcttcttCCCCAACatccacagctgctcccacaacaaccacaactgcttCCACAACGACCAGAGCTGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036955485.1 True 2984 mRNA 0.51 7 19525106 19535210

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110497535 LOC106602669 coding downstream 836 19517262 ~ 19524270 (-)
LOC118941546 NA coding downstream 104639 19397768 ~ 19420467 (-)
LOC118941463 NA coding downstream 147950 19374805 ~ 19377156 (-)
LOC110497474 NA coding downstream 156459 19364691 ~ 19368647 (-)
LOC110497471 LOC106609951 coding downstream 214371 19303531 ~ 19310735 (-)
LOC110497533 LOC106609955 coding upstream 59143 19594353 ~ 19598996 (-)
LOC118941464 NA coding upstream 59143 19594353 ~ 19609921 (-)
LOC110498685 LOC106602680 coding upstream 133049 19668259 ~ 19669604 (-)
LOC110497529 LOC100136072 coding upstream 196238 19666386 ~ 19751340 (-)
LOC110497528 LOC106609961 coding upstream 202697 19737907 ~ 19741020 (-)
G1599220 NA non-coding downstream 83430 19441471 ~ 19441676 (-)
G1599216 NA non-coding downstream 84022 19435735 ~ 19441084 (-)
G1599206 NA non-coding downstream 132520 19391951 ~ 19392586 (-)
G1599172 NA non-coding downstream 166677 19355580 ~ 19358429 (-)
G1599167 NA non-coding downstream 176483 19348150 ~ 19348623 (-)
G1599703 NA non-coding upstream 2913 19538123 ~ 19538351 (-)
G1599705 NA non-coding upstream 3826 19539036 ~ 19539283 (-)
G1599735 NA non-coding upstream 48702 19583912 ~ 19584259 (-)
G1599749 NA non-coding upstream 81008 19616218 ~ 19616426 (-)
G1599750 NA non-coding upstream 84181 19619391 ~ 19622039 (-)
G1599197 NA other downstream 143355 19372309 ~ 19381751 (-)
G1599097 LOC106609944 other downstream 315142 19209292 ~ 19209964 (-)
G1598418 NA other downstream 760684 18763715 ~ 18764422 (-)
LOC110497446 NA other downstream 1901630 17615897 ~ 17623476 (-)
G1596970 LOC106609899 other downstream 2025663 17494669 ~ 17530745 (-)
G1599717 NA other upstream 20387 19555597 ~ 19557357 (-)
G1599760 LOC106609957 other upstream 100808 19636018 ~ 19637027 (-)
G1599758 LOC106609957 other upstream 103550 19638760 ~ 19642003 (-)
G1600014 LOC106609977 other upstream 572705 20107915 ~ 20108791 (-)
G1600030 NA other upstream 592001 20127211 ~ 20136561 (-)

Expression


Co-expression Network