zgc:193593


Basic Information

Item Value
gene id zgc:193593
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 49160705 ~ 49178402 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036953827.1
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>TU1868272
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TTGACAACAGCAGGTCCCCACATCCAGGTCCTCTGACGAGCCCTCTTACAGTTGGGTTCTcactggagagaaagagagtctaGGAAGACTGCGAGGAAACAGTTGGAGAGGAACTGACCAGTAGAGCTGTATTTTCACTATCAGTCTCTAAGAGTTTGAAACCCTGGAGACCCGCAGCAAGATGTTTTTCAGACTCCCAAGACTAACTCCTGGATACCTACGGTATCTACAGACCCAGGCTATGGCGAGTGAGACCCAGAGAGCTGGGGACCTGCCCCGTCTGGCCATGCTCCTGGGGGCCTTGGGGATCGGGGTGTGTGGCTACAGCTCCAGGCAGCTGGCACTGCACCACCGGCCCTCTGCCCGCGTGCTGACCTGGATGGACGTTGGGAGCACCCCGGTGAAGGGGAGAGCCCCTTCCTTCATGGACCTGTCTCAAAGCCACAGCATCTGTCAGGACATCCCACCTCCAGCATTCGCTGGGCAGAGAGTGCCTTAAAACAACCACCAGATCTAGAGTGCATGTTTGAATCCCTCAGTATGCAGTACCTAGCCAGGTATGGTGGAGCTTTACTCCACTGTGCTAGCACTTCAGTGTTAACATATGTTGAACCCTAACCCAGAGATCCATAATCTGATAATCAATAATTACTAGCCTCACCTGTGTGAGATTCTGCATTGACATGCAGTATATTTAAAATTGCTGATTGGATGAGTAATTCAACTTGTTGCCACAGTGGGTAGGAAGGTTTAGCTATGGAAGTCTGATTTAGCTTCATCCTGTGTGTCTTTTGTGAAGTCACGTGTTTGGCTCGGCCCCCTGGTACACAGATGGTTGGCAACCCCTCGGGCTGGTTGCCATCCATAAGTGTTGGCAGCTCATCCACAGCCAACAACTTCCATTGATTTCAACTGATAAGAACTAGGCGGACCTATCCATCACTAGAGCTTGACATCCACTGTCAGGTCCAGTCTGGACTGGAGTGAAAGACACAGGTTTTATTTCACAGTGTCTTCAAACGATAGTGCTACAGTAGTCGTCTTCTCTGAAGGTGTCAATTCTCTTACATATTGATATTGTAATGAGGTACATTGCAAGGAAAGGCTGGACGATTGTTCAGCTACAGTTACTGAAGCATGCTAGTGATGACTCTGGTTGTATAGAATGATCCAGACTCTCTTTATGATGTCTCACTGCCATGTGAATAATGTAACTGTATCTATACTGCTCCTTAGATTATAGCTCTTATTTGAACCACGGTTAAAATgatgagggagagcgagagagaacaaaGCTCCTCATCACTAAACCAATTTCCTCCTGTGGGATTAAACCAGGTGGAACATCTGTGAGCTGGCATACAGTACATCGCCCCAATCTGGTATTAGGGGTGAAGACAGGAGACTGGTTCCTGCAGTGCCATGAGCAAAGGCTGTGTTCCAAAGAGTTCATATGATATCGGGTATCTTTAACTAGATTGGGAAATGTGCACAGCATCTTTCAGAATGATAATTTTTCTGTTACTGCTACCAAAGGCCATTATGAATTTCTCAGAGCTAGTGTGAATCACACCTATATTTTCCCCCCAAAGAAGATAGTGAGACTCAAAATCAAACATCCATTGTACAACCACTGGAACCACAGGTACAGTAGAGGTCTGCAAAAGCTGATCCCATAATCCTTTTCCACAGCAGCTGAGCCAGTTTCCTGTGTCTGACAAAATATAAATTTTTAGCAGGACCAGATTAGCTGTGCTAGCCCTGCCACTGCATTTTAGGTCGCTACAAATGGCCCTAATCCACTCAGCAGATGTGCTAATTGGCTGAGCTGGCACCAAAGAGCTACCGGGGCAGTTCCCTCAACTCGTGACAGAGACTGACACTCAAACACTTGTTAATGGACTACCTAATGGTTTTACGCAGAAACATGACATGGTGTTTTTCCCGTTGAGCTCAATTTGGAAACCACTTTTTCAGGAACAGAAAACGAATGCATCCTGTTAGGTCAACACCTATTTCCTTCAAACTATAATATTATGTTGTCTGTACCTACTGCATACATGTATGAAATTTGTAAGGGATTTCTGGGACAAATAAATTTGTTCAACTtttaaaaaaaaaaaaaaaa

Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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si:ch211-195o20.7 LOC106574021 coding downstream 3904 49171450 ~ 49192439 (+)
LOC110498056 LOC106573945 coding downstream 32547 49200093 ~ 49218555 (+)
LOC110498063 LOC106573328 coding downstream 398310 49565856 ~ 49611711 (+)
LOC110498066 LOC106573019 coding downstream 587422 49754968 ~ 49926745 (+)
LOC110498067 LOC106572928 coding downstream 760158 49927704 ~ 50024509 (+)
G1632870 NA non-coding upstream 48067 49111942 ~ 49112638 (+)
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G1633019 NA non-coding downstream 159117 49326663 ~ 49370871 (+)
G1633072 NA non-coding downstream 237933 49405479 ~ 49407939 (+)
G1633087 LOC106573748 non-coding downstream 258765 49426311 ~ 49453984 (+)
G1633107 NA non-coding downstream 289536 49457082 ~ 49458853 (+)
G1632650 arhgef10 other upstream 460137 48699057 ~ 48700568 (+)
LOC110498044 LOC106575475 other upstream 1031325 48122225 ~ 48129380 (+)
G1631844 NA other upstream 1411623 47747697 ~ 47749082 (+)
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zgc:193593 NA other downstream 554 49160705 ~ 49178402 (+)
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Expression


Co-expression Network