LOC110498109 (1433b)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110498109
gene name 1433b
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 53046245 ~ 53061764 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021574699.2
GAAAAGTATATTTGTGATTGGAGAATCATTCTCACATAGAGCTGCTCCATCTAGCATGTCTGGTTGAATTTCAAGGCTGCTGTTTTTTGCTCTGCTTCATACCAATCTCACAGCGGATCAATTCGGAGGAACAAATCGGGACCTTAGAAGGTTTTTGGTGGAATACTGCGCAGCATCCGCTACTCTCTATCGTTTAGCGCCATCTTCAAGTCCCTCTTGCATTCCTGGACTCCTATTGTTTTTAACCCGTCCGTGACGAATCAAGCTAAGGTTACACACTAAAGAATAAACAATGGATAAAGCGGAGCTTATTCAGAAGGCCAAGTTGGCGGAGCAAGCCGAGCGCTACGATGACATGGCCGCCTCGATGAAGGAGGTAACGGAACAGGGGGGCGAGCTGTCAAACGAGGAGAGGAACCTGCTATCTGTCGCATACAAGAACGTGGTCGGAGCACGGCGGTCGGCATGGAGGGTCATCTCCAGCATCGGACAGAAGACGGAGGGAAGCGACAAGAAGCTCGCAATGGTCAACGAATACCGGGAGAAGGTGGAGGGCGAGCTGAGAGATATCTGCAACGATGTACTGGAACTGCTGAATAAATATTTAATTGAGAACTCCACAAATGCTGAAAGCAAAGTCTTCTATCTTAAGATGAAGGGCGACTACTATAGATACCTTGCCGAAGTCGCCTCTGGGGATGACAAAACAGCTACCATAGAACACTCTCAGGAGGCGTACCAGCAGGCATTTGACATCAGCAAGAAGGAGATGGACCCCACACATCCCATCCGCCTGGGCCTGGCCCTAAACTTCTCAGTCTTCTTCTACGAGATCCTCAACTCTCCAGAGAAAGCCTGCTCACTGGCCAAACAGGCATTTGATGATGCCATTGCAGAGCTGGACAAACTGAACGAGGAGTCCTACAAAGACAGCACTCTCATCATGCAGCTGCTCAGAGACAACCTGACATTATGGACATCCGACAACGCGCCTGAGGAAGGCGAGGCTGGAGAAGCCGGCGAAGCCGGAGAGAACGAGAACTgaaactcatctctctctcaaaaaaaaacCTTTTTACACATCTCCATTCCTGTATTGCTCCACTTAAAGTCTTTTAGCAATGAAACCCATTACTGAACAAAAGCTGCATGTGGAAATTCCAAAATAATTTGACTTTTCACGCTGCAGCTTTTGTGCaaataaaagaaagaaaaatattGATTGAGGGGGGGGTGAAACCTCCATTCCATGGTTTGTTTGTCCTGACCTTCCATACGTGCAGTTTCTCCTGTTAGAAAAGTATTAATAGCTTCTTTTTATCAATGTTTTAGTCCAAATTAGAGGAAGAAATAAGACATTCTAGGGCTTTTTGCTGAGCTACTGAATCTTAGTCCCATCAAAACACAAGGGGAGTTCAGATGTTAGAACAGGGGTGTTTGTTAAGCAAATTCAATGAATTGTTCCCTCACCCTCCATAGGCTTGTTCTCTATTTCTCCACATGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACATCCTCCACACGGTTATCTTGTATGGTTACCGCTGCCGACATCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCTTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACATCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTCATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACTGCTGCTGACGTCCTCCACACGGTTATCTTGTATGGTTACTGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTCATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGGTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTAGCTTATATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTAACTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGCGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGCGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCCACGCGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGCGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACATCCAATGTGAACAAGTGTAATTGTTCCTTGTTGCAGCGAGGGCCAGTCAATGAGCTGGCACCAAGTATCACAGCCAGGTGATTTCCATTGGTTCTGAAAATGTTTTTCCTCGCTCCCCCCTGGTTACAACATTCAcaataaagcatgtctggttgaaGAGAAGTGGGGGGCTTTCTGAAgaccaaaacaaaaataaatactcCTACATGCATGTAATTGAATAGTACACTGGAATGGGAACCAATGCGCTATACACACCATGTCCAAATGTCCAATTTAGTACTTTTCAATGCAGGTTTGTGCACGTGTTAATTAACAAGGGTGTTTGGTTAGTCCAGTGATTTGTCATTAGAGATTTGGACCACTATGTTTTTGCTAATCATCGATTGTAGTTCCCAAAAGCCTCGTGGAAATGTTAATGCCCTATGTTTCAGCTATGTAACATGAATAAAAATGAAATTTTATAAACCCA
>XM_021574700.2
ATTGGAGAATCATTCTCACATAGAGCTGCTCCATCTAGCATGTCTGGTTGAATTTCAAGGCTGCTGTTTTTTGCTCTGCTTCATACCAATCTCACAGCGGATCAATTCGGAGGAACAAATCGGGACCTTAGAAGGTTAGAATATTCAGAAGTTTTTGGTGGAATACTGCGCAGCATCCGCTACTCTCTATCGTTTAGCGCCATCTTCAAGTCCCTCTTGCATTCCTGGACTCCTATTGTTTTTAACCCGTCCGTGACGAATCAAGCTAAGGTTACACACTAAAGAATAAACAATGGATAAAGCGGAGCTTATTCAGAAGGCCAAGTTGGCGGAGCAAGCCGAGCGCTACGATGACATGGCCGCCTCGATGAAGGAGGTAACGGAACAGGGGGGCGAGCTGTCAAACGAGGAGAGGAACCTGCTATCTGTCGCATACAAGAACGTGGTCGGAGCACGGCGGTCGGCATGGAGGGTCATCTCCAGCATCGGACAGAAGACGGAGGGAAGCGACAAGAAGCTCGCAATGGTCAACGAATACCGGGAGAAGGTGGAGGGCGAGCTGAGAGATATCTGCAACGATGTACTGGAACTGCTGAATAAATATTTAATTGAGAACTCCACAAATGCTGAAAGCAAAGTCTTCTATCTTAAGATGAAGGGCGACTACTATAGATACCTTGCCGAAGTCGCCTCTGGGGATGACAAAACAGCTACCATAGAACACTCTCAGGAGGCGTACCAGCAGGCATTTGACATCAGCAAGAAGGAGATGGACCCCACACATCCCATCCGCCTGGGCCTGGCCCTAAACTTCTCAGTCTTCTTCTACGAGATCCTCAACTCTCCAGAGAAAGCCTGCTCACTGGCCAAACAGGCATTTGATGATGCCATTGCAGAGCTGGACAAACTGAACGAGGAGTCCTACAAAGACAGCACTCTCATCATGCAGCTGCTCAGAGACAACCTGACATTATGGACATCCGACAACGCGCCTGAGGAAGGCGAGGCTGGAGAAGCCGGCGAAGCCGGAGAGAACGAGAACTgaaactcatctctctctcaaaaaaaaacCTTTTTACACATCTCCATTCCTGTATTGCTCCACTTAAAGTCTTTTAGCAATGAAACCCATTACTGAACAAAAGCTGCATGTGGAAATTCCAAAATAATTTGACTTTTCACGCTGCAGCTTTTGTGCaaataaaagaaagaaaaatattGATTGAGGGGGGGGTGAAACCTCCATTCCATGGTTTGTTTGTCCTGACCTTCCATACGTGCAGTTTCTCCTGTTAGAAAAGTATTAATAGCTTCTTTTTATCAATGTTTTAGTCCAAATTAGAGGAAGAAATAAGACATTCTAGGGCTTTTTGCTGAGCTACTGAATCTTAGTCCCATCAAAACACAAGGGGAGTTCAGATGTTAGAACAGGGGTGTTTGTTAAGCAAATTCAATGAATTGTTCCCTCACCCTCCATAGGCTTGTTCTCTATTTCTCCACATGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACATCCTCCACACGGTTATCTTGTATGGTTACCGCTGCCGACATCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCTTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACATCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTCATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACTGCTGCTGACGTCCTCCACACGGTTATCTTGTATGGTTACTGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTCATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGGTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTAGCTTATATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTAACTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGCGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGCGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCCACGCGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGCGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACATCCAATGTGAACAAGTGTAATTGTTCCTTGTTGCAGCGAGGGCCAGTCAATGAGCTGGCACCAAGTATCACAGCCAGGTGATTTCCATTGGTTCTGAAAATGTTTTTCCTCGCTCCCCCCTGGTTACAACATTCAcaataaagcatgtctggttgaaGAGAAGTGGGGGGCTTTCTGAAgaccaaaacaaaaataaatactcCTACATGCATGTAATTGAATAGTACACTGGAATGGGAACCAATGCGCTATACACACCATGTCCAAATGTCCAATTTAGTACTTTTCAATGCAGGTTTGTGCACGTGTTAATTAACAAGGGTGTTTGGTTAGTCCAGTGATTTGTCATTAGAGATTTGGACCACTATGTTTTTGCTAATCATCGATTGTAGTTCCCAAAAGCCTCGTGGAAATGTTAATGCCCTATGTTTCAGCTATGTAACATGAATAAAAATGAAATTTTATAAACC
>XM_021574701.2
TGTATAATATGTTGGTTCTAGGTTTTTGGTGGAATACTGCGCAGCATCCGCTACTCTCTATCGTTTAGCGCCATCTTCAAGTCCCTCTTGCATTCCTGGACTCCTATTGTTTTTAACCCGTCCGTGACGAATCAAGCTAAGGTTACACACTAAAGAATAAACAATGGATAAAGCGGAGCTTATTCAGAAGGCCAAGTTGGCGGAGCAAGCCGAGCGCTACGATGACATGGCCGCCTCGATGAAGGAGGTAACGGAACAGGGGGGCGAGCTGTCAAACGAGGAGAGGAACCTGCTATCTGTCGCATACAAGAACGTGGTCGGAGCACGGCGGTCGGCATGGAGGGTCATCTCCAGCATCGGACAGAAGACGGAGGGAAGCGACAAGAAGCTCGCAATGGTCAACGAATACCGGGAGAAGGTGGAGGGCGAGCTGAGAGATATCTGCAACGATGTACTGGAACTGCTGAATAAATATTTAATTGAGAACTCCACAAATGCTGAAAGCAAAGTCTTCTATCTTAAGATGAAGGGCGACTACTATAGATACCTTGCCGAAGTCGCCTCTGGGGATGACAAAACAGCTACCATAGAACACTCTCAGGAGGCGTACCAGCAGGCATTTGACATCAGCAAGAAGGAGATGGACCCCACACATCCCATCCGCCTGGGCCTGGCCCTAAACTTCTCAGTCTTCTTCTACGAGATCCTCAACTCTCCAGAGAAAGCCTGCTCACTGGCCAAACAGGCATTTGATGATGCCATTGCAGAGCTGGACAAACTGAACGAGGAGTCCTACAAAGACAGCACTCTCATCATGCAGCTGCTCAGAGACAACCTGACATTATGGACATCCGACAACGCGCCTGAGGAAGGCGAGGCTGGAGAAGCCGGCGAAGCCGGAGAGAACGAGAACTgaaactcatctctctctcaaaaaaaaacCTTTTTACACATCTCCATTCCTGTATTGCTCCACTTAAAGTCTTTTAGCAATGAAACCCATTACTGAACAAAAGCTGCATGTGGAAATTCCAAAATAATTTGACTTTTCACGCTGCAGCTTTTGTGCaaataaaagaaagaaaaatattGATTGAGGGGGGGGTGAAACCTCCATTCCATGGTTTGTTTGTCCTGACCTTCCATACGTGCAGTTTCTCCTGTTAGAAAAGTATTAATAGCTTCTTTTTATCAATGTTTTAGTCCAAATTAGAGGAAGAAATAAGACATTCTAGGGCTTTTTGCTGAGCTACTGAATCTTAGTCCCATCAAAACACAAGGGGAGTTCAGATGTTAGAACAGGGGTGTTTGTTAAGCAAATTCAATGAATTGTTCCCTCACCCTCCATAGGCTTGTTCTCTATTTCTCCACATGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACATCCTCCACACGGTTATCTTGTATGGTTACCGCTGCCGACATCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCTTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACATCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTCATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACTGCTGCTGACGTCCTCCACACGGTTATCTTGTATGGTTACTGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTCATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGGTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTAGCTTATATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCTACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTAACTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGCGGTTATCTTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGCGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACGTCCTCCACGCGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACGCGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGTGACGTCCTCCACACGGTTATCCTGTATGGTTACAGCTGCTGACATCCAATGTGAACAAGTGTAATTGTTCCTTGTTGCAGCGAGGGCCAGTCAATGAGCTGGCACCAAGTATCACAGCCAGGTGATTTCCATTGGTTCTGAAAATGTTTTTCCTCGCTCCCCCCTGGTTACAACATTCAcaataaagcatgtctggttgaaGAGAAGTGGGGGGCTTTCTGAAgaccaaaacaaaaataaatactcCTACATGCATGTAATTGAATAGTACACTGGAATGGGAACCAATGCGCTATACACACCATGTCCAAATGTCCAATTTAGTACTTTTCAATGCAGGTTTGTGCACGTGTTAATTAACAAGGGTGTTTGGTTAGTCCAGTGATTTGTCATTAGAGATTTGGACCACTATGTTTTTGCTAATCATCGATTGTAGTTCCCAAAAGCCTCGTGGAAATGTTAATGCCCTATGTTTCAGCTATGTAACATGAATAAAAATGAAATTTTATAAACC

Function

NR:

description
14-3-3 protein beta/alpha

GO:

id name namespace
GO:0055114 oxidation-reduction process biological_process
GO:0004497 monooxygenase activity molecular_function
GO:0019904 protein domain specific binding molecular_function

KEGG:

id description
K16197 YWHAB_Q_Z; 14-3-3 protein beta/theta/zeta

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021574699.2 False 3246 mRNA 0.47 6 53046245 53061764
XM_021574700.2 False 3244 mRNA 0.47 6 53046261 53061762
XM_021574701.2 True 3115 mRNA 0.47 6 53046997 53061762

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110498105 LOC106567684 coding upstream 210469 52795320 ~ 52835776 (+)
LOC110498100 LOC106568224 coding upstream 399353 52612596 ~ 52646892 (+)
LOC110498099 LOC106568712 coding upstream 446169 52584118 ~ 52600076 (+)
hnrnpua hnrnpu coding upstream 470133 52561723 ~ 52576154 (+)
LOC110498094 LOC106569575 coding upstream 896094 52118468 ~ 52150151 (+)
LOC110498110 LOC106566892 coding downstream 5053 53066817 ~ 53097965 (+)
LOC110498111 NA coding downstream 44917 53106681 ~ 53113452 (+)
LOC110498114 LOC106566507 coding downstream 197966 53259730 ~ 53342222 (+)
LOC110498117 LOC106566340 coding downstream 280709 53342473 ~ 53444115 (+)
LOC118941378 NA coding downstream 545569 53606967 ~ 53609550 (+)
G1637184 NA non-coding upstream 118513 52927353 ~ 52927732 (+)
G1637109 LOC106567335 non-coding upstream 203758 52840946 ~ 52842487 (+)
G1637105 NA non-coding upstream 256723 52789317 ~ 52789522 (+)
G1637098 NA non-coding upstream 267473 52778542 ~ 52778772 (+)
G1637075 NA non-coding upstream 287944 52756232 ~ 52758301 (+)
G1637290 NA non-coding downstream 52616 53114380 ~ 53175260 (+)
G1637293 NA non-coding downstream 54963 53116727 ~ 53119961 (+)
G1637627 NA non-coding downstream 191015 53252779 ~ 53253015 (+)
G1637631 NA non-coding downstream 193239 53255003 ~ 53255733 (+)
G1637178 NA other upstream 127767 52917337 ~ 52918478 (+)
G1637065 NA other upstream 290771 52750600 ~ 52755474 (+)
G1634948 NA other upstream 2435766 50607386 ~ 50610479 (+)
LOC110498078 LOC106572417 other upstream 2790993 50243497 ~ 50265945 (+)
G1637730 NA other downstream 368240 53430004 ~ 53430560 (+)
G1638710 NA other downstream 1113032 54174796 ~ 54175130 (+)
G1638780 NA other downstream 1178492 54240256 ~ 54240751 (+)
LOC110498128 LOC106610688 other downstream 1906593 54968308 ~ 54969856 (+)
LOC110498153 LOC106561476 other downstream 2865884 55927603 ~ 55932079 (+)

Expression


Co-expression Network