LOC118941500


Basic Information

Item Value
gene id LOC118941500
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 60402459 ~ 60405097 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036955226.1
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>XM_036955229.1
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Function

NR:

description
GATA zinc finger domain-containing protein 14-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036955226.1 False 2518 mRNA 0.37 2 60402459 60405096
XM_036955229.1 False 2344 mRNA 0.37 3 60402459 60405096
XM_036955228.1 True 2480 mRNA 0.37 3 60402459 60405097

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110498402 LOC106604468 coding upstream 10009 60382983 ~ 60392450 (+)
fndc4b LOC106604723 coding upstream 27162 60358048 ~ 60375297 (+)
LOC110498212 rp1l1 coding upstream 73848 60311459 ~ 60330337 (+)
LOC110498222 LOC106603387 coding upstream 379843 59996525 ~ 60022616 (+)
LOC110510484 LOC106607199 coding upstream 440742 59865592 ~ 59961717 (+)
chrna2a LOC103467111 coding downstream 57870 60462967 ~ 60475546 (+)
LOC110498236 LOC106603790 coding downstream 136858 60541955 ~ 60546243 (+)
LOC110498226 LOC106603826 coding downstream 151639 60556736 ~ 60569739 (+)
LOC100136771 pomc coding downstream 374844 60779941 ~ 60782510 (+)
LOC110498232 LOC106605409 coding downstream 444746 60849843 ~ 60866965 (+)
G1645344 NA non-coding upstream 2512 60399507 ~ 60399947 (+)
G1645335 NA non-coding upstream 31790 60370318 ~ 60370669 (+)
G1645311 NA non-coding upstream 46476 60354607 ~ 60355983 (+)
G1645308 NA non-coding upstream 63790 60338166 ~ 60338669 (+)
G1645346 NA non-coding downstream 4120 60409217 ~ 60409527 (+)
G1645348 NA non-coding downstream 8120 60413217 ~ 60414578 (+)
G1645352 NA non-coding downstream 25223 60430320 ~ 60430826 (+)
G1645316 LOC106603693 non-coding downstream 72871 60477968 ~ 60534329 (+)
G1645371 NA non-coding downstream 95159 60500256 ~ 60503922 (+)
plaat1l LOC106611413 other upstream 55 60398860 ~ 60402461 (+)
G1644651 NA other upstream 654114 59747984 ~ 59748345 (+)
G1644569 NA other upstream 793065 59608600 ~ 59609394 (+)
G1644280 NA other upstream 1205446 59196684 ~ 59197013 (+)
G1645443 NA other downstream 310836 60715933 ~ 60718611 (+)
G1645444 NA other downstream 313661 60718758 ~ 60738957 (+)
G1646089 NA other downstream 797261 61200860 ~ 61203352 (+)

Expression


Co-expression Network