G1586544


Basic Information

Item Value
gene id G1586544
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 6860930 ~ 6863350 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1816484
TCTTTGCCTTGGGAAAGCTGCTGTATTTAATCacataatgctgttgtggtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtgttcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgaTGCATTCAATCCCATAATGTtgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcccataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgtggtggtggttacctgggaagctgATGTATTTAATCCcataatgctgttacagtggttacctgggaagctgatgtattcaatcccataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgtggtggtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcccataatgctgttacagtggttacctgggaagctgatgtattcaatcacataatgctgtggtggtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaagctgATGTATTTAATCCcataatgctgttacagtggttacctgggaagctgatgtattcaatcccataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaagctgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaagctgatgtattcaatcacataatgctgtggtggtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcccataatgctgttacagtggttacctgggaagctgctgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaagctgATGTATTCAATCCCATAATGCTGTGgtggtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgtggtggtggttacctgggaaggtgatgtatttaatcccataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtatttaatcccataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtatTTAATCCCATAATGCTGTGgtggtggttacctgggaaggtgatgtatttaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtatTTAATCCCATAATGCTGTGgtggtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgtggtggtggttacctgggaaggtgatgtgttcaatcacataatgctgttacagtggttatctgggaagctgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaagctgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtatttaatcccataatgctgttacagtggttacctgggaagctgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttatctgggaaggtgatgtattcaatcacataatgctgttacagtggttacctgggaaggtgatgtatttaatcccataatgctgttacagtggttacctggtaagctgatgtattcaatcacataatgctgttgtggtggttacctgggaaggtgatgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1816484 True 2139 lncRNA 0.42 2 6860930 6863350

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118941432 NA coding upstream 566469 6292069 ~ 6294461 (+)
LOC118941431 NA coding upstream 572514 6286181 ~ 6288416 (+)
LOC110497332 LOC106610302 coding upstream 638628 6206293 ~ 6222302 (+)
LOC110497334 LOC106610305 coding upstream 708985 6122953 ~ 6151945 (+)
LOC110497328 hadh coding upstream 885166 5972346 ~ 5975764 (+)
sclt1 sclt1 coding downstream 697060 7560410 ~ 7575349 (+)
LOC110516931 dnah6 coding downstream 712132 7575482 ~ 7766837 (+)
LOC118941540 NA coding downstream 1174444 8037794 ~ 8043805 (+)
LOC110534596 LOC106596936 coding downstream 1194948 8058298 ~ 8065704 (+)
LOC110534593 LOC106610539 coding downstream 1208269 8071619 ~ 8136635 (+)
G1586528 NA non-coding upstream 11279 6846135 ~ 6849651 (+)
G1586442 NA non-coding upstream 62604 6797804 ~ 6798326 (+)
G1586436 NA non-coding upstream 74350 6786172 ~ 6786580 (+)
G1586435 NA non-coding upstream 76129 6784166 ~ 6784801 (+)
G1586412 NA non-coding upstream 132015 6728446 ~ 6728915 (+)
G1586547 NA non-coding downstream 4200 6867550 ~ 6867938 (+)
G1586551 NA non-coding downstream 8717 6872067 ~ 6872329 (+)
G1586558 NA non-coding downstream 15146 6878496 ~ 6878799 (+)
G1586575 NA non-coding downstream 28737 6892087 ~ 6892442 (+)
G1586590 NA non-coding downstream 44146 6907496 ~ 6907828 (+)
G1586200 NA other upstream 498618 6361848 ~ 6362312 (+)
G1585983 NA other upstream 690103 6169580 ~ 6170827 (+)
G1585804 NA other upstream 1048077 5808978 ~ 5812853 (+)
G1585483 NA other upstream 1145555 5643756 ~ 5715375 (+)
G1585375 NA other upstream 1411992 5448476 ~ 5448938 (+)
G1586672 NA other downstream 191495 7054845 ~ 7056469 (+)
G1587727 LOC106598223 other downstream 1876194 8739544 ~ 8844780 (+)
G1587790 LOC106610525 other downstream 2037636 8900986 ~ 8947363 (+)
G1587805 LOC106602251 other downstream 2130104 8993454 ~ 9063965 (+)
G1588177 LOC106610450 other downstream 2479509 9342859 ~ 9413146 (+)

Expression


Co-expression Network