G1596970 (LOC106609899)


Basic Information

Item Value
gene id G1596970
gene name LOC106609899
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 17494669 ~ 17530745 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1828650
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>TU1828651
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>TU1828656
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>TU1828655
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Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC108886169 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1828650 False 4072 TUCP 0.40 3 17494669 17499443
TU1828651 False 2112 TUCP 0.41 5 17494669 17499443
TU1828656 False 2221 TUCP 0.41 5 17494669 17499443
TU1828655 True 2311 lncRNA 0.41 3 17521221 17530745

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110497439 LOC105022884 coding downstream 2866 17510213 ~ 17518355 (-)
LOC118941460 NA coding downstream 12758 17506457 ~ 17508463 (-)
LOC110497437 LOC106602583 coding downstream 14808 17494676 ~ 17506413 (-)
LOC110497438 kdm2a coding downstream 26695 17475203 ~ 17494526 (-)
LOC110497432 LOC106609894 coding downstream 85010 17416966 ~ 17436211 (-)
LOC110497442 LOC106609865 coding upstream 2327 17533072 ~ 17537161 (-)
LOC110497443 LOC106609902 coding upstream 17048 17547793 ~ 17554950 (-)
LOC110498667 LOC106609920 coding upstream 48696 17579441 ~ 17600354 (-)
LOC110497445 LOC106602577 coding upstream 74327 17605072 ~ 17613102 (-)
LOC110497446 NA coding upstream 85152 17615897 ~ 17623476 (-)
G1596964 NA non-coding downstream 47455 17473164 ~ 17473766 (-)
G1596939 NA non-coding downstream 83726 17437259 ~ 17437495 (-)
G1596913 NA non-coding downstream 141855 17379102 ~ 17379366 (-)
G1596990 NA non-coding upstream 7249 17537994 ~ 17538519 (-)
G1596992 NA non-coding upstream 13309 17544054 ~ 17544296 (-)
G1597068 NA non-coding upstream 27437 17558182 ~ 17558424 (-)
G1597077 NA non-coding upstream 41626 17572371 ~ 17572669 (-)
G1596970 LOC106609899 other downstream 21778 17494669 ~ 17530745 (-)
G1596940 NA other downstream 83343 17437664 ~ 17437878 (-)
G1596879 NA other downstream 233204 17286530 ~ 17288017 (-)
G1596856 LOC106613263 other downstream 278198 17242606 ~ 17243023 (-)
LOC110498506 LOC106609878 other downstream 589771 16924529 ~ 16931521 (-)
G1598418 NA other upstream 1232970 18763715 ~ 18764422 (-)
G1599097 LOC106609944 other upstream 1678547 19209292 ~ 19209964 (-)
G1599197 NA other upstream 1841564 19372309 ~ 19381751 (-)
G1599717 NA other upstream 2024852 19555597 ~ 19557357 (-)
LOC110497430 LOC106602587 coding downstream 96501 17383975 ~ 17398168 (-)
LOC110497429 LOC106609892 coding downstream 115875 17369814 ~ 17378794 (-)
LOC110498555 LOC106609917 coding downstream 128364 17359938 ~ 17366305 (-)
LOC110497441 NA coding upstream 23495 17522938 ~ 17531665 (-)
LOC110498466 LOC106606466 other downstream 906502 16523595 ~ 16588239 (-)

Expression


Co-expression Network