G1602481


Basic Information

Item Value
gene id G1602481
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 21892040 ~ 21893363 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1834616
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>TU1834617
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>TU1834615
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>TU1834618
TAAGCTGTGTAGTGATGTAACATTGGCGTAAGATATTATGAATGTTCATGTCGTGCTTATAAAGTTTTCATGTGATGCTTATGCATGCGGTACAAAGTATTTCTGCATAACTTCTAAAGTTTGATTTTAATGGGCCAGTTTCATGGACCCAGATGAAGTTTATTCATGGGATCAGATGTTCCTTTGAATAGGCTTAGTCTGGGTATGTGAACCCAGCCTGTACTAAACCGTATTGTTTAAGCTTAATGTCAAGGTTCTGTCTATGCTCTTATCACGAATGCTTACATCTACACAACCCAAAATATTGAATTGAACTGACTTTATTGTAATACATTCCAAATTGACGAAACGTACACGTGGAGAATCCTGTTTGCTCAGATTGAAAAGTGTTTTATGGAGTTCTGCACATGTACATTTACAAGCGCCATATGAACAGTGACCAGTAGCATGTGTATAACTTGCAGTGTTTCACAGTGATAACAGTAACACAGGGCTTACCAATTTAAGACTTGTAATCATAAATCAATC
>TU1834620
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Function

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1834616 False 960 lncRNA 0.38 1 21892040 21892999
TU1834617 False 663 lncRNA 0.37 1 21892040 21892702
TU1834615 False 1189 lncRNA 0.36 1 21892175 21893363
TU1834618 False 528 lncRNA 0.37 1 21892175 21892702
TU1834620 True 743 lncRNA 0.38 1 21892175 21892917

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110497512 LOC106610027 coding downstream 71234 21799255 ~ 21820806 (-)
LOC110497514 LOC106610028 coding downstream 101478 21763166 ~ 21790562 (-)
LOC110497516 LOC106609982 coding downstream 763516 21124027 ~ 21128524 (-)
adra1b adra1b coding downstream 1451116 20420056 ~ 20440924 (-)
LOC110497518 LOC106609978 coding downstream 1617059 20203350 ~ 20274981 (-)
LOC110497511 tacr3 coding upstream 2854 21894972 ~ 21934646 (-)
LOC110498676 NA coding upstream 105885 21999248 ~ 22001354 (-)
LOC110497508 LOC106610024 coding upstream 114960 22008323 ~ 22121011 (-)
LOC110497506 mnd1 coding upstream 230061 22122397 ~ 22169711 (-)
LOC110498675 LOC106610021 coding upstream 262517 22155880 ~ 22186787 (-)
G1602475 NA non-coding downstream 12575 21875098 ~ 21879465 (-)
G1602476 NA non-coding downstream 15701 21875865 ~ 21876339 (-)
G1602468 NA non-coding downstream 22551 21869235 ~ 21869489 (-)
G1602467 NA non-coding downstream 23309 21868494 ~ 21868731 (-)
G1602464 NA non-coding downstream 25996 21865755 ~ 21866044 (-)
G1602490 NA non-coding upstream 21094 21914457 ~ 21914676 (-)
G1602497 NA non-coding upstream 31066 21924429 ~ 21924723 (-)
G1602504 NA non-coding upstream 38420 21931783 ~ 21931984 (-)
G1602556 NA non-coding upstream 111191 22004554 ~ 22005007 (-)
G1600030 NA other downstream 1755479 20127211 ~ 20136561 (-)
G1600014 LOC106609977 other downstream 1783249 20107915 ~ 20108791 (-)
G1599758 LOC106609957 other downstream 2250037 19638760 ~ 19642003 (-)
G1599760 LOC106609957 other downstream 2255013 19636018 ~ 19637027 (-)
G1599717 NA other downstream 2334683 19555597 ~ 19557357 (-)
G1602753 NA other upstream 510153 22403516 ~ 22403837 (-)
G1602763 NA other upstream 522055 22415418 ~ 22416043 (-)
LOC110497482 LOC106610017 other upstream 1248453 23121508 ~ 23168994 (-)
G1604902 NA other upstream 2080427 23973790 ~ 23974106 (-)
gpr137c LOC106602981 other upstream 2297335 24176332 ~ 24206622 (-)

Expression


Co-expression Network