G1628486


Basic Information

Item Value
gene id G1628486
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 44683362 ~ 44748925 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1863373
gtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccatgtgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtatttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccacatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccacatgtgtttgTATAtttccacgtgtgtttgtatatgtccacatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtttatgtccacgtgtgtgcttgtatatgtccatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtaaatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtaaatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtttatgtccacgtgtgtgtttgcatatgtccatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgttggtatatgtccatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccatgtgtgtttgtatatgtccatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccaagtgtgtttgtatatgtccatgtgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatttttccatgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtttgtatatgtccacgtgtgtgtttgtatatatacacatgtgtgtttgtatatgtccatgtg

Function

NR:

description
adhesive plaque matrix protein-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1863373 True 1083 TUCP 0.39 3 44683362 44748925

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110497958 eif2ak4 coding upstream 123489 44537506 ~ 44559873 (+)
LOC110497955 LOC106586878 coding upstream 181610 44440142 ~ 44501752 (+)
LOC118941479 LOC106586952 coding upstream 253117 44410249 ~ 44430245 (+)
zgc:194887 LOC106587488 coding upstream 515958 44164032 ~ 44167404 (+)
LOC110497948 NA coding upstream 736688 43944625 ~ 43946674 (+)
cyp1c1 cyp1c1 coding downstream 237747 44986672 ~ 44988391 (+)
cyp1c2 cyp1c2 coding downstream 242543 44991468 ~ 44993957 (+)
LOC110497964 LOC106583112 coding downstream 302235 45051160 ~ 45053552 (+)
LOC110497963 LOC106583053 coding downstream 315312 45064237 ~ 45068205 (+)
LOC110497966 LOC106582786 coding downstream 380090 45129015 ~ 45147200 (+)
G1628431 NA non-coding upstream 68529 44614533 ~ 44614833 (+)
G1628425 NA non-coding upstream 73132 44609994 ~ 44610230 (+)
G1628316 NA non-coding upstream 97174 44530536 ~ 44586188 (+)
G1628129 NA non-coding upstream 158198 44524760 ~ 44525164 (+)
G1628126 NA non-coding upstream 167398 44515446 ~ 44515964 (+)
G1628528 NA non-coding downstream 51467 44800392 ~ 44800701 (+)
G1628532 NA non-coding downstream 55190 44804115 ~ 44804422 (+)
G1628537 NA non-coding downstream 59434 44808359 ~ 44819394 (+)
G1628546 NA non-coding downstream 77097 44826022 ~ 44826338 (+)
G1628708 NA non-coding downstream 152101 44901026 ~ 44901232 (+)
G1628073 LOC106610840 other upstream 234690 44414322 ~ 44448672 (+)
G1627319 NA other upstream 866861 43814593 ~ 43816501 (+)
LOC110497931 LOC106589425 other upstream 1276235 43279273 ~ 43440028 (+)
G1625710 NA other upstream 2431791 42250731 ~ 42251571 (+)
G1624524 NA other upstream 2646244 42036328 ~ 42037118 (+)
G1628550 NA other downstream 80997 44829922 ~ 44886234 (+)
G1628689 NA other downstream 137946 44886871 ~ 44887173 (+)
G1628865 LOC105030512 other downstream 438037 45186962 ~ 45194241 (+)
LOC110497977 LOC106582390 other downstream 549574 45298446 ~ 45301424 (+)

Expression


Co-expression Network