G1636460



Basic Information


Item Value
gene id G1636460
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 52323997 ~ 52329189 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU1872197
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>TU1872198
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>TU1872200
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Function


NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1872197 False 4236 lncRNA 0.41 2 52323997 52328732
TU1872198 False 4716 lncRNA 0.42 3 52323997 52329189
TU1872200 True 3596 lncRNA 0.41 2 52323997 52328732

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110498094 LOC106569575 coding upstream 173846 52118468 ~ 52150151 (+)
tfb2m tfb2m coding upstream 205826 52107642 ~ 52118171 (+)
LOC110498384 LOC106570052 coding upstream 288111 52004125 ~ 52035886 (+)
LOC110498383 LOC106570236 coding upstream 331450 51942392 ~ 51992547 (+)
LOC110498087 LOC106571300 coding upstream 1643023 50659972 ~ 50680974 (+)
hnrnpua hnrnpu coding downstream 232534 52561723 ~ 52576154 (+)
LOC110498099 LOC106568712 coding downstream 254929 52584118 ~ 52600076 (+)
LOC110498100 LOC106568224 coding downstream 283407 52612596 ~ 52646892 (+)
LOC110498105 LOC106567684 coding downstream 466131 52795320 ~ 52835776 (+)
LOC110498109 1433b coding downstream 717056 53046245 ~ 53061764 (+)
G1636442 NA non-coding upstream 32204 52288911 ~ 52291793 (+)
G1636396 NA non-coding upstream 167986 52155291 ~ 52156011 (+)
G1636390 NA non-coding upstream 177452 52144722 ~ 52146545 (+)
G1636327 NA non-coding upstream 222269 52099568 ~ 52101728 (+)
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G1634948 NA other upstream 1713518 50607386 ~ 50610479 (+)
LOC110498078 LOC106572417 other upstream 2068745 50243497 ~ 50265945 (+)
LOC110498072 NA other upstream 2156611 50163645 ~ 50168749 (+)
zgc:193593 NA other upstream 3145595 49160705 ~ 49178402 (+)
G1632650 arhgef10 other upstream 3623429 48699057 ~ 48700568 (+)
G1637065 NA other downstream 421411 52750600 ~ 52755474 (+)
G1637178 NA other downstream 588148 52917337 ~ 52918478 (+)
G1637730 NA other downstream 1100815 53430004 ~ 53430560 (+)
G1638710 NA other downstream 1845607 54174796 ~ 54175130 (+)

Expression



Co-expression Network